YybP-ykoY лидер - YybP-ykoY leader

yybP-ykoY лидер
RF00080.jpg
Идентификаторы
СимволyybP-ykoY
Альт. СимволыSraF
РфамRF00080
Прочие данные
РНК типЦис-рег; рибопереключатель
Домен (ы)Бактерии
ТАКТАК: 0000233
PDB структурыPDBe

В yybP-ykoY лидер Элемент РНК был первоначально обнаружен в Кишечная палочка во время масштабного экрана и получила название SraF.[1] Позже выяснилось, что эта семья существует вверх по течению родственных семейств белковых генов у многих бактерий, включая гены yybP и ykoY в Б. subtilis. Конкретные функции этих белков неизвестны, но этот структурированный элемент РНК может участвовать в их генетической регуляции в качестве рибопереключатель.[2]В yybP-ykoY Позже было предложено, чтобы элемент был чувствительным к марганцу после другого связанного семейства генов, YebN / MntP, было показано, что кодирует Mn2+ отток перекачивает несколько бактерий.[3][4][5] Генетические данные и кристаллическая структура подтвердили, что yybp-ykoY марганцевый рибопереключатель, который напрямую связывает Mn2+[6][7]

Рекомендации

  1. ^ Аргаман Л., Хершберг Р., Фогель Дж., Бежерано Г., Вагнер Э.Г., Маргалит Х., Алтувия С. (июнь 2001 г.). «Новые гены, кодирующие малую РНК, в межгенных областях Escherichia coli». Текущая биология. 11 (12): 941–950. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00270-6. PMID  11448770.
  2. ^ Баррик Дж. Э., Корбино К. А., Винклер В. К., Нави А., Мандал М., Коллинз Дж., Ли М., Рот А., Сударсан Н., Йона И., Викизер Дж. К., Брейкер Р. Р. (апрель 2004 г.). «Новые мотивы РНК предполагают расширение возможностей рибопереключателей в генетическом контроле бактерий». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (17): 6421–6426. Дои:10.1073 / pnas.0308014101. ЧВК  404060. PMID  15096624.
  3. ^ Уотерс Л.С., Сандовал М., Сторц Г. (ноябрь 2011 г.). «Минирегулон MntR Escherichia coli включает гены, кодирующие небольшой белок и насос оттока, необходимый для гомеостаза марганца». Журнал бактериологии. 193 (21): 5887–5897. Дои:10.1128 / jb.05872-11. ЧВК  3194919. PMID  21908668.
  4. ^ Ли С, Тао Дж, Мао Д., Хэ С (2011). «Новая система оттока марганца, YebN, необходима для вирулентности Xanthomonas oryzae pv. Oryzae». PLOS ONE. 6 (7): e21983. Дои:10.1371 / journal.pone.0021983. ЧВК  3136493. PMID  21789199.
  5. ^ Veyrier FJ, Boneca IG, Cellier MF, Taha MK (сентябрь 2011 г.). «Новый переносчик металлов, опосредующий экспорт марганца (MntX), регулирует внутриклеточное соотношение Mn и Fe и вирулентность Neisseria meningitidis». PLoS Патогены. 7 (9): e1002261. Дои:10.1371 / journal.ppat.1002261. ЧВК  3182930. PMID  21980287.
  6. ^ Прайс IR, Габалла А., Дин Ф, Хельманн Дж. Д., Ке А. (март 2015 г.). «Mn (2 +) - сенсорные механизмы yybP-ykoY сиротских рибопереключателей». Молекулярная клетка. 57 (6): 1110–1123. Дои:10.1016 / j.molcel.2015.02.016. ЧВК  4703321. PMID  25794619.
  7. ^ Дамбах М., Сандовал М., Updegrove TB, Anantharaman V, Aravind L, Waters LS, Storz G (март 2015 г.). «Вездесущий рибопереключатель yybP-ykoY является регулирующим элементом, чувствительным к марганцу». Молекулярная клетка. 57 (6): 1099–1109. Дои:10.1016 / j.molcel.2015.01.035. ЧВК  4376352. PMID  25794618.

внешняя ссылка