USP53 - USP53

USP53
Идентификаторы
ПсевдонимыUSP53, убиквитинспецифическая пептидаза 53
Внешние идентификаторыOMIM: 617431 MGI: 2139607 ГомолоГен: 34521 Генные карты: USP53
Расположение гена (человек)
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек)[1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение USP53
Геномное расположение USP53
Группа4q26Начинать119,212,587 бп[1]
Конец119,295,517 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_133857

RefSeq (белок)

NP_598618

Расположение (UCSC)Chr 4: 119,21 - 119,3 МбChr 3: 122.93 - 122.98 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Неактивная убиквитинкарбоксил-концевая гидролаза 53 это белок что у людей кодируется USP53 ген.[5]

Хотя USP53 классифицируется как деубиквитинирующий фермент на основе гомологии последовательности с другими протеазы из этой группы ему не хватает функционально необходимого гистидина в каталитическом домене, и анализы активности предполагают, что USP53 каталитически неактивен.[6][7][8] Несмотря на то, что USP53 лишен каталитической активности, USP53 выполняет важные физиологические функции: мутации в Усп53 было показано, что они вызывают прогрессирующую потерю слуха у мышей,[8] а также потеря слуха с поздним началом и холестаз в людях.[9]USP53 локализуется в сотовой узкие стыки и взаимодействует с белок плотного соединения 2 (TJP2).[8] Мутации в TJP2 также было показано, что они вызывают нарушения слуха [10] и холестаз.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145390 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039701 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И., Хиросава М., Охара О. (февраль 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 7 (1): 65–73. Дои:10.1093 / днарес / 7.1.65. PMID  10718198.
  6. ^ Кесада V, Диас-Пералес А., Гутьеррес-Фернандес А., Гарабая С., Кал С., Лопес-Отин С. (январь 2004 г.). «Клонирование и ферментативный анализ 22 новых убиквитин-специфических протеаз человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 314 (1): 54–62. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.12.050. PMID  14715245.
  7. ^ «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 53 USP53».
  8. ^ а б c Kazmierczak M, Harris SL, Kazmierczak P, Shah P., Starovoytov V, Ohlemiller KK, Schwander M (ноябрь 2015 г.). «Прогрессирующая потеря слуха у мышей с мутацией в Usp53». Журнал неврологии. 35 (47): 15582–98. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.1965-15.2015. ЧВК  4659823. PMID  26609154.
  9. ^ Маддиревула С., Альхебби Х., Алькахтани А., Альгуфи Т., Альсаиф Х.С., Ибрагим Н., Абдулвахаб Ф., Барр М., Альзайдан Х., Альмехайдеб А., Аль-Саси О, Альхашем А., Хуссайни Х.А., Вали С., Алкурая Ф. С. (сентябрь 2018 г.). «Идентификация новых локусов холестатической болезни печени у детей, определяемых патогенными вариантами KIF12, PPM1F, USP53, LSR и WDR83OS». Генетика в медицине. 21 (5): 1164–1172. Дои:10.1038 / с41436-018-0288-х. PMID  30250217. S2CID  52811525.
  10. ^ Ван Х.Й., Чжао Ю.Л., Лю Цюй, Юань Х., Гао И., Лан Л., Ю Л, Ван Д.Й., Гуань Дж., Ван Ц.Дж. (декабрь 2015 г.). «Идентификация двух вызывающих заболевание генов TJP2 и GJB2 в китайской семье с безусловным аутосомно-доминантным несиндромальным наследственным нарушением слуха». Китайский медицинский журнал. 128 (24): 3345–51. Дои:10.4103/0366-6999.171440. ЧВК  4797511. PMID  26668150.
  11. ^ Sambrotta M, Strautnieks S, Papouli E, Rushton P, Clark BE, Parry DA, Logan CV, Newbury LJ, Kamath BM, Ling S, Grammatikopoulos T, Wagner BE, Magee JC, Sokol RJ, Mieli-Vergani G, Smith JD, Johnson CA, McClean P, Simpson MA, Knisely AS, Bull LN, Thompson RJ (октябрь 2014 г.). «Мутации в TJP2 вызывают прогрессирующую холестатическую болезнь печени». Природа Генетика. 46 (4): 326–328. Дои:10,1038 / нг.2918. ЧВК  4061468. PMID  24614073.

дальнейшее чтение

  • Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Й, Ирие Р, Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Озилдирим А.М., Вистоу Г.Дж., Гао Дж., Ван Дж., Дикинсон Д.П., Фриерсон Х.Ф., Лори Г.В. (май 2005 г.). «Транскриптом слезной железы - необычайно богатый источник редких и плохо охарактеризованных транскриптов генов». Исследовательская офтальмология и визуализация. 46 (5): 1572–80. CiteSeerX  10.1.1.123.3574. Дои:10.1167 / iovs.04-1380. PMID  15851553.