XAF1 - XAF1

XAF1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2LXW
Идентификаторы
Псевдонимы	XAF1, BIRC4BP, HSXIAPAF1, XIAPAF1, XIAP связанный фактор 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 606717 MGI: 3772572 ГомолоГен: 49488 Генные карты: XAF1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	6,775,647 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	72,313,733 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ионов металлов; • связывание ионов цинка;
Сотовый компонент	• цитозоль; • цитоплазма; • ядро клетки; • митохондрия;
Биологический процесс	• апоптотический процесс; • сигнальный путь интерферона I типа; • ответ на интерферон-бета;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54739
	327959
	ENSG00000132530
	ENSMUSG00000040483
	Q6GPH4
	Q5NBU8
NM_017523; NM_199139; NM_001353134; NM_001353135; NM_001353136;
	NM_001353137; NM_001353138; NM_001353139; NM_001353140
	NM_001037713; NM_001291153
NP_059993; NP_954590; NP_001340063; NP_001340064; NP_001340065;
	NP_001340066; NP_001340067; NP_001340068; NP_001340069
	NP_001032802; NP_001278082
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

XIAP-связанный фактор 1 это белок что у людей кодируется XAF1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Х-связанный ингибитор апоптоза (XIAP; MIM 300079) является мощным членом семейства IAP. Все члены этого семейства обладают бакуловирусными повторами IAP (BIR), богатыми цистеином доменами примерно из 80 аминокислот, которые связывают и ингибируют каспазы (например, CASP3; MIM 600636). XIAP имеет 3 домена BIR и C-концевой цинковый палец RING, который обладает активностью убиквитинлигазы E3 (см. MIM 601623). XAF1 противодействует антикаспазной активности XIAP и может играть важную роль в обеспечении устойчивости раковых клеток к апоптозу (Liston et al., 2001) [предоставлено OMIM]^[7]

Взаимодействия

XAF1 был показан взаимодействовать с участием XIAP.^[6]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132530 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040483 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Лиман Д.В., Чавла-Саркар М., Вьяс К., Рехеман М., Тамай К., Тоджи С., Борден ЕС (август 2002 г.). «Идентификация X-связанного ингибитора фактора-1, связанного с апоптозом, в качестве стимулированного интерфероном гена, который усиливает индуцированный TRAIL Apo2L апоптоз». J. Biol. Chem. 277 (32): 28504–11. Дои:10.1074 / jbc.M204851200. PMID 12029096.
^ ^а ^б Листон П., Фонг В.Г., Келли Н.Л., Тодзи С., Миядзаки Т., Конте Д., Тамай К., Крейг К.Г., МакБерни М.В., Корнелук Р.Г. (февраль 2001 г.). «Идентификация XAF1 как антагониста антикаспазной активности XIAP». Nat. Cell Biol. 3 (2): 128–33. Дои:10.1038/35055027. PMID 11175744. S2CID 19731886.
^ ^а ^б «Ген энтреса: фактор-1, связанный с XAF1 XIAP».

