TNIP1 - TNIP1

TNIP1
Идентификаторы
ПсевдонимыTNIP1, ABIN-1, NAF1, VAN, nip40-1, TNFAIP3 взаимодействующий белок 1
Внешние идентификаторыOMIM: 607714 MGI: 1926194 ГомолоГен: 31355 Генные карты: TNIP1
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение TNIP1
Геномное расположение TNIP1
Группа5q33.1Начните151,029,945 бп[1]
Конец151,093,577 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TNIP1 207196 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001199275
NM_001199276
NM_001271455
NM_001271456
NM_021327

RefSeq (белок)

NP_001186204
NP_001186205
NP_001258384
NP_001258385
NP_067302

Расположение (UCSC)Chr 5: 151.03 - 151.09 МбChr 11: 54.91 - 54.96 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

TNFAIP3-взаимодействующий белок 1 это белок что у людей кодируется TNIP1 ген.[5][6][7]

Связь с аутоиммунными заболеваниями

Генетические вариации в регионе TNIP1 было показано, что ген имеет ассоциация с несколькими аутоиммунные заболевания:

Взаимодействия

TNIP1 содержит несколько аминокислота сайты, которые фосфорилированный и убиквитинированный,[13] и было показано взаимодействовать с участием TNFAIP3,[14] MAP3K1,[15] и MAPK1.[16]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145901 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020400 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Фукуши М., Диксон Дж., Кимура Т., Цурутани Н., Диксон М.Дж., Ямамото Н. (январь 1999 г.). «Идентификация и клонирование нового клеточного белка Naf1, Nef-ассоциированного фактора 1, который увеличивает экспрессию CD4 на клеточной поверхности». Письма FEBS. 442 (1): 83–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 01631-7. PMID  9923610. S2CID  86298611.
  6. ^ Гупта К., Отт Д., Хоуп Т.Дж., Силичиано Р.Ф., Боке Д.Д. (декабрь 2000 г.). «Белок ядерного челночного транспорта человека, который взаимодействует с матрицей вируса иммунодефицита человека типа 1, упакован в вирионы». Журнал вирусологии. 74 (24): 11811–24. Дои:10.1128 / JVI.74.24.11811-11824.2000. ЧВК  112464. PMID  11090181.
  7. ^ «Ген Entrez: TNIP1 TNFAIP3 взаимодействующий белок 1».
  8. ^ Allanore Y, Saad M, Dieudé P, Avouac J, Distler JH, Amouyel P и др. (Июль 2011 г.). «Полногеномное сканирование определяет TNIP1, PSORS1C1 и RHOB как новые локусы риска для системного склероза». PLOS Genetics. 7 (7): e1002091. Дои:10.1371 / journal.pgen.1002091. ЧВК  3131285. PMID  21750679.
  9. ^ Наир Р.П., Даффин К.С., Хелмс С., Динг Дж., Стюарт П.Е., Голдгар Д. и др. (Февраль 2009 г.). «Полногеномное сканирование выявляет связь псориаза с путями IL-23 и NF-kappaB». Природа Генетика. 41 (2): 199–204. Дои:10,1038 / нг.311. ЧВК  2745122. PMID  19169254.
  10. ^ Bowes J, Orozco G, Flynn E, Ho P, Brier R, Marzo-Ortega H, et al. (Сентябрь 2011 г.). «Подтверждение TNIP1 и IL23A в качестве локусов восприимчивости к псориатическому артриту». Анналы ревматических болезней. 70 (9): 1641–4. Дои:10.1136 / ard.2011.150102. ЧВК  3147229. PMID  21623003.
  11. ^ Gateva V, Sandling JK, Hom G, Taylor KE, Chung SA, Sun X и др. (Ноябрь 2009 г.). «Крупномасштабное исследование репликации идентифицирует TNIP1, PRDM1, JAZF1, UHRF1BP1 и IL10 как локусы риска системной красной волчанки». Природа Генетика. 41 (11): 1228–33. Дои:10,1038 / нг.468. ЧВК  2925843. PMID  19838195.
  12. ^ Хан Дж. У., Чжэн Х. Ф., Цуй Й, Сан ЛД, Е ДК, Ху З. и др. (Ноябрь 2009 г.). «Полногеномное ассоциативное исследование китайской ханьской популяции выявило девять новых локусов восприимчивости к системной красной волчанке». Природа Генетика. 41 (11): 1234–7. Дои:10,1038 / нг.472. PMID  19838193. S2CID  205356205.
  13. ^ «TNIP1 (человек)». www.phosphosite.org. Получено 2020-10-31.
  14. ^ Хайнинк К., Де Валк Д., Ванден Берге В., Ван Крикинг В., Контрерас Р., Фирс В., Хегеман Г., Бейярт Р. (июнь 1999 г.). «Белок цинкового пальца А20 ингибирует TNF-индуцированную экспрессию NF-kappaB-зависимого гена путем вмешательства в сигнал трансактивации, опосредованный RIP или TRAF2, и напрямую связывается с новым ингибирующим NF-kappaB белком ABIN». Журнал клеточной биологии. 145 (7): 1471–82. Дои:10.1083 / jcb.145.7.1471. ЧВК  2133159. PMID  10385526.
  15. ^ Чарлафтис, Николаос; Суддасон, Теша; У, Сюэфэн; Анвар, Саба; Карин, Майкл; Галлахер, Юэн (2014-11-03). «PHD MEKK1 убиквитинирует TAB1 для активации MAPK в ответ на цитокины». Журнал EMBO. 33 (21): 2581–2596. Дои:10.15252 / embj.201488351. ISSN  1460-2075. ЧВК  4282369. PMID  25260751.
  16. ^ Чжан С., Фукуси М., Хашимото С., Гао С., Хуанг Л., Фукуё Ю., Накадзима Т., Амагаса Т., Эномото С., Койке К., Миура О, Ямамото Н., Цучида Н. (сентябрь 2002 г.). «Новый связывающий ERK2 белок, Naf1, ослабляет ядерную передачу сигналов EGF / ERK2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 297 (1): 17–23. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02086-7. PMID  12220502.

дальнейшее чтение

внешние ссылки