TRA2B - TRA2B

TRA2B
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2CQC, 2KXN, 2RRA, 2RRB
Идентификаторы
Псевдонимы	TRA2B, Htra2-beta, PPP1R156, SFRS10, SRFS10, TRA2-BETA, TRAN2B, трансформатор 2-бета-гомолог (Drosophila), трансформатор 2-бета-гомолог
Внешние идентификаторы	OMIM: 602719 MGI: 106016 ГомолоГен: 20965 Генные карты: TRA2B
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 3 (человек)
Конец	185,938,103 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 16 (мышь)
Конец	22,266,005 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание нуклеиновой кислоты; • связывание мРНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание полипуринового тракта; • Связывание РНК; • специфическое связывание белкового домена; • связывание пре-мРНК; • идентичное связывание с белками;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • внутренняя ядерная мембрана; • нуклеоплазма; • сплайсосомальный комплекс; • рибонуклеопротеин;
Биологический процесс	• Сплайсинг РНК посредством реакций переэтерификации; • Сплайсинг РНК; • регионализация коры головного мозга; • обработка мРНК; • отрицательная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы; • эмбриональное развитие мозга; • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы; • положительная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы; • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы; • регуляция сплайсинга РНК; • олигомеризация белков; • клеточный ответ на стимул глюкозы;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6434
	20462
	ENSG00000136527
	ENSMUSG00000022858
	P62995
	P62996
	NM_001243879; NM_004593
	NM_009186; NM_001330554; NM_001330555
	NP_001230808; NP_004584
	NP_001317483; NP_001317484; NP_033212
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Трансформатор-2 гомолог белка бета, также известен как TRA2B ранее известный как фактор сплайсинга, богатый аргинином / серином 10 (гомолог трансформатора 2, Drosophila) (SFRS10), это белок что у людей кодируется TRA2B ген.^[5]^[6]

Взаимодействия

TRA2B был показан взаимодействовать с участием RBMX.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136527 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022858 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ «Ген Entrez: фактор сплайсинга SFRS10, аргинин / серин-богатый 10 (гомолог трансформатора 2, дрозофила)».
^ Nayler O, Cap C, Stamm S (октябрь 1998 г.). «Ген трансформер-2-бета человека (SFRS10): полная нуклеотидная последовательность, хромосомная локализация и создание тканеспецифической изоформы». Геномика. 53 (2): 191–202. Дои:10.1006 / geno.1998.5471. PMID 9790768.
^ Хофманн, Ивонн; Вирт Брунгильда (август 2002 г.). «hnRNP-G способствует включению экзона 7 моторного нейрона выживания (SMN) посредством прямого взаимодействия с Htra2-beta1». Гм. Мол. Genet. 11 (17): 2037–49. Дои:10.1093 / hmg / 11.17.2037. ISSN 0964-6906. PMID 12165565.

