USP10 - USP10

USP10
Идентификаторы
ПсевдонимыUSP10, UBPO, убиквитинспецифическая пептидаза 10
Внешние идентификаторыOMIM: 609818 MGI: 894652 ГомолоГен: 31294 Генные карты: USP10
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное местоположение для USP10
Геномное местоположение для USP10
Группа16q24.1Начните84,699,978 бп[1]
Конец84,779,922 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE USP10 209137 s в формате fs.png

PBB GE USP10 209136 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

9100

22224

Ансамбль

ENSG00000103194

ENSMUSG00000031826

UniProt

Q14694

P52479

RefSeq (мРНК)

NM_001272075
NM_005153

NM_009462
NM_001310630

RefSeq (белок)

NP_001259004
NP_005144

NP_001297559
NP_033488

Расположение (UCSC)Chr 16: 84,7 - 84,78 МбChr 8: 119.91 - 119.96 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Убиквитинспецифическая пептидаза 10, также известен как USP10, является фермент который у человека кодируется USP10 ген.[5]

Функция

Убиквитин представляет собой высококонсервативный белок, ковалентно связанный с другими белками для регулирования их функции и деградации. Этот ген кодирует член семейства убиквитин-специфических протеаз цистеиновые протеазы. Фермент специфически отщепляет убиквитин от белковых субстратов, конъюгированных с убиквитином. Белок находится в ядре и цитоплазме. Он действует как кофактор ДНК-связанного рецептор андрогенов комплекса и ингибируется белком в Рас -GTPase путь. Геном человека содержит несколько псевдогены похож на этот ген.[5]

Взаимодействия

USP10 был показан взаимодействовать с G3BP1.[6]В эндотелии USP10 регулирует передачу сигналов Notch, замедляя деградацию внутриклеточного домена NOTCH1. [7]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103194 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031826 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 10 USP10».
  6. ^ Сончини С., Бердо I, Дретта Дж. (Июнь 2001 г.). «Связывающий белок Ras-GAP SH3-домен (G3BP) является модулятором USP10, новой человеческой убиквитин-специфической протеазы». Онкоген. 20 (29): 3869–79. Дои:10.1038 / sj.onc.1204553. PMID  11439350. S2CID  7515868.
  7. ^ Lim R, Sugino T, Nolte H, Andrade J, Zimmermann B, Shi C, Doddaballapur A, Ong YT, Wilhelm K, Fasse JW, Ernst A, Kaulich M, Husnjak K, Boettger T, Guenther S, Braun T, Krüger M , Benedito R, Dikic I, Potente M (апрель 2019 г.). «Деубиквитиназа USP10 регулирует передачу сигналов Notch в эндотелии». Наука. 364 (6436): 188–193. Дои:10.1126 / science.aat0778 (неактивно 2020-10-04). PMID  30975888.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на октябрь 2020 г. (ссылка на сайт)

дальнейшее чтение

  • Д'Андреа А., Пеллман Д. (1999). «Деубиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Крит. Rev. Biochem. Мол. Биол. 33 (5): 337–52. Дои:10.1080/10409239891204251. PMID  9827704.
  • Пуэнте XS, Санчес Л.М., Общий CM, Лопес-Отин С. (2003). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Nat. Преподобный Жене. 4 (7): 544–58. Дои:10.1038 / nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
  • Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Танака А., Номура Н. (1996). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. V. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0161-KIAA0200), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 3 (1): 17–24. Дои:10.1093 / dnares / 3.1.17. PMID  8724849.
  • Сончини C, Бердо I, Драетта G (2001). «Связывающий белок Ras-GAP SH3-домен (G3BP) является модулятором USP10, новой человеческой убиквитин-специфической протеазы». Онкоген. 20 (29): 3869–79. Дои:10.1038 / sj.onc.1204553. PMID  11439350. S2CID  7515868.
  • Фортна А, Ким И, Макларен Э, Маршалл К., Хан Дж., Мелтесен Л., Брентон М., Хинк Р., Бургерс С., Эрнандес-Буссард Т., Каримпур-Фард А., Глюк Д., МакГавран Л., Берри Р., Поллак Дж., Сикела JM (2006). «Дупликация и потеря генов, специфичных для происхождения, в эволюции человека и великой обезьяны». ПЛОС Биол. 2 (7): E207. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020207. ЧВК  449870. PMID  15252450.
  • Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
  • Faus H, Meyer HA, Huber M, Bahr I, Haendler B (2006). «Убиквитин-специфическая протеаза USP10 модулирует функцию рецепторов андрогенов». Мол. Cell. Эндокринол. 245 (1–2): 138–46. Дои:10.1016 / j.mce.2005.11.011. PMID  16368182. S2CID  24365493.
  • Грунда Дж. М., Наборс Л. Б., Палмер Калифорния, Чиенг, округ Колумбия, Стег А., Миккельсен Т, Diasio RB, Zhang K, Allison D, Grizzle WE, Wang W, Gillespie GY, Johnson MR (2007). «Повышенная экспрессия тимидилатсинтетазы (TS), убиквитинспецифической протеазы 10 (USP10) и сурвивина связана с плохой выживаемостью в мультиформной глиобластоме (GBM)». J. Neurooncol. 80 (3): 261–74. Дои:10.1007 / s11060-006-9191-4. PMID  16773218. S2CID  42007677.
  • Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
  • Дэн С., Чжоу Х, Сюн Р, Лу И, Ян Д., Син Т., Донг Л., Тан Э, Ян Х (2007). «Сверхэкспрессия генов и белков убиквитинспецифических пептидаз (USP) и протеасомных субъединиц (PS) в ткани рака молочной железы, наблюдаемая методами RFDD-PCR и протеомики». Рак молочной железы Res. Рассматривать. 104 (1): 21–30. Дои:10.1007 / s10549-006-9393-7. PMID  17004105. S2CID  29643544.
  • Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.