USP4 - USP4
Убиквитинспецифическая протеаза 4 (USP4) - это фермент что раскалывает убиквитин из ряда белковых субстратов.[5] До стандартизации номенклатуры USP4 был известен как UNP и был одним из первых деубиквитинирующих ферментов, идентифицированных у млекопитающих.[6] У мыши и человека белок USP4 кодируется геном, содержащим 22 экзоны.[7][8][9]
Этот белок входит в состав цистеинпептидаза семья C19. Как деубиквитинирующий фермент необычна способность расщеплять убиквитинпролин облигации.[10] Это свойство может отражать структурную гибкость активного сайта фермента и может объяснять его способность расщеплять убиквитиновые цепи с различными связями. USP4 имеет субстраты, выполняющие важную функцию в ряде клеточных сигнальных путей, включая NF-κB, TGF-β, Wnt / β-катенин, p53, и сплайсосома пути. Другие субстраты включают аденозиновый рецептор A2A и Ro52 (TRIM21 ) белок.
USP4 - это ядерно-цитоплазматический челночный белок, несущий функциональную сигнал ядерной локализации (NLS) 766QPQKKKK772 и сигнал ядерного экспорта (NES) 133VEVYLLELKL142.[11] Эти сигналы инициируют транслокацию USP4 в ядро из цитоплазмы и наоборот, соответственно. Соотношение цитоплазматического и ядерного пула USP4 варьируется в зависимости от типа клеток, фазы клеточного цикла и уровня экспрессии белка.[11]
Взаимодействия
USP4 был показан взаимодействовать с опухолевым супрессором белок pRb и карманные белки p107 и p130.[12]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000114316 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032612 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Серый D (2012). «Глава 462». В Rawlings & Salvesen (ред.). Справочник протеолитических ферментов (3-е изд.). Эльзевир. ISBN 9780123822192.
- ^ Гупта К., Коупленд Н. Г., Гилберт Д. Д., Дженкинс Н. А., Грей Д. А. (август 1993 г.). «Unp, мышиный ген, связанный с треонкогеном». Онкоген. 8 (8): 2307–10. PMID 8336951.
- ^ Ди Фрушио М., Гилкрист Калифорния, Бейкер РТ, Грей Д.А. (май 1998 г.). «Геномная структура Unp, мышиного гена, кодирующего убиквитин-специфическую протеазу». Биохим. Биофиз. Acta. 1398 (1): 9–17. Дои:10.1016 / s0167-4781 (98) 00035-9. PMID 9602026.
- ^ Пуэнте XS, Санчес Л.М., Общий CM, Лопес-Отин С. (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Нат Рев Жене. 4 (7): 544–558. Дои:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
- ^ «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 4 USP4 (протоонкоген)».
- ^ Гилкрист Калифорния, Грей Д.А., Бейкер РТ (декабрь 1997 г.). «Убиквитин-специфическая протеаза, которая эффективно расщепляет связь убиквитин-пролин». J. Biol. Chem. 272 (51): 32280–5. Дои:10.1074 / jbc.272.51.32280. PMID 9405433.
- ^ а б Соболева, Татьяна А .; Янс, Дэвид А .; Джонсон-Салиба, Мелани; Бейкер, Рохан Т. (2004-10-18). «Ядерно-цитоплазматическое перемещение онкогенного мышиного деубиквитилирующего фермента UNP / USP4». Журнал биологической химии. 280 (1): 745–752. Дои:10.1074 / jbc.m401394200. ISSN 0021-9258. PMID 15494318.
- ^ Бланшетт, Паола; Гилкрист, Кэтрин А; Бейкер, Рохан Т; Грей, Дуглас А. (сентябрь 2001 г.). «Ассоциация UNP, убиквитин-специфической протеазы, с карманными белками pRb, p107 и p130». Онкоген. 20 (39): 5533–5537. Дои:10.1038 / sj.onc.1204823. ISSN 0950-9232. PMID 11571651.
дальнейшее чтение
- Д'Андреа А., Пеллман Д. (1999). «Деубиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Крит. Rev. Biochem. Мол. Биол. 33 (5): 337–352. Дои:10.1080/10409239891204251. PMID 9827704.
- Грей Д.А., Инадзава Дж., Гупта К. и др. (1995). «Повышенная экспрессия Unph, протоонкогена 3p21.3, в опухолях легких человека». Онкоген. 10 (11): 2179–83. PMID 7784062.
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–174. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Гупта К., Шевретт М., Грей Д.А. (1994). «Протоонкоген Unp кодирует ядерный белок». Онкоген. 9 (6): 1729–31. PMID 8183569.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–156. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Ди Донато Ф., Чан Э. К., Асканас А. Д. и др. (2001). «Взаимодействие между SSA / Ro 52 кДа и деубиквитинирующим ферментом UnpEL: ключ к действию». Int. J. Biochem. Cell Biol. 33 (9): 924–934. Дои:10.1016 / S1357-2725 (01) 00055-3. PMID 11461834.
- Blanchette P, Gilchrist CA, Baker RT, Gray DA (2001). «Ассоциация UNP, убиквитин-специфической протеазы, с карманными белками pRb, p107 и p130». Онкоген. 20 (39): 5533–5537. Дои:10.1038 / sj.onc.1204823. PMID 11571651.
- ДеСалле Л.М., Латрес Э., Лин Д. и др. (2001). «Деубиквитинирующий фермент Unp взаимодействует с белком ретинобластомы». Онкоген. 20 (39): 5538–5542. Дои:10.1038 / sj.onc.1204824. PMID 11571652.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Вада К., Танджи К., Камитани Т. (2006). «Онкогенный белок UnpEL / Usp4 деубиквитинирует Ro52 за счет своей изопептидазной активности». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 339 (3): 731–736. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.11.076. PMID 16316627.
- Вада К., Камитани Т. (2006). «UnpEL / Usp4 убиквитинируется с помощью Ro52 и деубиквитинируется сам по себе». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 342 (1): 253–258. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.01.144. PMID 16472766.
внешняя ссылка
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q13107 (Убиквитинкарбоксил-терминальная гидролаза 4) на PDBe-KB.
Эта статья о ген на хромосома человека 3 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |