YKT6 - YKT6

YKT6
Идентификаторы
Псевдонимы	YKT6, YKT6 v-SNARE гомолог
Внешние идентификаторы	OMIM: 606209 MGI: 1927550 ГомолоГен: 4778 Генные карты: YKT6
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 7 (человек)
Конец	44,214,294 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	5,967,780 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• протеин-цистеин S-пальмитоилтрансферазная активность; • трансферазная активность; • Активность рецептора SNAP; • Привязка SNARE; • связывание кадгерина; • GO: 0001948 связывание с белками;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • неотъемлемый компонент мембраны; • эндосома; • аппарат Гольджи; • мембрана; • Мембрана Гольджи; • неотъемлемый компонент плазматической мембраны; • базилярный дендрит; • транспортная везикула; • тело нейрональной клетки; • Комплекс SNARE; • эндоплазматический ретикулум; • митохондрия; • мембрана цитоплазматических везикул; • эндоплазматический ретикулум - мембрана промежуточного отсека Гольджи; • цитоплазматический пузырек; • апикальный дендрит; • цитозоль;
Биологический процесс	• нацеливание на пузырьки; • стыковка пузырьков, участвующих в экзоцитозе; • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт; • ретроградный транспорт, эндосома к Гольджи; • транспорт белка; • слияние пузырьков; • везикулярный транспорт; • Липидный бислой слияния;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10652
	56418
	ENSG00000106636
	ENSMUSG00000002741
	O15498
	Q9CQW1
	NM_006555; NM_001363678
	NM_019661
	NP_006546; NP_001350607; NP_006546.1
	NP_062635
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Гомолог синаптобревина YKT6 это белок что у людей кодируется YKT6 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот генный продукт является одной из молекул распознавания SNARE, участвующих в везикулярном транспорте между секреторными компартментами. Это связанный с мембраной изопренилированный белок, который функционирует на этапе переноса эндоплазматического ретикулума и Гольджи. Этот белок является высококонсервативным от дрожжей до человека и может функционально компенсировать потерю дрожжевого гомолога в секреторном пути дрожжей.^[7]

Взаимодействия

YKT6 был показан взаимодействовать с участием BET1L.^[8]^[9]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106636 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002741 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Veit M (декабрь 2004 г.). «Человеческий белок SNARE Ykt6 опосредует собственное пальмитоилирование по C-концевым остаткам цистеина». Биохимический журнал. 384 (Pt 2): 233–7. Дои:10.1042 / BJ20041474. ЧВК 1134105. PMID 15479160.
^ Росси В., Банфилд Д.К., Вакка М., Дитрих Л.Е., Унгерманн К., Д'Эспозито М., Галли Т., Филиппини Ф. (декабрь 2004 г.). «Лонгины и их длинные домены: регулируемые SNARE и многофункциональные регуляторы SNARE». Тенденции в биохимических науках. 29 (12): 682–8. Дои:10.1016 / j.tibs.2004.10.002. PMID 15544955.
^ ^а ^б "Ген Entrez: YKT6 YKT6 v-SNARE гомолог (S. cerevisiae)".
^ Короче Дж., Борода М.Б., Земанн Дж., Дирак-Швейструп А.Б., Уоррен Дж. (Апрель 2002 г.). «Последовательное связывание Golgins и катализ сборки SNAREpin с помощью связывающего пузырьки белка p115». Журнал клеточной биологии. 157 (1): 45–62. Дои:10.1083 / jcb.200112127. ЧВК 2173270. PMID 11927603.
^ Сюй Ю., Мартин С., Джеймс Д.Э., Хонг В. (октябрь 2002 г.). «GS15 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Ykt6 и участвует в движении в ранних цистернах аппарата Гольджи» (PDF). Молекулярная биология клетки. 13 (10): 3493–507. Дои:10.1091 / mbc.E02-01-0004. ЧВК 129961. PMID 12388752.

дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
МакНью Дж. А., Согаард М., Лампен Н. М., Мачида С., Йе Р. Р., Лакомис Л., Темпст П., Ротман Дж. Э., Зёлльнер Т.Х. (июль 1997 г.). «Ykt6p, пренилированный SNARE, необходимый для транспорта эндоплазматического ретикулума-Гольджи». Журнал биологической химии. 272 (28): 17776–83. Дои:10.1074 / jbc.272.28.17776. PMID 9211930.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Tochio H, Tsui MM, Banfield DK, Zhang M (июль 2001 г.). «Аутоингибиторный механизм несинтаксиновых белков SNARE, выявленный структурой Ykt6p». Наука. 293 (5530): 698–702. Дои:10.1126 / science.1062950. PMID 11474112. S2CID 13618305.
Honer WG, Falkai P, Bayer TA, Xie J, Hu L, Li HY, Arango V, Mann JJ, Dwork AJ, Trimble WS (апрель 2002 г.). «Аномалии белков механизма SNARE в передней лобной коре при тяжелом психическом заболевании». Кора головного мозга. 12 (4): 349–56. Дои:10.1093 / cercor / 12.4.349. PMID 11884350.
Короче Дж., Борода М.Б., Земанн Дж., Дирак-Швейструп А.Б., Уоррен Дж. (Апрель 2002 г.). «Последовательное связывание Golgins и катализ сборки SNAREpin с помощью связывающего пузырьки белка p115». Журнал клеточной биологии. 157 (1): 45–62. Дои:10.1083 / jcb.200112127. ЧВК 2173270. PMID 11927603.
Сюй Ю., Мартин С., Джеймс Д.Э., Хонг В. (октябрь 2002 г.). «GS15 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Ykt6 и участвует в движении в ранних цистернах аппарата Гольджи» (PDF). Молекулярная биология клетки. 13 (10): 3493–507. Дои:10.1091 / mbc.E02-01-0004. ЧВК 129961. PMID 12388752.
Puri N, Kruhlak MJ, Whiteheart SW, Roche PA (ноябрь 2003 г.). «Дегрануляция тучных клеток требует разборки SNARE, опосредованной N-этилмалеимид-чувствительным фактором». Журнал иммунологии. 171 (10): 5345–52. Дои:10.4049 / jimmunol.171.10.5345. PMID 14607937.
Фукасава М., Варламов О., Энг В.С., Зёлльнер Т.Х., Ротман Дж. Э. (апрель 2004 г.). «Локализация и активность SNARE Ykt6 определяется его регуляторным доменом и пальмитоилированием». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (14): 4815–20. Дои:10.1073 / pnas.0401183101. ЧВК 387331. PMID 15044687.
Тай Джи, Лу Л., Ван Т.Л., Тан Б.Л., Гоуд Б., Йоханнес Л., Хонг В. (сентябрь 2004 г.). «Участие комплекса синтаксин 5 / Ykt6 / GS28 / GS15 SNARE в транспортировке от ранней / рециркулирующей эндосомы к сети транс-Гольджи». Молекулярная биология клетки. 15 (9): 4011–22. Дои:10.1091 / mbc.E03-12-0876. ЧВК 515336. PMID 15215310.
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
Окумура AJ, Hatsuzawa K, Tamura T., Nagaya H, Saeki K, Okumura F, Nagao K, Nishikawa M, Yoshimura A, Wada I (февраль 2006 г.). «Вовлечение нового Q-SNARE, D12, в контроль качества эндомембранной системы». Журнал биологической химии. 281 (7): 4495–506. Дои:10.1074 / jbc.M509715200. PMID 16354670.
Ooe A, Kato K, Noguchi S (март 2007 г.). «Возможное участие генов CCT5, RGS3 и YKT6, активируемых в опухолях с мутацией p53 в резистентности к доцетакселу при раке груди человека». Исследования и лечение рака груди. 101 (3): 305–15. Дои:10.1007 / s10549-006-9293-х. PMID 16821082. S2CID 2398124.

Эта статья о ген на хромосома человека 7 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106636 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002741 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid15479160-5] Veit M (декабрь 2004 г.). «Человеческий белок SNARE Ykt6 опосредует собственное пальмитоилирование по C-концевым остаткам цистеина». Биохимический журнал. 384 (Pt 2): 233–7. Дои:10.1042 / BJ20041474. ЧВК 1134105. PMID 15479160.

[pmid15544955-6] Росси В., Банфилд Д.К., Вакка М., Дитрих Л.Е., Унгерманн К., Д'Эспозито М., Галли Т., Филиппини Ф. (декабрь 2004 г.). «Лонгины и их длинные домены: регулируемые SNARE и многофункциональные регуляторы SNARE». Тенденции в биохимических науках. 29 (12): 682–8. Дои:10.1016 / j.tibs.2004.10.002. PMID 15544955.

[entrez-7] а ^б "Ген Entrez: YKT6 YKT6 v-SNARE гомолог (S. cerevisiae)".

[pmid11927603-8] Короче Дж., Борода М.Б., Земанн Дж., Дирак-Швейструп А.Б., Уоррен Дж. (Апрель 2002 г.). «Последовательное связывание Golgins и катализ сборки SNAREpin с помощью связывающего пузырьки белка p115». Журнал клеточной биологии. 157 (1): 45–62. Дои:10.1083 / jcb.200112127. ЧВК 2173270. PMID 11927603.

[pmid12388752-9] Сюй Ю., Мартин С., Джеймс Д.Э., Хонг В. (октябрь 2002 г.). «GS15 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Ykt6 и участвует в движении в ранних цистернах аппарата Гольджи» (PDF). Молекулярная биология клетки. 13 (10): 3493–507. Дои:10.1091 / mbc.E02-01-0004. ЧВК 129961. PMID 12388752.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]