ТОПОРЫ - TOPORS

ТОПОРЫ
Идентификаторы
Псевдонимы	ТОПОРЫ, LUN, P53BP3, RP31, TP53BPL, TOP1, связывающий богатый аргинином / серином белок, TOP1, связывающий богатый аргинином / серином белок, убиквитинлигаза E3
Внешние идентификаторы	OMIM: 609507 MGI: 2146189 ГомолоГен: 4237 Генные карты: ТОПОРЫ
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 9 (человек)
Конец	32,552,586 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 4 (мышь)
Конец	40,269,850 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание антигена; • Связывание ДНК; • SUMO трансферазная активность; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы; • связывание ионов металлов; • активность убиквитин-протеинтрансферазы; • Связывание ДНК-топоизомеразы; • GO: 0001948 связывание с белками; • трансферазная активность;
Сотовый компонент	• цилиарное базальное тело; • Тело PML; • ядерное пятнышко; • полюс шпинделя; • убиквитинлигазный комплекс; • гамма-тубулин комплекс; • фоторецептор, соединяющий реснички; • середина тела; • цитоплазматический динеиновый комплекс; • центриоль; • ядро клетки; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на повреждение ДНК медиатором класса p53; • формирование слоя сетчатки; • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • полиубиквитинирование белков; • отрицательная регуляция апоптотического процесса; • развитие клеток колбочек сетчатки; • моноубиквитинирование белков; • организация внешнего сегмента фоторецепторной клетки; • белковое сумоилирование; • транскрипция, ДНК-шаблон; • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • убиквитинирование, связанное с белком K48; • регулирование пролиферации клеток; • положительная регуляция активности убиквитин-протеинтрансферазы; • развитие стержневых клеток сетчатки; • внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на повреждение ДНК; • локализация белка в ядре; • поддержание местоположения белка в ядре; • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10210
	106021
	ENSG00000197579
	ENSMUSG00000036822
	Q9NS56
	Q80Z37
	NM_005802; NM_001195622
	NM_134097
	NP_001182551; NP_005793
	NP_598858
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза Topors является фермент что у людей кодируется ТОПОРЫ ген.^[5]^[6]^[7]^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197579 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036822 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Халуска П. младший, Салим А., Рашид З., Ахмед Ф., Су Е. В., Лю Л. Ф., Рубин Е. Х. (июль 1999 г.). «Взаимодействие между человеческой топоизомеразой I и новым белком RING finger / аргинин-серин». Нуклеиновые кислоты Res. 27 (12): 2538–44. Дои:10.1093 / nar / 27.12.2538. ЧВК 148458. PMID 10352183.
^ Рашид З.А., Салим А., Рэйви Ю., Пандольфи П.П., Рубин Э.Х. (июнь 2002 г.). «Связывающий топоизомеразу I белок RING, topors, связан с ядерными тельцами промиелоцитарного лейкоза». Exp Cell Res. 277 (2): 152–60. Дои:10.1006 / excr.2002.5550. PMID 12083797.
^ Chakarova CF, Papaioannou MG, Khanna H, Lopez I, Waseem N, Shah A, Theis T., Friedman J, Maubaret C, Bujakowska K, Veraitch B, Abd El-Aziz MM, Prescott de Q, Parapuram SK, Bickmore WA, Munro П.М., Гал А., Хамель С.П., Мариго В., Понтинг С.П., Виссинджер Б., Зреннер Э., Материя К, Сваруп А., Коенекоп Р.К., Бхаттачарья С.С. (октябрь 2007 г.). «Мутации в TOPORS вызывают аутосомно-доминантный пигментный ретинит с периваскулярной атрофией пигментного эпителия сетчатки». Am J Hum Genet. 81 (5): 1098–103. Дои:10.1086/521953. ЧВК 2265653. PMID 17924349.
^ «Ген Entrez: связывание топоизомеразы I TOPORS, богатое аргинином / серином».

