УБР2 - UBR2

УБР2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3NY2, 3NY3
Идентификаторы
Псевдонимы	УБР2, C6orf133, bA49A4.1, dJ242G1.1, dJ392M17.3, убиквитин протеин лигаза компонент E3 n-распознавание 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 609134 MGI: 1861099 ГомолоГен: 26151 Генные карты: УБР2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 6 (человек)
Конец	42,693,504 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	47,010,556 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • связывание ионов цинка; • связывание лейцина; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы; • связывание ионов металлов; • активность убиквитин-протеинтрансферазы; • трансферазная активность;
Сотовый компонент	• хроматин; • ядро клетки; • убиквитинлигазный комплекс; • цитоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• клеточный ответ на лейцин; • белковый катаболический процесс; • мужской мейоз I; • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • убиквитинирование белков; • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс через путь правила N-конца; • отрицательная регуляция передачи сигналов TOR; • подавление хроматина; • убиквитинирование гистона H2A; • полиубиквитинирование белков; • реципрокная мейотическая рекомбинация; • мужское мейотическое деление ядра; • сперматогенез; • отрицательное регулирование транспозиции;
	Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
	23304
	224826
	ENSG00000024048
	ENSMUSG00000023977
	Q8IWV8
	Q6WKZ8
	NM_001184801; NM_015255; NM_001363705
	NM_001177374; NM_146078
	NP_001171730; NP_056070; NP_001350634
	NP_001170845; NP_666190
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза UBR2 является фермент что у людей кодируется УБР2 ген.^[5]

Протеолиз посредством убиквитин-протеасомная система контролирует концентрацию многих регуляторных белков. Избирательность убиквитилирование определяется лигазами убиквитина E3, которые распознают сигнал дестабилизации субстрата, или Degron. Лигаза E3 UBR2 участвует в пути правила N-конца, который нацелен на белки, несущие N-концевой дегрон или N-дегрон (Kwon et al., 2003) [предоставлено OMIM]^[5]

дальнейшее чтение

Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д. и др. (1997). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / днарес / 4.2.141. PMID 9205841.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID 14574404.
Kwon YT, Xia Z, An JY и др. (2003). "Самка летальности и апоптоз сперматоцитов у мышей, лишенных убиквитинлигазы UBR2 пути N-конца правила". Мол. Клетка. Биол. 23 (22): 8255–71. Дои:10.1128 / MCB.23.22.8255-8271.2003. ЧВК 262401. PMID 14585983.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Инь Дж, Квон Ю.Т., Варшавский А., Ван В. (2005). «RECQL4, мутировавший в синдромах Ротмунда-Томсона и RAPADILINO, взаимодействует с убиквитинлигазами UBR1 и UBR2 пути правила N-конца». Гм. Мол. Genet. 13 (20): 2421–30. Дои:10,1093 / hmg / ddh269. PMID 15317757.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Квак К.С., Чжоу X, Соломон V и др. (2005). «Регулирование катаболизма белков мышечно-специфической и цитокин-индуцируемой убиквитинлигазой E3alpha-II во время раковой кахексии». Рак Res. 64 (22): 8193–8. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-2102. PMID 15548684.
Зенкер М., Майерле Дж., Лерх М.М. и др. (2006). «Дефицит UBR1, убиквитинлигазы пути правила N-конца, вызывает дисфункцию поджелудочной железы, пороки развития и умственную отсталость (синдром Джохансона-Близзарда)» (PDF). Nat. Genet. 37 (12): 1345–50. Дои:10.1038 / ng1681. PMID 16311597. S2CID 23050042.
Матта-Камачо Э., Козлов Г., Ли Ф., Геринг К. и др. (2010). «Структурные основы распознавания субстрата и специфичности пути правила N-конца». Нат Структ Мол Биол. 17 (10): 1182–7. Дои:10.1038 / nsmb.1894. PMID 20835242. S2CID 20961853.

внешняя ссылка

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q8IWV8 (Убиквитин-протеинлигаза E3 UBR2) на PDBe-KB.

Эта статья о ген на хромосома человека 6 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000024048 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000023977 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: UBR2 убиквитин протеинлигаза E3 компонент n-распознавание 2».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

УБР2 - UBR2

Рекомендации

дальнейшее чтение

внешняя ссылка