Аналог VAD1 связанного с StAR переноса липидов - VAD1 analog of StAR-related lipid transfer

VASt домен
Идентификаторы
СимволVASt домен
PfamPF16016
ИнтерПроIPR031968

Аналог VAD1 связанного с StAR переноса липидов (VASt) - это стероидогенный метод острой регуляторной передачи липидов, связанный с белками (StART). липид -связывающий домен, впервые идентифицированный в белке vad1 (сосудисто-ассоциированная смерть1) в Arabidopsis thaliana (кресс-салат из мышиных ушей).[1][2] Белки, содержащие эти домены, находятся в эукариоты и обычно содержат другой липид-связывающий домен, обычно GRAM домен а иногда C2 домен в растениях и интегральная пероксисомальная мембрана пероксин Домен pex24p в оомицеты.[1]

Структура

Домен VASt по структуре напоминает усеченную форму START домен, но с ограниченным сходством последовательностей.[1][3] Пока ВАСТ является членом Bet v1-like суперсемейство, неясно, развился из того же предкового домена, что и домен START, или является примером конвергентная эволюция.[1]

Этот домен является высококонсервативным у всех эукариот и обычно присутствует только в одной копии в белках, содержащих домен VASt.[1] Как и домен START, домен VASt состоит из спиральной складчатой ​​структуры. Образованный карман достаточно велик, чтобы связывать один липид, такой как холестерин.[4], 25-гидроксихолестерин[5] или эргостерин[2][3].

Анализ кристаллической структуры несвязанных и связанных форм VASt-доменов в белках-переносчиках липидов, закрепленных на сайте контакта с мембраной (LAM) от дрожжи выявили, что домен содержит доступную гидрофобную полость ».[3][5] При связывании стерином полости вход закрывается или частично закрывается снаружи.

Белки человека, содержащие домен VASt

Единственные белки, содержащие этот домен, идентифицированные у человека: GRAMD1A / Астра-А, GRAMD1B / Астер-Б и GRAMD1C / Aster-C (с доменом VASt, называемым доменом Aster[4]). Эти стерол переносить белки вместе с GRAMD2A и GRAMD2B являются белками семейства LAM, хотя у последних двух отсутствует домен VASt.[6] Подобно белкам LAM, белки GRAMD1 предпочтительно переносят стерины.[3][4]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е Хафиф М., Коттрет Л., Балаге С., Раффаэле С. (2014). «Идентификация и филогенетический анализ VASt, не охарактеризованного белкового домена, связанного с липид-связывающими доменами у эукариот». BMC Bioinformatics. 15: 222. Дои:10.1186/1471-2105-15-222. ЧВК  4082322. PMID  24965341.
  2. ^ а б Хоренкамп Ф.А., Вальверде Д.П., Нуннари Дж., Райниш К.М. (2018). «Молекулярная основа переноса стеролов с помощью StART-подобных доменов переноса липидов». EMBO J. 37 (6): e98002. Дои:10.15252 / embj.201798002. ЧВК  5852651. PMID  29467216.
  3. ^ а б c d Хоренкамп Ф.А., Вальверде Д.П., Нуннари Дж., Райниш К.М. (2018). «Молекулярная основа переноса стеролов с помощью StART-подобных доменов переноса липидов». EMBO J. 37 (6): e98002. Дои:10.15252 / embj.201798002. ЧВК  5852651. PMID  29467216.
  4. ^ а б c Sandhu J, Li S, Fairall L, Pfisterer SG, Gurnett JE, Xiao X, Weston TA, Vashi D, Ferrari A, Orozco JL, Hartman CL, Strugatsky D, Lee SD, He C, Hong C, Jiang H, Bentolila LA , Gatta AT, Levine TP, Ferng A, Lee R, Ford DA, Young SG, Ikonen E, Schwabe JW, Tontonoz P (2018). «Белки Aster способствуют транспорту невезикулярной плазматической мембраны к транспорту холестерина ER в клетках млекопитающих». Клетка. 175 (2): 514–529.e20. Дои:10.1016 / j.cell.2018.08.033. ЧВК  6469685. PMID  30220461.
  5. ^ а б Jentsch JA, Kiburu I, Pandey K, Timme M, Ramlall T., Levkau B, Wu J, Eliezer D, Boudker O, Menon AK (2018). «Структурные основы связывания стеролов и транспорта дрожжевым доменом StARkin». J. Biol. Chem. 293 (15): 5522–5531. Дои:10.1074 / jbc.RA118.001881. ЧВК  5900764. PMID  29463678.
  6. ^ Беспрозванная М., Диксон Э., Ли Х, Гинбург К.С., Берс Д.М., Ауверкс Дж., Нуннари Дж. (Февраль 2018 г.). «Белки домена GRAM специализируются на функционально различных сайтах контакта ER-PM в клетках человека». eLife. 22 (7): e31019. Дои:10.7554 / eLife.31019. ЧВК  5823543. PMID  29469807.