USP4 - USP4

USP4
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыUSP4, UNP, Unph, убиквитинспецифическая пептидаза 4
Внешние идентификаторыOMIM: 603486 MGI: 98905 ГомолоГен: 20716 Генные карты: USP4
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное местоположение для USP4
Геномное местоположение для USP4
Группа3п21.31Начните49,277,144 бп[1]
Конец49,340,712 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE USP4 202681 в формате fs.png

PBB GE USP4 211800 s в формате fs.png

PBB GE USP4 202682 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_199443
NM_001251877
NM_003363

NM_011678
NM_001311157

RefSeq (белок)

NP_001238806
NP_003354
NP_955475

NP_001298086
NP_035808

Расположение (UCSC)Chr 3: 49.28 - 49.34 МбChr 9: 108,35 - 108,39 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Убиквитинспецифическая протеаза 4 (USP4) - это фермент что раскалывает убиквитин из ряда белковых субстратов.[5] До стандартизации номенклатуры USP4 был известен как UNP и был одним из первых деубиквитинирующих ферментов, идентифицированных у млекопитающих.[6] У мыши и человека белок USP4 кодируется геном, содержащим 22 экзоны.[7][8][9]

Этот белок входит в состав цистеинпептидаза семья C19. Как деубиквитинирующий фермент необычна способность расщеплять убиквитинпролин облигации.[10] Это свойство может отражать структурную гибкость активного сайта фермента и может объяснять его способность расщеплять убиквитиновые цепи с различными связями. USP4 имеет субстраты, выполняющие важную функцию в ряде клеточных сигнальных путей, включая NF-κB, TGF-β, Wnt / β-катенин, p53, и сплайсосома пути. Другие субстраты включают аденозиновый рецептор A2A и Ro52 (TRIM21 ) белок.

USP4 - это ядерно-цитоплазматический челночный белок, несущий функциональную сигнал ядерной локализации (NLS) 766QPQKKKK772 и сигнал ядерного экспорта (NES) 133VEVYLLELKL142.[11] Эти сигналы инициируют транслокацию USP4 в ядро ​​из цитоплазмы и наоборот, соответственно. Соотношение цитоплазматического и ядерного пула USP4 варьируется в зависимости от типа клеток, фазы клеточного цикла и уровня экспрессии белка.[11]

Взаимодействия

USP4 был показан взаимодействовать с опухолевым супрессором белок pRb и карманные белки p107 и p130.[12]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000114316 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032612 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Серый D (2012). «Глава 462». В Rawlings & Salvesen (ред.). Справочник протеолитических ферментов (3-е изд.). Эльзевир. ISBN  9780123822192.
  6. ^ Гупта К., Коупленд Н. Г., Гилберт Д. Д., Дженкинс Н. А., Грей Д. А. (август 1993 г.). «Unp, мышиный ген, связанный с треонкогеном». Онкоген. 8 (8): 2307–10. PMID  8336951.
  7. ^ Ди Фрушио М., Гилкрист Калифорния, Бейкер РТ, Грей Д.А. (май 1998 г.). «Геномная структура Unp, мышиного гена, кодирующего убиквитин-специфическую протеазу». Биохим. Биофиз. Acta. 1398 (1): 9–17. Дои:10.1016 / s0167-4781 (98) 00035-9. PMID  9602026.
  8. ^ Пуэнте XS, Санчес Л.М., Общий CM, Лопес-Отин С. (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Нат Рев Жене. 4 (7): 544–558. Дои:10.1038 / nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
  9. ^ «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 4 USP4 (протоонкоген)».
  10. ^ Гилкрист Калифорния, Грей Д.А., Бейкер РТ (декабрь 1997 г.). «Убиквитин-специфическая протеаза, которая эффективно расщепляет связь убиквитин-пролин». J. Biol. Chem. 272 (51): 32280–5. Дои:10.1074 / jbc.272.51.32280. PMID  9405433.
  11. ^ а б Соболева, Татьяна А .; Янс, Дэвид А .; Джонсон-Салиба, Мелани; Бейкер, Рохан Т. (2004-10-18). «Ядерно-цитоплазматическое перемещение онкогенного мышиного деубиквитилирующего фермента UNP / USP4». Журнал биологической химии. 280 (1): 745–752. Дои:10.1074 / jbc.m401394200. ISSN  0021-9258. PMID  15494318.
  12. ^ Бланшетт, Паола; Гилкрист, Кэтрин А; Бейкер, Рохан Т; Грей, Дуглас А. (сентябрь 2001 г.). «Ассоциация UNP, убиквитин-специфической протеазы, с карманными белками pRb, p107 и p130». Онкоген. 20 (39): 5533–5537. Дои:10.1038 / sj.onc.1204823. ISSN  0950-9232. PMID  11571651.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q13107 (Убиквитинкарбоксил-терминальная гидролаза 4) на PDBe-KB.