VAC14 - Википедия - VAC14

VAC14
Идентификаторы
ПсевдонимыVAC14, ArPIKfyve, TAX1BP2, TRX, Vac14, компонент комплекса PIKFYVE, компонент VAC14 комплекса PIKFYVE
Внешние идентификаторыOMIM: 604632 MGI: 2157980 ГомолоГен: 6528 Генные карты: VAC14
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение VAC14
Геномное расположение VAC14
Группа16q22.1-q22.2Начинать70,687,439 бп[1]
Конец70,801,160 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

55697

234729

Ансамбль

ENSG00000103043

ENSMUSG00000010936

UniProt

Q08AM6

Q80WQ2

RefSeq (мРНК)

NM_018052
NM_001351157

NM_146216

RefSeq (белок)

NP_060522
NP_001338086

NP_666328

Расположение (UCSC)Chr 16: 70.69 - 70.8 МбChr 8: 110.62 - 110.72 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гомолог белка VAC14, также известный как ArPIKfyve (Ассоциированный регулятор PIKfyve), является белок что у людей кодируется VAC14 ген.[5][6][7]

Функции и взаимодействия

Содержание фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфат (PtdIns (3,5) P2) в эндосомальных мембранах динамически изменяется с событиями деления и слияния, которые генерируют или поглощают внутриклеточные транспортные везикулы. Белок ArPIKfyve образует тримолекулярный комплекс, чтобы жестко регулировать уровень PtdIns (3,5) P2. Другими компонентами этого комплекса являются фермент, синтезирующий PtdIns (3,5) P2. ПИКФЫВЕ и содержащая Sac1-домен PtdIns (3,5) P2 5-фосфатаза Sac3, кодируемая геном человека FIG4. VAC14 действует как активатор PIKFYVE.[5][8] Исследования на мышах, нокаутированных по VAC14, показывают, что, помимо увеличения PtdIns (3,5) P2-продуцирующей активности PIKfyve, VAC14 также контролирует стабильные уровни другого редкого фосфоинозитида, связанного с активностью фермента PIKfyve - фосфатидилинозитол 5-фосфат.

Помимо образования тройного комплекса с PIKfyve и Sac3, ArPIKfyve участвует во многих других взаимодействиях. ArPIKfyve образует стабильный комплекс с PtdIns (3,5) P2-специфической фосфатазой Sac3, тем самым защищая Sac3 от быстрой деградации в протеасоме.[9] ArPIKfyve образует гомоолигомер через свой карбоксильный конец. Однако количество мономеров в гомоолигомере ArPIKfyve, гетеродимере ArPIKfyve-Sac3 или гетеротримере PIKfyve-ArPIKfyve-Sac3 неизвестно.[10] Человеческий Vac14 / ArPIKfyve также взаимодействует с доменом PDZ (постсинаптическая плотность) нейрональной синтазы оксида азота. [11] но функциональное значение этого взаимодействия до сих пор неясно. ArPIKfyve способствует регулируемой инсулином транслокации GLUT4 на поверхность клетки.[12]

Уроки из моделей мыши VAC14

Мыши с нокаутом по VAC14 умирают во время или вскоре после рождения и демонстрируют массивную нейродегенерацию. В фибробластах этих мышей уровни PtdIns (3,5) P2 и PtdIns (5) P ниже примерно на 50%.[13] Спонтанная точечная мутация VAC14 мыши (с заменой лейцина 156 аргинином) связана с уменьшением продолжительности жизни (до 3 недель), размером тела, увеличением желудочков мозга, 50% снижением уровней PtdIns (3,5) P2, ослабленной пигментацией и т. тремор и нарушение двигательной функции.[14]

VAC14 и болезнь человека

Ген VAC14 еще предстоит убедительно связать с болезнями человека.[15]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103043 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000010936 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: гомолог Vac14 (S. cerevisiae)».
  6. ^ Дэви Б. Е., Робинсон М. Л. (май 2003 г.). «Врожденная гидроцефалия у мышей hy3 вызвана мутацией сдвига рамки считывания в Hydin, большом новом гене». Гм. Мол. Genet. 12 (10): 1163–70. Дои:10.1093 / hmg / ddg122. PMID  12719380.
  7. ^ Сбрисса Д., Иконов О.К., Стракова Дж., Дондапати Р., Млак К., Диб Р., Сильвер Р., Шишева А. (декабрь 2004 г.). «Ортолог Saccharomyces cerevisiae Vac14 млекопитающих, который ассоциирует с активностью фосфоинозитид-5-киназы PIKfyve и повышает ее активность». Мол. Клетка. Биол. 24 (23): 10437–47. Дои:10.1128 / MCB.24.23.10437-10447.2004. ЧВК  529046. PMID  15542851.
  8. ^ Сбрисса Д., Иконов О.К., Фу З., Иджуин Т., Грюнберг Дж., Такенава Т., Шишева А. (август 2007 г.). «Аппарат основного белка для синтеза и обмена фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфата у млекопитающих, который регулирует развитие эндосомного транспорта. Новая фосфатаза Sac присоединяется к комплексу ArPIKfyve-PIKfyve». J. Biol. Chem. 282 (33): 23878–91. Дои:10.1074 / jbc.M611678200. PMID  17556371.
  9. ^ Иконов О.К., Сбрисса Д., Флиггер Дж., Дельвеккио К., Шишева А. (август 2010). «ArPIKfyve регулирует количество и обмен белка Sac3: нарушение механизма мутацией Sac3I41T, вызывающей расстройство Шарко-Мари-Тута 4J». J. Biol. Chem. 285 (35): 26760–4. Дои:10.1074 / jbc.C110.154658. ЧВК  2930674. PMID  20630877.
  10. ^ Сбрисса Д., Иконов О.К., Феннер Х., Шишева А. (декабрь 2008 г.). «Гомомерные и гетеромерные взаимодействия ArPIKfyve формируют основу PIKfyve и Sac3 в комплексе, чтобы способствовать активности и функциональности PIKfyve». J. Mol. Биол. 384 (4): 766–79. Дои:10.1016 / j.jmb.2008.10.009. ЧВК  2756758. PMID  18950639.
  11. ^ Лемер Дж. Ф., Макферсон П. С. (декабрь 2006 г.). «Связывание Vac14 с нейрональной синтазой оксида азота: характеристика нового внутреннего мотива распознавания PDZ». FEBS Lett. 580 (30): 6948–54. Дои:10.1016 / j.febslet.2006.11.061. PMID  17161399. S2CID  40346432.
  12. ^ Иконов О.К., Сбрисса Д., Дондапати Р., Шишева А. (июль 2007 г.). «Взаимодействие ArPIKfyve-PIKfyve и роль в регулируемой инсулином транслокации GLUT4 и транспорте глюкозы в адипоцитах 3T3-L1». Exp. Cell Res. 313 (11): 2404–16. Дои:10.1016 / j.yexcr.2007.03.024. ЧВК  2475679. PMID  17475247.
  13. ^ Чжан Ю., Золов С.Н., Чоу С.Й., Слуцкий С.Г., Ричардсон С.К., Пайпер Р.С., Ян Б., Нау Дж.Дж., Вестрик Р.Дж., Моррисон С.Дж., Мейслер М.Х., Вайсман Л.С. (октябрь 2007 г.). «Потеря Vac14, регулятора сигнального липида фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфата, приводит к нейродегенерации у мышей». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (44): 17518–23. Дои:10.1073 / pnas.0702275104. ЧВК  2077288. PMID  17956977.
  14. ^ Джин Н., Чоу С.Й., Лю Л., Золов С.Н., Бронсон Р., Дэвиссон М., Петерсен Д.Л., Чжан Ю., Пак С., Дуэкс Д.Е., Голдовиц Д., Мейслер М.Х., Вайсман Л.С. (декабрь 2008 г.). «VAC14 образует ядро ​​белкового комплекса, необходимого для острой взаимной конверсии PI3P и PI (3,5) P (2) у дрожжей и мышей» (PDF). EMBO J. 27 (24): 3221–34. Дои:10.1038 / emboj.2008.248. ЧВК  2600653. PMID  19037259.
  15. ^ «VAC14 - гомолог Vac14 (S. cerevisiae)». WikiGenes. Получено 2011-07-16.

дальнейшее чтение