Zixibacteria - Википедия - Zixibacteria

Зиксибактерии это бактериальный тип с кандидат статус, то есть у него не было культурных представителей.[1]. Он является членом Группа FCB[2]

Зиксибактерии были предложены как бактериальный тип после восстановления генома из репрезентативного RBG-1.[1]. Этот геном был восстановлен с использованием метода разрешения генома. метагеномика из образцов донных отложений водоносного горизонта, прилегающего к реке Колорадо (Колорадо, США), и свидетельствует о метаболической гибкости, которая предположительно необходима для жизни в быстро меняющейся среде, такой как отложения водоносного горизонта[1]

С тех пор, как в 2013 году был предложен тип Zixibacteria, представители этого типа были обнаружены во множестве других сред (иногда задним числом), включая подземные отложения (Вашингтон, США).[3], вода устья (Северная Каролина, США)[4]залежи в пещере лунного молока (Комблен-о-Пон, Бельгия)[5], и жидкости глубокого разрыва пласта из золотого рудника (SD, США)[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c Кастель, Синди Дж .; Hug, Laura A .; Wrighton, Kelly C .; Томас, Брайан Ч .; Уильямс, Кеннет Х .; У, Дунъин; Триндж, Сюзанна Дж .; Певец, Стивен У .; Эйзен, Джонатан А .; Банфилд, Джиллиан Ф. (27 августа 2013 г.). «Исключительное филогенетическое разнообразие и метаболическая универсальность в отложениях водоносного горизонта». Nature Communications. 4 (1): 2120. Дои:10.1038 / ncomms3120. ISSN  2041-1723. ЧВК  3903129. PMID  23979677.
  2. ^ «Таксономия - кандидат подразделения Zixibacteria». Сервер таксономии Uniprot. 25 мая 2018. Получено 17 мая 2020.
  3. ^ Линь, Сюэджу; Кеннеди, Дэвид; Фредриксон, Джим; Бьорнстад, Брюс; Конопка, Аллан (2012). «Вертикальная стратификация состава подповерхностного микробного сообщества по геологическим образованиям на участке Хэнфорд». Экологическая микробиология. 14 (2): 414–425. Дои:10.1111 / j.1462-2920.2011.02659.x. ISSN  1462-2920. PMID  22122741.
  4. ^ Бейкер, Бретт Дж .; Лазар, Кассандра Сара; Теске, Андреас П .; Дик, Грегори Дж. (13 апреля 2015 г.). «Геномное разрешение связей в круговороте углерода, азота и серы среди широко распространенных бактерий в эстуарных отложениях». Микробиом. 3 (1): 14. Дои:10.1186 / s40168-015-0077-6. ISSN  2049-2618. ЧВК  4411801. PMID  25922666.
  5. ^ Мацеевска, Марта; Калусинская, Магдалена; Корнет, Люк; Адам, Дельфина; Песси, Игорь С .; Малчере, Сандрин; Дельфосс, Филипп; Борайн, Денис; Barton, Hazel A .; Карнол, Моник; Ригали, Себастьен (21 марта 2018 г.). «Высокопроизводительный секвенированный анализ пространственного разнообразия актинобактерий в отложениях лунного молока». Антибиотики. 7 (2): 27. Дои:10.3390 / антибиотики7020027. ISSN  2079-6382. ЧВК  6023079. PMID  29561792.
  6. ^ Момпер, Лили; Jungbluth, Sean P .; Ли, Майкл Д .; Amend, Ян П. (октябрь 2017 г.). «Энергетический и углеродный метаболизм в микробном сообществе глубинных подземных флюидов». Журнал ISME. 11 (10): 2319–2333. Дои:10.1038 / ismej.2017.94. ISSN  1751-7370. ЧВК  5607374. PMID  28644444.