Turicibacter - Turicibacter

Turicibacter
TuricibacterCells2.png
Turicibacter sp. Клетки H121 под микроскопом
Turicibacter sp. H121 colony.png
Turicibacter sp. Колонии H121
Научная классификация
Домен:
Тип:
Учебный класс:
Заказ:
Семья:
Род:
Turicibacter

Босхард, Збинден и Альтвегг, 2002 г.
Штаммы

Turicibacter sanguinis MOL361
Turicibacter sp. PC909
Turicibacter sp. HGF1
Turicibacter sp. H121
Turicibacter sp. ZCY83

Turicibacter род в Фирмикуты тип бактерий, который чаще всего обнаруживается в кишечнике животных.[1]Род назван в честь города, в котором был впервые изолирован, Цюрих (Лат. = Turicum), Швейцария.[2]

Филогения

Положение Turicibacter в пределах Фирмикуты не могут быть решены с помощью анализа генов 16S рРНК. Однако ориентировочно он был помещен в класс Бациллы, то класс Рожистая.[3]

В дереве, построенном с использованием конкатенированного выравнивания белков, содержащего данные из двух черновиков Turicibacter геномов группа была помещена в основание класса Бациллы.[4] Более поздние анализы, которые также включали аминокислотные последовательности, предсказанные полным Turicibacter геном пришел к такому же выводу.[1]

Рекомендации

  1. ^ а б Аухтунг Т.А., Холдер М.Э., Геселл-младший, Аджами Н.Дж., Дуарте Р.Т., Ито К., Каспи Р.Р., Петросино Дж.Ф., Хорай Р., Сарате-Бладес С.Р. (2016). «Полная последовательность генома штамма H121 Turicibacter sp., Выделенного из фекалий зараженной мыши без микробов». Анонсы генома. 4 (2): e00114-16. Дои:10.1128 / геномA.00114-16. ЧВК  4807225. PMID  27013036.
  2. ^ Босхард П.П., Збинден Р., Альтвегг М. (2002). «Turicibacter sanguinis gen. Nov., Sp. Nov., Новая анаэробная грамположительная бактерия». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 52: 1263–1266. Дои:10.1099/00207713-52-4-1263. PMID  12148638.
  3. ^ Bosshard PP. "Род VIII. Turicibacter Bosshard, Zbinden and Altwegg 2002, 1266Вице-президент". В Де Вос П., Гаррити ГМ, Джонс Д., Криг Н. Р., Людвиг В., Рейни Ф. А., Шлейфер К., Уитман В. Б. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, 2-е изд. Фирмыкуты. Springer. С. 1314–1315.
  4. ^ Segata N, Börnigen D, Morgan XC, Huttenhower C (2013). «PhyloPhlAn - это новый метод улучшенного филогенетического и таксономического размещения микробов». Nature Communications. 4: 2304. Дои:10.1038 / ncomms3304. ЧВК  3760377. PMID  23942190.