дальнейшее чтение

Мацуо Н., Огава С., Имаи Ю. и др. (1996). «Клонирование нового РНК-связывающего полипептида (RA301), индуцированное гипоксией / реоксигенацией». J. Biol. Chem. 270 (47): 28216–22. Дои:10.1074 / jbc.270.47.28216. PMID 7499316.
Леннон Г., Оффрей С., Полимеропулос М., Соареш МБ (1996). «Консорциум I.M.A.G.E.: комплексный молекулярный анализ геномов и их экспрессии». Геномика. 33 (1): 151–2. Дои:10.1006 / geno.1996.0177. PMID 8617505.
Бейл Б., Скреатон Г., Штамм С. (1997). «Молекулярное клонирование htra2-бета-1 и htra2-бета-2, двух человеческих гомологов tra-2, полученных путем альтернативного сплайсинга». ДНК клетки биол. 16 (6): 679–90. Дои:10.1089 / dna.1997.16.679. PMID 9212162.
Имаи Ю., Мацуо Н., Огава С. и др. (1998). «Клонирование гена YT521 для нового белка, связанного со сплайсингом РНК, индуцированного гипоксией / реоксигенацией». Brain Res. Мол. Мозг Res. 53 (1–2): 33–40. Дои:10.1016 / S0169-328X (97) 00262-3. PMID 9473574.
Tacke R, Tohyama M, Ogawa S, Manley JL (1998). «Белки Tra2 человека являются активаторами сплайсинга пре-мРНК». Ячейка. 93 (1): 139–48. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81153-8. PMID 9546399. S2CID 15384749.
Нейлер О., Cap C, Stamm S (1998). «Ген трансформер-2-бета человека (SFRS10): полная нуклеотидная последовательность, хромосомная локализация и создание тканеспецифической изоформы». Геномика. 53 (2): 191–202. Дои:10.1006 / geno.1998.5471. PMID 9790768.
Элдридж А.Г., Ли Й., Шарп П.А., Бленкоу Б.Дж. (1999). «Коактиватор сплайсинга SRm160 / 300 необходим для функции экзон-энхансер». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (11): 6125–30. Bibcode:1999PNAS ... 96.6125E. Дои:10.1073 / пнас.96.11.6125. ЧВК 26846. PMID 10339552.
Лай М.К., Линь Р.И., Хуанг С.И. и др. (2000). «Белок семейства импортин-бета человека, транспортин-SR2, взаимодействует с фосфорилированным доменом RS белков SR». J. Biol. Chem. 275 (11): 7950–7. Дои:10.1074 / jbc.275.11.7950. PMID 10713112.
Венейблс Дж. П., Эллиотт Д. Д., Макарова О. В. и др. (2000). «RBMY, вероятный фактор сперматогенеза человека, и другие белки hnRNP G взаимодействуют с Tra2beta и влияют на сплайсинг». Гм. Мол. Genet. 9 (5): 685–94. Дои:10,1093 / hmg / 9,5,685. PMID 10749975.
Хельмкен С., Вирт Б. (2001). «Исключение Htra2-beta1, повышающего регулятора полноразмерного транскрипта SMN2, как модифицирующего гена для спинальной мышечной атрофии». Гм. Genet. 107 (6): 554–8. Дои:10.1007 / s004390000409. PMID 11153908. S2CID 30528707.
Янг П.Дж., ДиДонато С.Дж., Ху Д. и др. (2002). «SRp30c-зависимая стимуляция включения экзона 7 мотонейрона выживания (SMN) облегчается прямым взаимодействием с hTra2 beta 1». Гм. Мол. Genet. 11 (5): 577–87. Дои:10,1093 / чмг / 11,5,577. PMID 11875052.
Хофманн Й., Вирт Б. (2003). «hnRNP-G способствует включению экзона 7 моторного нейрона выживания (SMN) посредством прямого взаимодействия с Htra2-beta1». Гм. Мол. Genet. 11 (17): 2037–49. Дои:10.1093 / hmg / 11.17.2037. PMID 12165565.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Тран К., Коулман Т.П., Розер Дж. Р. (2003). «Человеческий трансформер 2beta и SRp55 взаимодействуют с кальцитонин-специфическим усилителем сплайсинга». Биохим. Биофиз. Acta. 1625 (2): 141–52. Дои:10.1016 / S0167-4781 (02) 00600-0. PMID 12531473.
Эль Язиди-Белкоура I, Adriaenssens E, Dollé L и др. (2003). «Белок домена смерти, связанный с рецептором фактора некроза опухоли, вовлечен в опосредованную рецептором нейротрофина антиапоптотическую активность фактора роста нервов в клетках рака груди». J. Biol. Chem. 278 (19): 16952–6. Дои:10.1074 / jbc.M300631200. PMID 12604596.
Цзян З., Тан Х, Хавлиоглу Н. и др. (2003). «Мутации в экзоне 10 тау-гена, связанные с FTDP-17, изменяют активность экзонного энхансера сплайсинга для взаимодействия с Tra2 beta». J. Biol. Chem. 278 (21): 18997–9007. Дои:10.1074 / jbc.M301800200. ЧВК 2140226. PMID 12649279.
Чен X, Го Л., Линь В., Сюй П (2004). «Экспрессия изоформ Tra2beta регулируется онтогенетически по тканевому и временному паттерну». Cell Biol. Int. 27 (6): 491–6. Дои:10.1016 / S1065-6995 (03) 00072-6. PMID 12798777. S2CID 44758770.
Helmken C, Hofmann Y, Schoenen F и др. (2004). «Доказательства модифицирующего пути в дискордантных семьях SMA: сниженный уровень SMN уменьшает количество его взаимодействующих партнеров и Htra2-beta1». Гм. Genet. 114 (1): 11–21. Дои:10.1007 / s00439-003-1025-2. PMID 14520560. S2CID 19872246.
Ли Дж., Хокинс И.К., Харви С.Д. и др. (2003). «Регулирование альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и взаимодействующих с ним белков». Мол. Cell. Биол. 23 (21): 7437–47. Дои:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. ЧВК 207616. PMID 14559993.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.

Эта статья о ген на хромосома человека 3 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136527 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022858 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] «Ген Entrez: фактор сплайсинга SFRS10, аргинин / серин-богатый 10 (гомолог трансформатора 2, дрозофила)».

[pmid9790768-6] Nayler O, Cap C, Stamm S (октябрь 1998 г.). «Ген трансформер-2-бета человека (SFRS10): полная нуклеотидная последовательность, хромосомная локализация и создание тканеспецифической изоформы». Геномика. 53 (2): 191–202. Дои:10.1006 / geno.1998.5471. PMID 9790768.

[pmid12165565-7] Хофманн, Ивонн; Вирт Брунгильда (август 2002 г.). «hnRNP-G способствует включению экзона 7 моторного нейрона выживания (SMN) посредством прямого взаимодействия с Htra2-beta1». Гм. Мол. Genet. 11 (17): 2037–49. Дои:10.1093 / hmg / 11.17.2037. ISSN 0964-6906. PMID 12165565.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]