TCEA2 - TCEA2

TCEA2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2LW4
Идентификаторы
Псевдонимы	TCEA2, TFIIS, фактор элонгации транскрипции A2
Внешние идентификаторы	OMIM: 604784 MGI: 107368 ГомолоГен: 68304 Генные карты: TCEA2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 20 (человек)
Конец	64,072,347 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	181,688,071 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • связывание ионов цинка; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание ионов металлов; • связывание нуклеиновой кислоты; • активность фактора удлинения трансляции;
Сотовый компонент	• комплекс факторов элонгации транскрипции; • ядро клетки;
Биологический процесс	• ДНК-шаблонная транскрипция, элонгация; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • транскрипция, ДНК-шаблон; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • регуляция ДНК-шаблонной транскрипции, элонгации; • поступательное удлинение;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6919
	21400
	ENSG00000171703
	ENSMUSG00000059540
	Q15560; Q6IB64
	Q9QVN7
	NM_003195; NM_198723
	NM_009326; NM_001356342; NM_001356343
	NP_003186; NP_942016; NP_003186.1
	NP_033352; NP_001343271; NP_001343272
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор элонгации транскрипции А белок 2 это белок что у людей кодируется TCEA2 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, находится в ядре, где он функционирует как фактор элонгации транскрипции класса SII. Факторы элонгации этого класса ответственны за высвобождение тройных комплексов РНК-полимеразы II из ареста транскрипции в сайтах остановки, кодируемых матрицей. Было показано, что кодируемый белок взаимодействует с общим фактором транскрипции IIB, основным фактором транскрипции. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[7]

Взаимодействия

TCEA2 был показан взаимодействовать с MAGEA11.^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171703 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059540 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Уивер З.А., Кейн С.М. (декабрь 1997 г.). «Геномная характеристика тестикоспецифического гена TFIIS (TCEA2)». Геномика. 46 (3): 516–9. Дои:10.1006 / geno.1997.5073. PMID 9441762.
^ Умехара Т., Кида С., Ямамото Т., Хорикоши М. (декабрь 1995 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей новый тип фактора элонгации транскрипции человека S-II». Ген. 167 (1–2): 297–302. Дои:10.1016/0378-1119(95)00634-6. PMID 8566795.
^ ^а ^б «Ген Entrez: фактор элонгации транскрипции TCEA2 (SII), 2».
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

дальнейшее чтение

Като Х., Сумимото Х., Погнонек П., Чен СН, Розен, Калифорния, Рёдер Р.Г. (апрель 1992 г.). «ВИЧ-1 Tat действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточного удлинения». Гены и развитие. 6 (4): 655–66. Дои:10.1101 / gad.6.4.655. PMID 1559613.
Ли XY, Грин М.Р. (октябрь 1998 г.). «Клеточный коактиватор Tat ВИЧ-1 Tat-SF1 представляет собой общий фактор элонгации транскрипции». Гены и развитие. 12 (19): 2992–6. Дои:10.1101 / gad.12.19.2992. ЧВК 317190. PMID 9765201.
Trembley JH, Hu D, Hsu LC, Yeung CY, Slaughter C, Lahti JM, Kidd VJ (январь 2002 г.). «Протеинкиназы PITSLRE p110 связываются с комплексами транскрипции и влияют на их активность». Журнал биологической химии. 277 (4): 2589–96. Дои:10.1074 / jbc.M109755200. PMID 11709559.
Sijbrandi R, Fiedler U, Timmers HT (июнь 2002 г.). «Комплексы РНК-полимеразы II на очень ранней стадии транскрипции не подвержены экзонуклеолитическому расщеплению, индуцированному TFIIS». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (11): 2290–8. Дои:10.1093 / nar / 30.11.2290. ЧВК 117193. PMID 12034815.
Сасо К., Ито Т., Натори С., Секимидзу К. (апрель 2003 г.). «Идентификация нового тканеспецифического активатора транскрипции FESTA как белка, который взаимодействует с фактором элонгации транскрипции S-II». Журнал биохимии. 133 (4): 493–500. Дои:10.1093 / jb / mvg065. PMID 12761297.
Тамура К., Мията К., Сугахара К., Ониши С., Шуин Т., Асо Т. (сентябрь 2003 г.). «Идентификация EloA-BP1, нового связывающего элонгина А белка с доменом гомологии экзонуклеазы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 309 (1): 189–95. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01556-0. PMID 12943681.
Наката А., Ито Т., Нагата М., Хори С., Секимидзу К. (ноябрь 2004 г.). «GRIP1tau, новый активатор транскрипции, содержащий домен PDZ, взаимодействует со специфическим для семенников фактором элонгации транскрипции SII-T1». Гены в клетки. 9 (11): 1125–35. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2004.00795.x. PMID 15507123. S2CID 23334030.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Палангат М., Реннер Д.Б., Прайс Д.Х., Ландик Р. (октябрь 2005 г.). «Отрицательный фактор элонгации для РНК-полимеразы II человека ингибирует фактор расщепления транскрипта против ареста TFIIS». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (42): 15036–41. Дои:10.1073 / pnas.0409405102. ЧВК 1257689. PMID 16214896.
Кураока И., Сузуки К., Ито С., Хаяшида М., Квей Дж. С., Икегами Т., Ханда Х., Накабеппу Ю., Танака К. (июнь 2007 г.). «РНК-полимераза II обходит 8-оксогуанин в присутствии фактора элонгации транскрипции TFIIS». Ремонт ДНК. 6 (6): 841–51. Дои:10.1016 / j.dnarep.2007.01.014. PMID 17374514.

Эта статья о ген на хромосома человека 20 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171703 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059540 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9441762-5] Уивер З.А., Кейн С.М. (декабрь 1997 г.). «Геномная характеристика тестикоспецифического гена TFIIS (TCEA2)». Геномика. 46 (3): 516–9. Дои:10.1006 / geno.1997.5073. PMID 9441762.

[pmid8566795-6] Умехара Т., Кида С., Ямамото Т., Хорикоши М. (декабрь 1995 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей новый тип фактора элонгации транскрипции человека S-II». Ген. 167 (1–2): 297–302. Дои:10.1016/0378-1119(95)00634-6. PMID 8566795.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: фактор элонгации транскрипции TCEA2 (SII), 2».

[pmid16189514-8] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]