дальнейшее чтение

Фонг В.Г., Листон П., Раджкан-Сепарович Э., Сен-Жан М., Крейг С., Корнелюк Р.Г. (2000). «Экспрессия и генетический анализ XIAP-ассоциированного фактора 1 (XAF1) в линиях раковых клеток». Геномика. 70 (1): 113–22. Дои:10.1006 / geno.2000.6364. PMID 11087668.
Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Ray S, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (2002). «Анализ экспрессирующей последовательности меток сетчатки глаза человека для проекта NEIBank: ретбиндин, обильная новая кДНК сетчатки и альтернативный сплайсинг других транскриптов гена, предпочтительных для сетчатки». Мол. Vis. 8: 196–204. PMID 12107411.
Бён Д.С., Чо К, Рю Б.К., Ли М.Г., Кан MJ, Ким Х.Р., Чи С.Г. (2003). «Гиперметилирование XIAP-ассоциированного фактора 1, предполагаемого гена-супрессора опухоли из локуса 17p13.2, в аденокарциномах желудка человека». Рак Res. 63 (21): 7068–75. PMID 14612497.
Ng KC, Campos EI, Martinka M, Li G (2004). «Экспрессия XAF1 значительно снижена в меланоме человека». J. Invest. Дерматол. 123 (6): 1127–34. Дои:10.1111 / j.0022-202X.2004.23467.x. PMID 15610524.
Ван Дж, Хе Х, Ю Л, Ся ХХ, Линь М.С., Гу Кью, Ли М, Цзоу Б., Ань Х, Цзян Б., Кунг Х.Ф., Вонг BC (2006). «HSF1 подавляет XAF1 посредством регуляции транскрипции». J. Biol. Chem. 281 (5): 2451–9. Дои:10.1074 / jbc.M505890200. PMID 16303760.
Инь В., Чипала С., Клиффорд Дж. Л. (2006). «Идентификация нового варианта сплайсинга X-связанного ингибитора фактора 1, связанного с апоптозом». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 339 (4): 1148–54. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.11.128. PMID 16343440.
Фанг X, Лю З., Фан И, Чжэн С., Нильсон С., Эгевад Л., Экман П., Сюй Д. (2006). «Переключитесь на полноразмерную экспрессию мРНК XAF1 в клетках рака простаты с помощью ингибитора метилирования ДНК». Int. J. Рак. 118 (10): 2485–9. Дои:10.1002 / ijc.21636. PMID 16353137. S2CID 43629966.
Гилли Ф., Марнетто Ф., Кальдано М., Сала А., Малукки С., Капобианко М., Бертолотто А. (2006). «Биологические маркеры терапии интерфероном-бета: сравнение интерферон-стимулированных генов MxA, TRAIL и XAF-1». Mult. Scler. 12 (1): 47–57. Дои:10.1191 / 135248506ms1245oa. PMID 16459719. S2CID 34530563.
Reu FJ, Bae SI, Cherkassky L, Leaman DW, Lindner D, Beaulieu N, MacLeod AR, Borden EC (2006). «Преодоление устойчивости к интерферон-индуцированному апоптозу клеток почечной карциномы и меланомы путем деметилирования ДНК». J. Clin. Онкол. 24 (23): 3771–9. CiteSeerX 10.1.1.1025.9291. Дои:10.1200 / JCO.2005.03.4074. PMID 16801630.
Ли МГ, Ху Дж.С., Чунг С.К., Ли Дж.Х., Бён Д.С., Рю Б.К., Кан MJ, Чае К.С., Ли С.Дж., Ли СН, Ким Джи, Чанг С.Г., Чи С.Г. (2006). «Гиперметилирование промотора CpG и подавление экспрессии XAF1 при злокачественных новообразованиях мочеполовой системы человека: влияние на ослабленный ответ p53 на апоптотические стрессы». Онкоген. 25 (42): 5807–22. Дои:10.1038 / sj.onc.1209867. PMID 16909101.
Цзоу Б., Чим К.С., Цзэн Х., Люн С.И., Ян И, Ту С.П., Лин М.С., Ван Дж., Хе Х, Цзян С.Х., Сунь Ю.В., Ю Л.Ф., Юэнь С.Т., Кунг Х.Ф., Вонг BC (2006). «Корреляция между односайтовым метилированием CpG и подавлением экспрессии гена XAF1 при раке желудка и толстой кишки человека». Гастроэнтерология. 131 (6): 1835–43. Дои:10.1053 / j.gastro.2006.09.050. PMID 17087954.
Micali OC, Cheung HH, Plenchette S, Hurley SL, Liston P, LaCasse EC, Korneluk RG (2007). «Молчание гена XAF1 за счет гиперметилирования промотора в раковых клетках и реактивация к TRAIL-сенсибилизации с помощью IFN-бета». BMC Рак. 7: 52. Дои:10.1186/1471-2407-7-52. ЧВК 1845166. PMID 17376236.
Кемпкенштеффен С., Хинц С., Шредер М., Кристоф Ф., Магели А., Краузе Х., Шостак М., Миллер К., Вайкерт С. (2007). «Экспрессия генов и метилирование промотора XIAP-ассоциированного фактора 1 в почечно-клеточных карциномах: корреляция с патологией и исходом». Рак Lett. 254 (2): 227–35. Дои:10.1016 / j.canlet.2007.03.006. PMID 17449173.
Шибата Т., Махотка С., Веткамп Н., Хейкаус С., Габберт Х.Э., Рэмп У (2007). "Нарушение экспрессии регуляторов апоптоза XIAP, XAF1 и Smac / DIABLO в аденокарциномах желудка". Диаг. Мол. Патол. 16 (1): 1–8. Дои:10.1097 / 01.pdm.0000213471.92925.51. PMID 17471152. S2CID 43822747.
Чанг С.К., Ли М.Г., Рю Б.К., Ли Дж.Х., Хан Дж., Бён Д.С., Чае К.С., Ли К.Й., Чан Джи, Ким ХД, Чи С.Г. «Частое изменение XAF1 при колоректальном раке человека: влияние на устойчивость опухолевых клеток к апоптотическим стрессам». Гастроэнтерология. 132 (7): 2459–77. Дои:10.1053 / j.gastro.2007.04.024. PMID 17570219.
Арора В., Чунг Х. Х., Пленчетт С., Микали О. К., Листон П., Корнелюк Р. Г. (2007). «Распад сурвивина X-связанным ингибитором апоптоза (XIAP) -XAF1 комплексом». J. Biol. Chem. 282 (36): 26202–9. Дои:10.1074 / jbc.M700776200. PMID 17613533.

Эта статья о ген на хромосома человека 17 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132530 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040483 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid12029096-5] Лиман Д.В., Чавла-Саркар М., Вьяс К., Рехеман М., Тамай К., Тоджи С., Борден ЕС (август 2002 г.). «Идентификация X-связанного ингибитора фактора-1, связанного с апоптозом, в качестве стимулированного интерфероном гена, который усиливает индуцированный TRAIL Apo2L апоптоз». J. Biol. Chem. 277 (32): 28504–11. Дои:10.1074 / jbc.M204851200. PMID 12029096.

[pmid11175744-6] а ^б Листон П., Фонг В.Г., Келли Н.Л., Тодзи С., Миядзаки Т., Конте Д., Тамай К., Крейг К.Г., МакБерни М.В., Корнелук Р.Г. (февраль 2001 г.). «Идентификация XAF1 как антагониста антикаспазной активности XIAP». Nat. Cell Biol. 3 (2): 128–33. Дои:10.1038/35055027. PMID 11175744. S2CID 19731886.

[entrez-7] а ^б «Ген энтреса: фактор-1, связанный с XAF1 XIAP».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]