Элемент внутренней репликации Tombusvirus (IRE) - Tombusvirus internal replication element (IRE)

Элемент внутренней репликации Tombusvirus (IRE)
RF00510.jpg
Идентификаторы
СимволTombus_IRE
РфамRF00510
Прочие данные
РНК типСнг
Домен (ы)Вирусы
ТАКТАК: 0000233
PDB структурыPDBe

В вирусология, то элемент внутренней репликации tombusvirus (IRE) это сегмент РНК расположен в регионе, кодирующем полимераза p92. Этот элемент необходим для вирусная репликация; в частности, считается, что это необходимо на ранней стадии репликации, такой как рекрутирование матрицы и / или сборка комплекса репликазы.[1]

Другой некодирующая РНК структуры в Tombusvirus включают 3 'UTR регион IV[2] и 5 'UTR.[3][4]

Рекомендации

  1. ^ Монкевич, S; Lin HX; Fabian MR; Xu W; Неа; Ray D; Чернышева О.А.; Надь PD; Белый КА (2005). «Кодирующая область полимеразы p92 содержит элемент внутренней РНК, необходимый на раннем этапе репликации генома томбусвируса». J Virol. 79 (8): 4848–4858. Дои:10.1128 / JVI.79.8.4848-4858.2005. ЧВК  1069561. PMID  15795270.
  2. ^ Fabian MR, Na H, Ray D, White KA (2003). «Вторичные структуры 3'-концевой РНК важны для накопления DI РНК вируса кустарниковой карликовой роста томатов». Вирусология. 313 (2): 567–580. Дои:10.1016 / S0042-6822 (03) 00349-0. PMID  12954222.
  3. ^ Ву Б., Ванти В. Б., Белый К. А. (2001). «Домен РНК в 5'-нетранслируемой области генома вируса кустистости томата модулирует репликацию вирусной РНК». J. Mol. Биол. 305 (4): 741–756. Дои:10.1006 / jmbi.2000.4298. PMID  11162089.
  4. ^ Рэй Д., На Х, Белый К.А. (2004). «Структурные свойства многофункционального Т-образного домена РНК, который опосредует эффективную репликацию РНК вируса кустарникового роста томатов». Дж. Вирол. 78 (19): 10490–10500. Дои:10.1128 / JVI.78.19.10490-10500.2004. ЧВК  516415. PMID  15367615.

внешняя ссылка