TADA2L - TADA2L

TADA2A
Белок TADA2L PDB 1x41.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTADA2A, ADA2, ADA2A, TADA2L, hADA2, KL04P, транскрипционный адаптер 2A
Внешние идентификаторыOMIM: 602276 MGI: 2144471 ГомолоГен: 38834 Генные карты: TADA2A
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение TADA2A
Геномное расположение TADA2A
Группа17q12Начните37,406,886 бп[1]
Конец37,479,725 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TADA2L 209938 в формате fs.png

PBB GE TADA2L 210537 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001166105
NM_001291918
NM_001488
NM_133439

NM_172562

RefSeq (белок)

NP_001159577
NP_001278847
NP_001479
NP_597683

NP_766150

Расположение (UCSC)Chr 17: 37.41 - 37.48 МбChr 11: 84.08 - 84.13 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Транскрипционный адаптер 2-альфа это белок что у людей кодируется TADA2A ген.[5][6]

Функция

Многие ДНК-связывающие белки-активаторы транскрипции увеличивают скорость инициации транскрипции гена, опосредованной РНК-полимеразой II, за счет функционального взаимодействия с общим аппаратом транскрипции, связанным с базальным промотором. Адаптерные белки обычно требуются для этой активации, возможно, для ацетилирования и дестабилизации нуклеосом, тем самым снимая ограничения хроматина на промоторе. Белок, кодируемый этим геном, является адаптером активатора транскрипции и, как было установлено, является частью гистонацетилазного комплекса PCAF. Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[6]

Взаимодействия

TADA2L был показан взаимодействовать с GCN5L2,[7][8] TADA3L[9][10] и Мой с.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ENSG00000277104 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000276234, ENSG00000277104 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018651 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Кандау Р., Мур П.А., Ван Л., Барлев Н., Ин С.Ю., Розен Калифорния, Бергер С.Л. (февраль 1996 г.). «Идентификация белков человека, функционально консервативных с помощью предполагаемых дрожжевых адаптеров ADA2 и GCN5». Молекулярная и клеточная биология. 16 (2): 593–602. Дои:10.1128 / mcb.16.2.593. ЧВК  231038. PMID  8552087.
  6. ^ а б «Ген Entrez: транскрипционный адаптер 2 TADA2L (гомолог ADA2, дрожжевой) -подобный».
  7. ^ Барлев Н.А., Полторацкий В., Оуэн-Хьюз Т., Ин Си, Лю Л., Уоркман Дж. Л., Бергер С.Л. (март 1998 г.). «Подавление активности гистонацетилтрансферазы GCN5 через связывание бромодомена и фосфорилирование Ku-ДНК-зависимым протеинкиназным комплексом». Молекулярная и клеточная биология. 18 (3): 1349–58. Дои:10.1128 / mcb.18.3.1349. ЧВК  108848. PMID  9488450.
  8. ^ Ван Л., Миззен С., Инь С., Кандау Р., Барлев Н., Браунелл Дж., Аллис С.Д., Бергер С.Л. (январь 1997 г.). «Активность гистонацетилтрансферазы сохраняется между дрожжевым и человеческим GCN5 и необходима для комплементации роста и активации транскрипции». Молекулярная и клеточная биология. 17 (1): 519–27. Дои:10.1128 / mcb.17.1.519. ЧВК  231776. PMID  8972232.
  9. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  10. ^ Ван Т., Кобаяши Т., Такимото Р., Денес А.Э., Снайдер Е.Л., эль-Дейри В.С., Брахманн Р.К. (ноябрь 2001 г.). «hADA3 необходим для активности p53». Журнал EMBO. 20 (22): 6404–13. Дои:10.1093 / emboj / 20.22.6404. ЧВК  125723. PMID  11707411.
  11. ^ Лю X, Tesfai J, Evrard YA, Dent SY, Martinez E (май 2003 г.). «Трансформационный домен c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции». Журнал биологической химии. 278 (22): 20405–12. Дои:10.1074 / jbc.M211795200. ЧВК  4031917. PMID  12660246.

дальнейшее чтение