USH1C - USH1C

USH1C
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыUSH1C, AIE-75, DFNB18, DFNB18A, NY-CO-37, NY-CO-38, PDZ-45, PDZ-73, PDZ-73 / NY-CO-38, PDZ73, PDZD7C, ush1cpst, гармонин компонента белковой сети USH1
Внешние идентификаторыOMIM: 605242 MGI: 1919338 ГомолоГен: 77476 Генные карты: USH1C
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение USH1C
Геномное расположение USH1C
Группа11п15.1Начинать17,493,895 бп[1]
Конец17,544,416 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE USH1C 205137 x at fs.png

PBB GE USH1C 211184 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001297764
NM_005709
NM_153676

NM_001163733
NM_001291182
NM_023649
NM_153677

RefSeq (белок)

NP_001284693
NP_005700
NP_710142

NP_001157205
NP_001278111
NP_076138
NP_710143

Расположение (UCSC)Chr 11: 17.49 - 17.54 МбChr 7: 46.2 - 46.24 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гармонин это белок что у людей кодируется USH1C ген.[5][6][7] Требуется для развития и поддержания волосковых клеток улитки.[5]

Взаимодействия

USH1C был показан взаимодействовать с CDH23.[8][9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000006611 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000030838 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Verpy E, Leibovici M, Zwaenepoel I, Liu XZ, Gal A, Salem N, Mansour A, Blanchard S, Kobayashi I, Keats BJ, Slim R, Petit C (сентябрь 2000 г.). «В основе синдрома Ашера типа 1С лежит дефект гармонина, белка, содержащего домен PDZ, экспрессируемого в сенсорных волосковых клетках внутреннего уха». Природа Генетика. 26 (1): 51–5. Дои:10.1038/79171. PMID  10973247. S2CID  9383331.
  6. ^ Ахмед З.М., Смит Т.Н., Риазуддин С., Макишима Т., Гош М., Бохари С., Менон П.С., Дешмук Д., Гриффит А.Дж., Риазуддин С., Фридман Т.Б., Уилкокс ER (июнь 2002 г.). «Несиндромная рецессивная глухота DFNB18 и синдром Ашера типа IC являются аллельными мутациями USHIC». Генетика человека. 110 (6): 527–31. Дои:10.1007 / s00439-002-0732-4. PMID  12107438. S2CID  24276167.
  7. ^ «Ген Энтреза: USH1C Синдром Ашера 1С (аутосомно-рецессивный, тяжелый)».
  8. ^ Боэда Б., Эль-Амрауи А., Бахлул А., Гудиер Р., Давиет Л., Бланшар С., Перфеттини I, Фатх К. Р., Шорте С., Райнерс Дж., Худусс А., Легрен П., Вольфрум У, Ричардсон Дж., Пети С. (декабрь 2002 г.) . «Миозин VIIa, гармонин и кадгерин 23, три продукта гена Usher I, которые взаимодействуют, чтобы сформировать пучок сенсорных волосковых клеток». Журнал EMBO. 21 (24): 6689–99. Дои:10.1093 / emboj / cdf689. ЧВК  139109. PMID  12485990.
  9. ^ Сименс Дж., Казмерчак П., Рейнольдс А., Наклейка М., Литтлвуд-Эванс А., Мюллер Ю. (ноябрь 2002 г.). «Белки синдрома Ашера кадгерин 23 и гармонин образуют комплекс посредством взаимодействий PDZ-домена». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (23): 14946–51. Дои:10.1073 / pnas.232579599. ЧВК  137525. PMID  12407180.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка