APBA2 - APBA2

APBA2
Идентификаторы
Псевдонимы	APBA2, D15S1518E, HsT16821, LIN-10, MGC: 14091, MINT2, X11-BETA, X11L, белок-предшественник бета-амилоида, связывающий семейство A, член 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602712 MGI: 1261791 ГомолоГен: 4021 Генные карты: APBA2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 15 (человек)
Конец	29,118,315 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	64,753,878 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание бета-амилоида; • GO: 0001948 связывание с белками; • идентичное связывание с белками;
Сотовый компонент	• клеточная мембрана; • синаптический пузырек; • Коллатераль Шаффера - синапс CA1; • цитоплазма; • дендритный позвоночник; • синапс;
Биологический процесс	• регуляция экспрессии генов; • транспорт белка; • внутриутробное эмбриональное развитие; • двигательное поведение; • развитие нервной системы; • рост многоклеточного организма; • химическая синаптическая передача; • регуляция экзоцитоза синаптических везикул;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	321
	11784
	ENSG00000034053; ENSG00000276495
	ENSMUSG00000030519
	Q99767
	P98084
NM_001130414; NM_005503; NM_001353788; NM_001353789; NM_001353790;
	NM_001353791; NM_001353792; NM_001353793; NM_001353794; NM_001353795; NM_001353796; NM_001353797; NM_001379685
	NM_001291166; NM_001291167; NM_007461
NP_001123886; NP_005494; NP_001340717; NP_001340718; NP_001340719;
	NP_001340720; NP_001340721; NP_001340722; NP_001340723; NP_001340724; NP_001340725; NP_001340726; NP_001366614
	NP_001278095; NP_001278096; NP_031487
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Семейство A, связывающее белок-предшественник амилоида A4, член 2 это белок что у людей кодируется APBA2 ген.^[5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков X11. Это нейронный адаптерный белок, который взаимодействует с белком-предшественником амилоида (АРР) болезни Альцгеймера. Он стабилизирует АРР и ингибирует выработку протеолитических фрагментов АРР, включая пептид А-бета, который откладывается в мозге пациентов с болезнью Альцгеймера. Считается, что этот генный продукт участвует в процессах передачи сигнала. Он также считается предполагаемым везикулярным транспортным белком в головном мозге, который может образовывать комплекс, способный связывать экзоцитоз синаптических везикул с адгезией нейрональных клеток.^[6]

Взаимодействия

APBA2 был показан взаимодействовать с участием CLSTN1,^[7]^[8] РЕЛА^[9] и Белок-предшественник амилоида.^[7]^[10]^[11]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ENSG00000276495 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000034053, ENSG00000276495 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030519 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ McLoughlin DM, Miller CC (январь 1997 г.). «Внутриклеточный цитоплазматический домен белка-предшественника амилоида болезни Альцгеймера взаимодействует с белками фосфотирозин-связывающего домена в дрожжевой двугибридной системе». FEBS Lett. 397 (2–3): 197–200. Дои:10.1016 / S0014-5793 (96) 01128-3. PMID 8955346.
^ ^а ^б «Ген Entrez: связывание белка-предшественника бета-амилоида APBA2 (A4), семейство A, член 2 (X11-подобный)».
^ ^а ^б Араки Й., Томита С., Ямагути Х., Мияги Н., Сумиока А., Кирино Ю., Сузуки Т. (декабрь 2003 г.). «Новые связанные с кадгерином мембранные белки, алькадеины, усиливают опосредованную X11-подобным белком стабилизацию метаболизма предшественников бета-амилоидных белков». J. Biol. Chem. 278 (49): 49448–58. Дои:10.1074 / jbc.M306024200. PMID 12972431.
^ Араки Ю., Мияги Н., Като Н., Йошида Т., Вада С., Нисимура М., Комано Н., Ямамото Т., Де Строопер Б., Ямамото К., Сузуки Т. (июнь 2004 г.). «Скоординированный метаболизм алькадеина и предшественника бета-белка амилоида регулирует трансактивацию генов, зависимую от FE65». J. Biol. Chem. 279 (23): 24343–54. Дои:10.1074 / jbc.M401925200. PMID 15037614.
^ Tomita S, Fujita T, Kirino Y, Suzuki T (апрель 2000 г.). «Зависимое от PDZ-домена подавление продукции Abeta42, индуцированной NF-kappaB / p65, нейрон-специфическим X11-подобным белком». J. Biol. Chem. 275 (17): 13056–60. Дои:10.1074 / jbc.C000019200. PMID 10777610.
^ Бидерер Т., Цао Х, Зюдхоф ТК, Лю Х (сентябрь 2002 г.). «Регулирование APP-зависимых транскрипционных комплексов с помощью Mint / X11s: дифференциальные функции изоформ Mint». J. Neurosci. 22 (17): 7340–51. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.22-17-07340.2002. PMID 12196555.
^ Томита С., Одзаки Т., Тару Х., Огучи С., Такеда С., Яги Й., Сакияма С., Кирино Ю., Сузуки Т. (январь 1999 г.). «Взаимодействие нейрон-специфического белка, содержащего PDZ-домены, с белком-предшественником амилоида болезни Альцгеймера». J. Biol. Chem. 274 (4): 2243–54. Дои:10.1074 / jbc.274.4.2243. PMID 9890987.

внешние ссылки

Человек APBA2 расположение генома и APBA2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

ван дер Гир П., Поусон Т. (1995). «Домен PTB: новый белковый модуль, участвующий в передаче сигнала». Trends Biochem. Наука. 20 (7): 277–80. Дои:10.1016 / S0968-0004 (00) 89043-X. PMID 7545337.
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Ю. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК 139146. PMID 9110174.
Окамото М., Зюдхоф ТК (1998). «Mints, Munc18-взаимодействующие белки в экзоцитозе синаптических везикул». J. Biol. Chem. 272 (50): 31459–64. Дои:10.1074 / jbc.272.50.31459. PMID 9395480.
Бланко Г., Ирвинг Н.Г., Браун С.Д., Миллер С.С., Маклафлин Д.М. (1998). «Картирование человеческих и мышиных X11-подобных генов (APBA2 и apba2), мышиного гена Fe65 (Apbb1) и человеческого Fe65-подобного гена (APBB2): гены, кодирующие белки фосфотирозин-связывающего домена, которые взаимодействуют с амилоидом болезни Альцгеймера. белок-предшественник ». Мамм. Геном. 9 (6): 473–5. Дои:10.1007 / s003359900800. PMID 9585438.
Борг Дж. П., Ян Й, Де Таддео-Борг М., Марголис Б., Тернер Р. С. (1998). «Белок X11alpha замедляет процессинг клеточного белка-предшественника амилоида и снижает секрецию Abeta40 и Abeta42». J. Biol. Chem. 273 (24): 14761–6. Дои:10.1074 / jbc.273.24.14761. PMID 9614075.
Borg JP, Straight SW, Kaech SM, de Taddéo-Borg M, Kroon DE, Karnak D, Turner RS, Kim SK, Margolis B (1998). «Идентификация эволюционно консервативного гетеротримерного белкового комплекса, участвующего в нацеливании на белок». J. Biol. Chem. 273 (48): 31633–6. Дои:10.1074 / jbc.273.48.31633. PMID 9822620.
Окамото М., Зюдхоф ТК (1999). «Мята 3: повсеместная изоформа мяты, которая не связывается с munc18-1 или -2». Евро. J. Cell Biol. 77 (3): 161–5. Дои:10.1016 / s0171-9335 (98) 80103-9. PMID 9860131.
Томита С., Одзаки Т., Тару Х., Огучи С., Такеда С., Яги Ю., Сакияма С., Кирино Ю., Сузуки Т. (1999). «Взаимодействие нейрон-специфического белка, содержащего PDZ-домены, с белком-предшественником амилоида болезни Альцгеймера». J. Biol. Chem. 274 (4): 2243–54. Дои:10.1074 / jbc.274.4.2243. PMID 9890987.
Маклафлин Д.М., Ирвинг Н.Г., Браунлис Дж., Брион Дж. П., Лерой К., Миллер С.К. (1999). «Mint2 / X11-подобный совместно локализуется с белком-предшественником амилоида болезни Альцгеймера и связан с нейритными бляшками при болезни Альцгеймера». Евро. J. Neurosci. 11 (6): 1988–94. Дои:10.1046 / j.1460-9568.1999.00610.x. PMID 10336668.
Томита С., Фудзита Т., Кирино Ю., Сузуки Т. (2000). «Зависимое от PDZ-домена подавление индуцированного NF-kappaB / p65 производства Abeta42 нейрон-специфическим X11-подобным белком». J. Biol. Chem. 275 (17): 13056–60. Дои:10.1074 / jbc.C000019200. PMID 10777610.
Готтхардт М., Троммсдорф М., Невитт М.Ф., Шелтон Дж., Ричардсон Дж. А., Стокингер В., Нимпф Дж., Герц Дж. (2000). «Взаимодействие семейства генов рецепторов липопротеинов низкой плотности с цитозольным адаптером и белками каркаса предполагает различные биологические функции в клеточной коммуникации и передаче сигналов». J. Biol. Chem. 275 (33): 25616–24. Дои:10.1074 / jbc.M000955200. PMID 10827173.
Ли Д.С., Томита С., Кирино Ю., Сузуки Т. (2000). «Регулирование X11L-зависимого метаболизма белка-предшественника амилоида с помощью XB51, нового X11L-связывающего белка». J. Biol. Chem. 275 (30): 23134–8. Дои:10.1074 / jbc.C000302200. PMID 10833507.
Бидерер Т., Зюдхоф ТК (2001). «Мяты как адаптеры. Прямое связывание с нейрексинами и рекрутирование munc18». J. Biol. Chem. 275 (51): 39803–6. Дои:10.1074 / jbc.C000656200. PMID 11036064.
Лау KF, McLoughlin DM, Standen C, Miller CC (2001). «X11 альфа и х11 бета взаимодействуют с пресенилином-1 через свои PDZ-домены». Мол. Cell. Неврологи. 16 (5): 557–65. Дои:10.1006 / mcne.2000.0898. PMID 11083918.
Сатклифф Дж.С., Хан М.К., Амин Т., Кестерсон Р.А., Нурми Е.Л. (2003). «Частичная дупликация гена APBA2 в хромосоме 15q13 соответствует дупликонным структурам». BMC Genomics. 4 (1): 15. Дои:10.1186/1471-2164-4-15. ЧВК 156605. PMID 12720574.
Сумиока А., Имото С., Мартинс Р. Н., Кирино Ю., Сузуки Т. (2003). «Изоформы XB51 опосредуют выработку бета-амилоидного пептида болезни Альцгеймера с помощью X11L (X11-подобного белка) -зависимых и независимых механизмов». Biochem. J. 374 (Пт 1): 261–8. Дои:10.1042 / BJ20030489. ЧВК 1223589. PMID 12780348.

