UBiome - Википедия - uBiome

uBiome, Inc.
Частный
ПромышленностьБиотехнологии
Основан2012 Октябрь
ОсновательЗахари Апте, Джессика Ричман
Штаб-квартира
Сан - Франциско, Калифорния
,
Соединенные Штаты
Товары
  • SmartGutTM
  • SmartJaneTM
  • ИсследовательTM
Интернет сайтwww.ubiome.com

uBiome был биотехнология компания, базирующаяся в Сан-Франциско который разработал технологию для секвенирования человеческого микробиомы.

История

Компания была основана Джессикой Ричман, Закари Апте и Уиллом Лудингтоном, учеными в Калифорнийский институт количественных биологических наук.[1] В ноябре 2012 года uBiome собрал 350 000 долларов в рамках краудфандинговой кампании.[2] Учредители получали наставничество и финансирование от Y комбинатор и дальнейшее финансирование от Андриссен Горовиц и 8VC.[3][4][5]

В 2015 году uBiome предложила исследователям и гражданским ученым грантовую программу на сумму 1 миллион долларов для отбора проб микробиома и соответствующего анализа.[6] Одним из победителей первого раунда таких грантов стал Центры по контролю и профилактике заболеваний.[7]

Продукты и услуги

Клиенты покупают наборы для проб одной или нескольких частей своего тела, включая кишечник, гениталии, рот, нос или кожу. После взятия мазка участник проходит опрос, который используется для корреляции с данными микробиома. Участник отправляет комплект в компанию по почте и получает данные в течение нескольких недель; он или она может сравнить свои данные с данными uBiome.[8][9] В 2015 году uBiome получил Поправки по улучшению клинической лаборатории (CLIA) сертификат штата Калифорния.[10] В 2016 году uBiome получил аккредитацию от Колледж американских патологов.[11]

Технологии

По состоянию на 2015 год, компания сначала усиливает часть бактериального гена, который кодирует 16S рибосомная РНК с помощью ПЦР, тогда последовательности амплифицированный ген рибосомной РНК 16S, чтобы классифицировать бактерии по род уровень.[12] У компании есть собственная машинное обучение алгоритмы, которые анализируют данные о последовательностях и сравнивают их с собственной базой данных микробиомов компании, построенной на основе образцов, которые им присылают партнеры и отдельные клиенты, и веб-программным обеспечением, которое позволяет людям просматривать свой микробиом и проводить определенные сравнения.[13][14] Отчет за 2014 г. Xconomy сказал, что компания аутсорсинг последовательности.[14] Секвенирование выполняется на Иллюмина Секвенсор NextSeq500.[15][16]

В октябре 2015 года компания представила приложение на iOS с помощью ResearchKit, который позволял клиентам просматривать свои результаты на мобильных устройствах.[17]

uBiome сравнивали с Theranos и 23andMe, каждая из которых также является биотехнологическими компаниями, находящимися под влиянием Силиконовая долина.[7][18]

Споры

Эми Доксер Маркус в эссе 2014 года в The Wall Street Journal отметила, что, когда Ubiome поднял свой первый раунд краудфандинга в начале 2013 года, многие вопросы были подняты биоэтики о компании гражданская наука бизнес-модель, а именно, действительно ли она получила информированное согласие от своих клиентов, и непосредственно на потребительское генетическое тестирование инициативы вообще могут проводиться с этической точки зрения, а отсутствие Институциональный обзорный совет (IRB) одобрение.[19][20][21] В эссе Wall Street Journal также отмечалось, что были подняты вопросы о качестве данных, полученных в рамках инициатив в области гражданской науки, в отношении самоотбора и других вопросов.[19][22]

Компания получила одобрение IRB в июле 2013 года.[19][23][24]

В 2014 году люди, имеющие опыт биотехнологического предпринимательства, также подняли вопросы об этике краудфандинг биотехнологическая компания, поскольку риски таких предприятий высоки даже для людей с научными и деловыми знаниями.[19][25]

В апреле 2019 г. ФБР Агенты совершили налет на офис UBiome в ходе расследования возможного мошенничества со страховкой.[26][27] Соучредители Apte и Richman были отправлены в административный отпуск до завершения расследования, проведенного советом директоров компании.[28] Компания объявила о банкротстве 4 сентября 2019 года в ходе расследования.[29]


Награды и признание

В марте 2018 года uBiome выпустила Быстрая Компания Список самых инновационных компаний мира в области науки о данных, подтверждающий работу uBiome по сбору данных для разработки тестов на ВПЧ и ИППП.[30]

