Домен суши - Википедия - Sushi domain
| Суши-домен (SCR / CCP) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | Суши | ||||||||||
| Pfam | PF00084 | ||||||||||
| ИнтерПро | IPR000436 | ||||||||||
| CATH | 1g4g | ||||||||||
| SCOP2 | 1hfi / Объем / СУПФАМ | ||||||||||
| CDD | cd00033 | ||||||||||
| |||||||||||
Суши-домен это эволюционно сохраненный белковый домен. Он также известен как Белок контроля комплемента (CCP) модули или короткие консенсусные повторы (SCR). Название происходит от визуального сходства домена с нигири суши когда первичная структура нарисован, показывая петли, созданные дисульфид облигации.[1]
Суши-домены существуют в большом количестве белков комплемента и адгезии. Структура известна для этого домена; он основан на бета-бутерброд аранжировка - одно лицо из трех β-тяжи водородная связь для образования трехцепочечной области в ее центре, а другая сторона образована двумя отдельными β-нитями.[2]
CD21 (также называемый рецептором C3d, CR2, вирус Эпштейна-Барра рецептор или EBV-R) является рецептором для EBV, а также для C3d, C3dg и iC3b. Компоненты дополнения могут активироваться В-клетки через CD21. CD21 является частью большого комплекса передачи сигнала, который также включает CD19, CD81 и Leu13.
Некоторые из белков этой группы отвечают за молекулярную основу антигенов группы крови, поверхностные маркеры на внешней стороне мембраны эритроцитов. Большинство этих маркеров представляют собой белки, но некоторые из них представляют собой углеводы, присоединенные к липидам или белкам.[3] Фактор ускорения распада комплемента (антиген CD55) относится к системе группы крови Кромера и связан с Cr (a), Dr (a), Es (a), Tc (a / b / c), Wd (a), WES. (а / б), антигены IFC и UMC. Рецептор комплемента 1 типа (рецептор C3b / C4b) (антиген CD35) относится к системе группы крови Knops и связан с антигенами Kn (a / b), McC (a), Sl (a) и Yk (a).
Подсемейства
Примеры
Гены человека, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают:
- AGC1, APOH,
- BCAN, BF,
- C1R, C1S, C2, C4BPA, C4BPB, C6, C7, CD46, CD55, CFB, CFH, CFHR1, CFHR2, CFHR3, CFHR4, CFHR5, CR1, CR1L, CR2, CSMD1, CSMD2, CSMD3, CSPG3,
- DAF,
- F13B, FHR4, GABBR1,
- HP,
- IL2RA,
- KIAA0247,
- MASP1, MASP2,
- ПАППА, PAPPA2, пск-3,
- RAMP,
- SEL-OB, SELE, ПРОДАВАТЬ, SELP, ОЭЗ6, SEZ6L, SEZ6L2, SNED1, SRPX, SRPX2, SUSD1, SUSD2, SUSD4, SVEP1, SEZ6L2,
- ТАОК1, TPO, VCAN
Рекомендации
- ^ Ичиносе, Акитада; Bottenus, Ralph E .; Дэви, Эрл В. «Структура трансглутаминаз». Журнал биологической химии. 265: 13411–13414. PMID 1974250.
- ^ Кэмпбелл И.Д., Барон М., Дэй А.Дж., Сим РБ, Норман Д.Г., Барлоу П.Н. (1991). «Трехмерная структура белкового модуля контроля комплемента в растворе». J. Mol. Биол. 219 (4): 717–725. Дои:10.1016 / 0022-2836 (91) 90666-Т. PMID 1829116.
- ^ Ломас-Фрэнсис, Кристина; Рид, Мэрион Э. (2004). Антиген группы крови: справочник. Бостон: Academic Press. ISBN 0-12-586585-6.