AnimalBase - AnimalBase

AnimalBase это проект, воплощенный в жизнь в 2004 году и поддерживаемый Геттингенский университет, Германия. Цель проекта AnimalBase - оцифровать раннюю зоологическую литературу без авторских прав. открытый доступ к зоологическим работам и предоставить проверенные вручную списки названий зоологических роды и разновидность как бесплатный ресурс для общественности. AnimalBase внесла свой вклад в открытие классической таксономической литературы, которая считается полезной, потому что доступ к ранней литературе (особенно конца 18 века) может быть затруднен для исследователей, которым нужны старые источники для их изучения. таксономические исследования.[1]

Данные AnimalBase всеобщее достояние. Публичное использование данных AnimalBase не ограничено и не обусловлено.[2]AnimalBase охватывает все зоологические дисциплины. В области информатика биоразнообразия AnimalBase уникальна тем, что предоставляет ссылки между названиями общих и конкретных таксоны и их оцифрованные оригинальные описания с особым акцентом на литературу и имена, опубликованные до 1800 года.

История

Проект был начат в 2003 году при финансировании Немецкий исследовательский фонд (DFG). База данных и ее веб-интерфейс начали разрабатываться в 2004 году и были запущены в Интернете в 2005 году. Веб-интерфейс был разработан так, чтобы быть доступным для старшего поколения компьютеры и веб-браузеры. В период с 2003 по 2005 годы около 400 зоологических публикаций с 1550 по 1770 годы были оцифрованы, а 10 000 связанных зоологических названий были включены в базу данных. Вторая попытка (2008–2011 гг.) Включала дополнительную оцифрованную литературу, дающую доступ к еще нескольким десяти тысячам зоологических названий, которые были извлечены из оригинальных источников и связаны с их оцифрованными оригинальными описаниями.

Оцифровка и ссылки на оцифрованную литературу из других источников

Ранние зоологические публикации оцифровываются в соответствии с высочайшими стандартами качества Центром ретроспективной оцифровки в Геттингене (Göttinger Digitalisierungszentrum, ГДЗ) Геттингенская государственная и университетская библиотека (Staats- und Universitätsbibliothek Göttingen, SUB), которая является одной из крупнейших библиотек Германии, в которой содержится более 4,5 миллионов томов. Если возможно, AnimalBase также предоставляет ссылки на оцифрованные всеобщее достояние контент других поставщиков, например Библиотека наследия биоразнообразия (BHL) или Галлика.

Извлечение таксономических названий из литературы

Зоологические названия родовых и специфических таксонов, которые были установлены в ранних зоологических публикациях, были вручную введены в базу данных, включая оригинальные и исправленные написания названий, типовые местности и номера страниц, на которых эти имена были первоначально введены в публикациях. Кроме того, имена были сопоставлены с записями в Чарльз Дэвис Шерборн с Index Animalium (1902, 1922–1933) и Номенклатор Zoologicus Автор: Neave (1939/1940, обновлено). Номенклатурный статус имен подтвержден действующей редакцией Международный кодекс зоологической номенклатуры (МКЗН). Возможные расхождения между старыми базами данных и результатами исследования названий AnimalBase (т.е. приоритет или неправильное написание) иногда обсуждались в комментариях, предоставленных для каждого таксона. Весь процесс соответствует установленному стандарту AnimalBase.

Стандарт AnimalBase

Конкретные и родовые названия таксонов вводятся вручную со ссылкой на исходное описание. Базовая запись названия таксона соответствует стандарту AnimalBase, который состоит из следующих рекомендаций:

  • Правильное первоначальное написание родового и специфического названий проверяется в соответствии с номенклатурными правилами (Кодекс ICZN, текущая редакция).
  • Конкретные названия вводятся строго в сочетании с родом, к которому они были отнесены в первоначальном описании. В тех случаях, когда родовое имя было неправильно написано автором, установившим конкретное имя, команда AnimalBase сочетает конкретное имя с правильным написанием этого рода.
  • Дополнительно вводятся случайно неправильные исходные написания названия таксона (т. Е. Отличные от правильного написания) с сохранением первоначального использования диакритические знаки, лигирования, заглавные буквы для конкретных названий, дефисы, пробелы между словами, неправильное последующее написание родового названия в комбинации род-вид, используемой автором.
  • Предоставляется имя автора, написанное в соответствии с именем, указанным на титульном листе первоисточника (примеры: Linnus 1758, Линне 1766).
  • Предоставляется год или дата публикации в соответствии с правилами номенклатуры (истинная дата публикации).
  • Предоставляется гендерный подход (изменяемые или неизменяемые конкретные имена, согласно постклассическому латинский грамматические правила). Часто бывает сложно определить, является ли латинское имя прилагательным или нет, поэтому полученные в результате записи в AnimalBase этих данных могут быть ненадежными на 100%.
  • Предоставляется ссылка на оцифрованную публикацию с оригинальным описанием.
  • Предоставляется страница исходного описания названия таксона (это страница, на которой название было впервые упомянуто и стало доступным). Если описываемое животное изображено на табличках с фигурками и без имени, упомянутого на табличках, это не обязательно указано.
  • Типовая локализация предоставляется, как указано в исходном описании, если она легко узнаваема или может быть косвенно выведена из произведения. Эта процедура может быть неточной (поскольку местонахождение типа - это местность, откуда произошли именованные типы, которые не исследуются командой AnimalBase), но, безусловно, предоставляет полезную информацию.
  • Высшая группа животных, в которой находится таксон. классифицированный предоставляется (тип, класс, отряд или аналогично клады).
  • Записи сравниваются с Index Animalium и (в случае родов) с Nomenclator Zoologicus. Неправильные записи (последующее использование ранее установленных имен, которые Шерборн часто неверно указывал как новые или nomina nuda ) и неправильное написание имен в этих базах данных не копируются в AnimalBase, если обнаруживаются как таковые.
  • Неправильное последующее написание обычно не считается новым таксоном, но может быть указано как недоступное и обсуждаться, если название было упомянуто как новое название в Index Animalium или имеет какое-либо иное значение.
  • Все группы животных обрабатываются последовательно в соответствии с правилами ICZN (названия рыб соответствуют тем же правилам, что и названия насекомых).

Стандарт AnimalBase позволяет легко получить доступ к первичным данным исходного описания. Команда AnimalBase не выравнивает написание или авторство каждого первоначально установленного названия с теми, которые содержатся в различных зоологических базах данных, специализированных по дисциплинам или регионам. Основная задача AnimalBase - предоставить ссылки на оцифрованные оригинальные описания, но с ней также можно ознакомиться для правильного написания и авторства зоологических названий. В этом отношении AnimalBase может потенциально предоставить полезное обновление индекса Animalium Шерборна.

AnimalBase также предоставляет возможность комбинировать исходные названия с их текущими присвоениями (текущие комбинации род-вид). Например, подробная биологическая информация и изображения доступны для 2500 видов европейских неморских моллюски, который включает более 6000 фотографий. AnimalBase - это совместный проект с открытыми ресурсами; все зарегистрированные соавторы могут исправлять или вводить данные. Это включает в себя загрузка картинки (без авторских прав ) видов животных, биологические данные, включая измерения и диагностические признаки, данные распределения, электрический ток сохранение статус и т. д. Изображения и данные, предоставленные AnimalBase, прямо разрешены для использования на других веб-сайтах (скопированы или связаны).[нужна цитата ]

Рекомендации

  1. ^ Холден, С. 2007. Netwatch: таксономия, первые годы. - Наука 315: с. 1643.
  2. ^ Проектная группа AnimalBase, 2005-2010. AnimalBase. Ранняя зоологическая литература в Интернете. Электронное издание в Интернете http://www.animalbase.uni-goettingen.de по состоянию на 30 июля 2010 г.

внешняя ссылка