Эта статья о ген на хромосома человека 15 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000276495 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000034053, ENSG00000276495 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030519 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8955346-5] McLoughlin DM, Miller CC (январь 1997 г.). «Внутриклеточный цитоплазматический домен белка-предшественника амилоида болезни Альцгеймера взаимодействует с белками фосфотирозин-связывающего домена в дрожжевой двугибридной системе». FEBS Lett. 397 (2–3): 197–200. Дои:10.1016 / S0014-5793 (96) 01128-3. PMID 8955346.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: связывание белка-предшественника бета-амилоида APBA2 (A4), семейство A, член 2 (X11-подобный)».

[pmid12972431-7] а ^б Араки Й., Томита С., Ямагути Х., Мияги Н., Сумиока А., Кирино Ю., Сузуки Т. (декабрь 2003 г.). «Новые связанные с кадгерином мембранные белки, алькадеины, усиливают опосредованную X11-подобным белком стабилизацию метаболизма предшественников бета-амилоидных белков». J. Biol. Chem. 278 (49): 49448–58. Дои:10.1074 / jbc.M306024200. PMID 12972431.

[pmid15037614-8] Араки Ю., Мияги Н., Като Н., Йошида Т., Вада С., Нисимура М., Комано Н., Ямамото Т., Де Строопер Б., Ямамото К., Сузуки Т. (июнь 2004 г.). «Скоординированный метаболизм алькадеина и предшественника бета-белка амилоида регулирует трансактивацию генов, зависимую от FE65». J. Biol. Chem. 279 (23): 24343–54. Дои:10.1074 / jbc.M401925200. PMID 15037614.

[pmid10777610-9] Tomita S, Fujita T, Kirino Y, Suzuki T (апрель 2000 г.). «Зависимое от PDZ-домена подавление продукции Abeta42, индуцированной NF-kappaB / p65, нейрон-специфическим X11-подобным белком». J. Biol. Chem. 275 (17): 13056–60. Дои:10.1074 / jbc.C000019200. PMID 10777610.

[pmid12196555-10] Бидерер Т., Цао Х, Зюдхоф ТК, Лю Х (сентябрь 2002 г.). «Регулирование APP-зависимых транскрипционных комплексов с помощью Mint / X11s: дифференциальные функции изоформ Mint». J. Neurosci. 22 (17): 7340–51. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.22-17-07340.2002. PMID 12196555.

[pmid9890987-11] Томита С., Одзаки Т., Тару Х., Огучи С., Такеда С., Яги Й., Сакияма С., Кирино Ю., Сузуки Т. (январь 1999 г.). «Взаимодействие нейрон-специфического белка, содержащего PDZ-домены, с белком-предшественником амилоида болезни Альцгеймера». J. Biol. Chem. 274 (4): 2243–54. Дои:10.1074 / jbc.274.4.2243. PMID 9890987.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]