WDR57 - WDR57

SNRNP40
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSNRNP40, 40K, HPRP8BP, PRP8BP, PRPF8BP, SPF38, WDR57, субъединица 40 U5 малого ядерного рибонуклеопротеина
Внешние идентификаторыOMIM: 607797 MGI: 1913835 ГомолоГен: 3538 Генные карты: SNRNP40
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение SNRNP40
Геномное расположение SNRNP40
Группа1п35.2Начинать31,259,568 бп[1]
Конец31,296,788 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE WDR57 215905 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004814

NM_025645

RefSeq (белок)

NP_004805

NP_079921

Расположение (UCSC)Chr 1: 31.26 - 31.3 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Повторяющийся домен WD 57 (специфичный для U5 snRNP), также известный как WDR57, это ген обнаружены во многих организмах, включая, помимо прочего, Homo sapiens, Gallus gallus, Пан троглодиты, Канус фамильяр, Bos taurus, Mus musculus, и Раттус норвегикус.[4]

Функция

Этот ген кодирует компонент частицы малого ядерного рибонуклеопротеина (snRNP) U5. U5 snRNP является частью сплайсосомы, мультибелкового комплекса, который катализирует удаление интронов из пре-мессенджерных РНК.[4]

Взаимодействия

WDR57 показал себя взаимодействовать с PRPF8[5][6] и EFTUD2.[5][6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000060688 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ а б «Ген Entrez: домен 57 повтора WD WDR57 (специфичный для snRNP U5)».
  5. ^ а б Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
  6. ^ а б Ахсель Т., Аренс К., Брамс Х, Тейгелькамп С., Люрманн Р. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок U5-220kD (hPrp8) образует стабильный комплекс без РНК с несколькими U5-специфическими белками, включая РНК-развиндазу, гомолог фактора удлинения рибосом EF-2 и новый белок WD-40». Молекулярная и клеточная биология. 18 (11): 6756–66. Дои:10.1128 / mcb.18.11.6756. ЧВК  109259. PMID  9774689.

дальнейшее чтение