дальнейшее чтение

Чжоу Р., Вэнь Х, Ао С.З. (1999). «Идентификация нового гена, кодирующего связанный с р53 белок». Ген. 235 (1–2): 93–101. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00203-6. PMID 10415337.
Соуто-Карнейро М.М., Кренн В., Германн Р. и др. (2001). «Гены IgVH из разных анатомических областей, с различными гистопатологическими паттернами, у пациента с ревматоидным артритом предполагают циклическое повторное включение зрелых синовиальных B-клеток в процесс гипермутации». Артрит Res. 2 (4): 303–14. Дои:10.1186 / ar105. ЧВК 17813. PMID 11056671.
Чу Д., Какадзу Н., Горрин-Ривас М.Дж. и др. (2001). «Клонирование и характеристика LUN, нового белка безымянного пальца, который высоко экспрессируется в легких и специфически связывается с палиндромной последовательностью» (PDF). J. Biol. Chem. 276 (17): 14004–13. Дои:10.1074 / jbc.M010262200. PMID 11278651. S2CID 20734219.
Вегер С., Хаммер Э, Хейльбронн Р. (2002). «Topors, белок, связывающий p53 и топоизомеразу I, взаимодействует с белками Rep78 / 68 аденоассоциированного вируса (AAV-2) и усиливает экспрессию гена AAV-2». J. Gen. Virol. 83 (Пт 3): 511–6. Дои:10.1099/0022-1317-83-3-511. PMID 11842245.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Имабаяси Х., Мори Т., Годзё С. и др. (2003). «Повторная дифференцировка дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека посредством образования хондросфер с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Exp. Cell Res. 288 (1): 35–50. Дои:10.1016 / S0014-4827 (03) 00130-7. PMID 12878157.
Вегер С, Хаммер Э, Энгстлер М (2003). «Белок, связывающий топоизомеразу I ДНК, является новой клеточной мишенью для модификации SUMO-1: характеристика доменов, необходимых для субклеточной локализации и сумоляции». Exp. Cell Res. 290 (1): 13–27. Дои:10.1016 / S0014-4827 (03) 00292-1. PMID 14516784.
Салим А., Датта Дж., Малегаонкар Д. и др. (2004). «Топоры белков, связывающих топоизомеразу I и р53, по-разному экспрессируются в нормальных и злокачественных тканях человека и могут действовать как опухолевый супрессор». Онкоген. 23 (31): 5293–300. Дои:10.1038 / sj.onc.1207700. PMID 15107820.
Хамфрей С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 9 человека». Природа. 429 (6990): 369–74. Дои:10.1038 / природа02465. ЧВК 2734081. PMID 15164053.
Колланд Ф., Жак Х, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК 442148. PMID 15231748.
Раджендра Р., Малегаонкар Д., Пунгалия П. и др. (2004). «Topors функционирует как убиквитинлигаза E3 со специфическими ферментами E2 и убиквитинат p53». J. Biol. Chem. 279 (35): 36440–4. Дои:10.1074 / jbc.C400300200. PMID 15247280.
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК 514446. PMID 15302935.
Оянаги Х., Такенака К., Исикава С. и др. (2005). «Экспрессия гена LUN, который кодирует новый белок пальца RING, коррелирует с развитием и прогрессированием немелкоклеточного рака легких». Рак легких. 46 (1): 21–8. Дои:10.1016 / j.lungcan.2004.03.009. HDL:2433/145282. PMID 15364129.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Flatten K, Dai NT, Vroman BT и др. (2005). «Роль контрольной точки киназы 1 в чувствительности к ядам топоизомеразы I.». J. Biol. Chem. 280 (14): 14349–55. Дои:10.1074 / jbc.M411890200. PMID 15699047.
Линь Л., Одзаки Т., Такада Ю. и др. (2005). «topors, p53 и топоизомераза I-связывающий белок пальца RING, является коактиватором p53 в подавлении роста, вызванном повреждением ДНК». Онкоген. 24 (21): 3385–96. Дои:10.1038 / sj.onc.1208554. PMID 15735665.
Вегер С., Хаммер Э, Хайльбронн Р. (2005). «Topors действует как лигаза SUMO-1 E3 для р53 in vitro и in vivo». FEBS Lett. 579 (22): 5007–12. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.07.088. PMID 16122737. S2CID 40285751.
Папайоанну М., Чакарова С.Ф., Прескотт Д.К. и др. (2006). «Новый локус (RP31) для аутосомно-доминантного пигментного ретинита отображается на хромосоме 9р». Гм. Genet. 118 (3–4): 501–3. Дои:10.1007 / s00439-005-0063-3. PMID 16189705. S2CID 28018465.

внешние ссылки

ТОПОРЫ расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
ТОПОРЫ детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 9 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197579 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036822 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10352183-5] Халуска П. младший, Салим А., Рашид З., Ахмед Ф., Су Е. В., Лю Л. Ф., Рубин Е. Х. (июль 1999 г.). «Взаимодействие между человеческой топоизомеразой I и новым белком RING finger / аргинин-серин». Нуклеиновые кислоты Res. 27 (12): 2538–44. Дои:10.1093 / nar / 27.12.2538. ЧВК 148458. PMID 10352183.

[pmid12083797-6] Рашид З.А., Салим А., Рэйви Ю., Пандольфи П.П., Рубин Э.Х. (июнь 2002 г.). «Связывающий топоизомеразу I белок RING, topors, связан с ядерными тельцами промиелоцитарного лейкоза». Exp Cell Res. 277 (2): 152–60. Дои:10.1006 / excr.2002.5550. PMID 12083797.

[pmid17924349-7] Chakarova CF, Papaioannou MG, Khanna H, Lopez I, Waseem N, Shah A, Theis T., Friedman J, Maubaret C, Bujakowska K, Veraitch B, Abd El-Aziz MM, Prescott de Q, Parapuram SK, Bickmore WA, Munro П.М., Гал А., Хамель С.П., Мариго В., Понтинг С.П., Виссинджер Б., Зреннер Э., Материя К, Сваруп А., Коенекоп Р.К., Бхаттачарья С.С. (октябрь 2007 г.). «Мутации в TOPORS вызывают аутосомно-доминантный пигментный ретинит с периваскулярной атрофией пигментного эпителия сетчатки». Am J Hum Genet. 81 (5): 1098–103. Дои:10.1086/521953. ЧВК 2265653. PMID 17924349.

[entrez-8] «Ген Entrez: связывание топоизомеразы I TOPORS, богатое аргинином / серином».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]