Рекомендации

  1. ^ Ли, Тереза ​​(22 апреля 2013 г.). «Тампоны для науки». Обзор науки Беркли.
  2. ^ Vachelard, J; Gambarra-Soares, T; Августини, G; Риул, П; Маракая-Коутиньо, V (17 февраля 2016 г.). «Путеводитель по научному краудфандингу». PLOS Биология. 14 (2): e1002373. Дои:10.1371 / journal.pbio.1002373. ЧВК  4757556. PMID  26886064.
  3. ^ Чоккатту, Джулиан. «uBiome привлекает 4,5 миллиона долларов от бизнес-ангелов, Андреессена Горовица для краудсорсинговых исследований микробиома». TechCrunch.
  4. ^ Дилле, Ромен. «Андриссен Горовиц привлекает новый огромный фонд в 1,5 миллиарда долларов». TechCrunch.
  5. ^ Бур, Сара. «Стартап uBiome, занимающийся здоровьем кишечника, собрал 15,5 миллионов долларов и запускает ДНК-тест для ваших фекалий». TechCrunch.
  6. ^ «ИНФОРМАЦИЯ: Объявление о Национальной инициативе по микробиому» (PDF). obamawhitehouse.archives.gov. Белый дом. 13 мая 2016 года.
  7. ^ а б Чжан, Сара. «Запуск микробиома uBiome будет секвенировать какашки для CDC». Проводной. 30 ноября 2015 г. Цитата: «Недавние разногласия по поводу компании по анализу крови Theranos высветили иногда слабые правила, и Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов требует более строгого регулирования лабораторных тестов»
  8. ^ Гертнер, Джон (7 января 2015 г.). «Что скрывается в вашем микробиоме? Возможно, лекарство от болезней». Быстрая компания.
  9. ^ Алмалки, М; Серый, К; Санчес, FM (24 февраля 2015 г.). «Использование систем самооценки для личной информации о здоровье: деятельность по управлению большими данными и перспективы». Информационная наука и системы здравоохранения. 3 (Дополнение 1 HISA Big Data в биомедицине и здравоохранении, 2013 Con): S1. Дои:10.1186 / 2047-2501-3-S1-S1. ЧВК  4437547. PMID  26019809.
  10. ^ «uBiome запускает лабораторию CLIA». genomeweb. 28 апреля 2015 года.
  11. ^ Тейлор, Джули (4 октября 2016 г.). «Лаборатория uBiome получила аккредитацию Колледжа американских патологов (CAP)». PRWeb.
  12. ^ Скоулз, Сара (7 октября 2015 г.). "Я отправил образец своей фекалии в uBiome -". The Crux @ Discover Magazine.
  13. ^ Хамси, Роксана (17 июля 2014 г.). «Может ли секвенирование ДНК кишечника действительно сказать вам что-нибудь о вашем здоровье?». Newsweek. Получено 21 марта 2015.
  14. ^ а б Танси, Бернадетт (18 августа 2014 г.). "Светящиеся растения в наноалмазы: дебют биотехнологической компании Y Combinator". Xconomy.
  15. ^ "ubiome 0.5.8: индекс пакета Python". testpypi.python.org. Получено 29 октября 2016.
  16. ^ Мак, Трейси (2 июня 2015 г.). "Интервью с Джессикой Ричман из uBiome". Сила кормы.
  17. ^ Тейлор, Ник Пол (11 октября 2015 г.). «UBiome использует экосистему Apple для расширения возможностей сбора данных о микробиоме». FierceBiotech.
  18. ^ Леонард, Эндрю (22 декабря 2015 г.). "Кремниевая долина до встречи". Современная роскошь: Кремниевая долина. Но здоровая доза скептицизма также уместна, не в последнюю очередь из-за трудностей, с которыми столкнулись два самых знаменитых стартапа в области цифрового здравоохранения, 23andMe и Theranos ... В 2013 году FDA запретило 23andMe продавать свою службу Personal Genome Service. FDA, которое еще не полностью утвердило технологию, было обеспокоено «последствиями для общественного здравоохранения неточных результатов, полученных с помощью устройств PGS». Урок для остальной части индустрии цифрового здравоохранения был ясен: если это прямо не разрешено FDA, компании не должны поощрять потребителей принимать медицинские решения на основе данных о состоянии здоровья, которые предоставляют компании. ... Theranos вылетела из ворот с беспрецедентным взрывом ... Затем, в середине октября, произошло землетрясение, потрясшее не только Theranos, но и все сообщество в области цифрового здравоохранения.
  19. ^ а б c d Маркус, Эми Доксер (24 октября 2014 г.). «Этика экспериментов над собой». Wall Street Journal.
  20. ^ DNLee (22 февраля 2013 г.). «Об этике и самоконтроле в (гражданской) науке». Сеть блогов Scientific American.
  21. ^ Чорост, Михаил (23 сентября 2013). "Краудсорсинговые исследования, несомненно, углубляются в микробиом человека". Хроника высшего образования.
  22. ^ Холл, Харриет (25 июня 2013 г.). «Познакомьтесь со своими микробами: uBiome предлагает новую услугу». Научная медицина.
  23. ^ Стоун, Джуди. "uBiome: этическое нарушение или нет?". Scientific American. Получено 9 февраля 2015.
  24. ^ Джессика, Ричман; Апте, Захари (22 июля 2013 г.). «Краудфандинг и IRB: пример uBiome». Блог Scientific American.
  25. ^ Ли, Стефани М. (15 февраля 2014 г.). «Биотехнологический стартап переходит в краудфандинг». Хроники Сан-Франциско.
  26. ^ Шин, Салли (2019-04-26). "Офис uBiome в Сан-Франциско подвергается налету спецагентов ФБР в Сан-Франциско. Видео с места событий @ltbatch pic.twitter.com/GO4Sb2LFMO". @sallyshin. Получено 2019-04-26.
  27. ^ Мэтьюз, Анна Уайлд; Маркус, Эми Доксер (26.04.2019). «ФБР ищет запуск тестирования микробиома в биллинговом зонде». Wall Street Journal. ISSN  0099-9660. Получено 2019-04-26.
  28. ^ Фарр, Кристина (6 мая 2019 г.). «Медицинский стартап uBiome приостанавливает клинические операции после рейда ФБР». CNBC. Получено 18 июн 2019.
  29. ^ «Все, что мы знаем о uBiome, стартапе, который убедил Кремниевую долину в том, что тестовая фекалия стоит 600 миллионов долларов, а затем объявил о банкротстве на фоне расследования ФБР». Business Insider. Получено 2020-05-10.
  30. ^ «Топ-10 самых инновационных компаний в 2018 году по секторам: Data Science | Fast Company». Быстрая Компания. Получено 2018-03-26.

Смотрите также

внешняя ссылка