Биорепозиторий - Википедия - Biorepository

А биорепозиторий это биологические материалы репозиторий, который собирает, обрабатывает, хранит и распространяет биопробы для поддержки будущих научных исследований[1] Биохранилища могут содержать образцы животных, включая людей, и многих других живых организмов или управлять ими. Позвоночные, беспозвоночные, членистоногие, и другие формы жизни - это лишь некоторые из многих классов живых организмов, которые можно изучать, сохраняя и храня взятые образцы.

Цель

Цель биорепозитория - хранить биологические образцы и связанную с ними информацию для будущего использования в исследованиях. Биорепозиторий обеспечивает качество и управляет доступностью и распределением / размещением биологических образцов в своей коллекции.

Операции

Четыре основных операции биорепозитория: (i) сбор, (ii) обработка, (iii) хранение или инвентаризация, и (iv) распределение биологических образцов.

(i) Сбор или присоединение - это первая операция, при которой образцы регистрируются как поступившие. Сегодня это обычно выполняется путем сканирования образца штрих-кода с помощью устройства сканирования штрих-кода. Информация об образце передается в систему управления лабораторной информацией («LIMS»). Типичные собранные данные будут источником данных выборки и регистрации данных / времени прибытия в LIMS.

(ii) Обработка образцов обычно представляет собой процесс проверки качества, который выполняется одинаково для каждого из образцов, чтобы минимизировать отклонения из-за обработки образцов и подготовить образец для хранения. Обычно этот процесс облегчает долгосрочное хранение образцов определенного типа - например, образцы ДНК обрабатываются в солевом буфере (водном растворе) с надлежащим pH для стабилизации ДНК для хранения.

(iii) Хранение и инвентаризация - это место, где хранятся все образцы до того, как они будут запрошены посредством запроса на распространение. Система инвентаризации состоит из ящиков для хранения образцов, которые хранятся в морозильных камерах различного типа в зависимости от требований к хранению образцов.

(iv) Распространение - это процесс извлечения одного или нескольких образцов из системы инвентаризации биорепозитория.

Стандартные рабочие процедуры

Стандартные операционные процедуры (СОП) играют решающую роль в индустрии биорепозиториев. Они важны по ряду причин:

  • СОП снижают вероятность появления проблемных переменных в образцах и процессах хранения, предоставляя стандартизированные рекомендации по надлежащему хранению и уходу.[2]
  • Образцы биопрепаратов должны быть очень похожи на биопрепараты в их естественном состоянии. СОПы помогают в этом.
  • СОП представляют собой стандартизированную основу для проведения операций в биохранилище. Они обеспечивают бесперебойную и надежную реализацию всех операций.[3]

Важные биорепозитории

Репозиторий ДНК и клеточных линий NINDS Human Genetics

Репозиторий ДНК и клеточных линий NINDS Human Genetics ориентирован на открытие генов как способ определения генетических причин состояний, влияющих на нервную систему. Образцы берутся у пациентов с эпилепсией, цереброваскулярным заболеванием, заболеванием двигательных нейронов, синдромом Туретта и паркинсонизмом. Также собираются контрольные образцы.

Репозиторий генетических клеток человека NIGMS

Репозиторий генетических клеток человека NIGMS предоставляет ресурсы для генетических и клеточных исследований. Образцы включают четко очерченные клеточные линии и высококачественную ДНК, которые демонстрируют множество хромосомных аномалий, болезненных состояний и внешне здоровых людей.

Репозиторий стареющих клеток NIA

Хранилище клеток старения NIA помогает проводить молекулярные и клеточные исследования причин старения и механизмов дегенерации, с которыми они связаны. Ячейки в этих отчетах были собраны за последние 30 лет с использованием строгих диагностических критериев. Исследователи используют эти жизнеспособные и хорошо охарактеризованные культуры для проведения исследований таких заболеваний, как паркинсонизм, синдром Вернера, болезнь Альцгеймера и Прогерия.

Репозиторий плюрипотентных стволовых клеток человека (hPSC) CIRM

Репозиторий плюрипотентных стволовых клеток человека (hPSC) CIRM - это большой репозиторий с сотнями различных линий плюрипотентных стволовых клеток, созданных для лечения многих заболеваний. К ним относятся расстройства аутистического спектра и другие нарушения нервного развития, болезнь Альцгеймера, болезни слепящих глаз, болезни легких, печени и сердца, а также контрольные образцы.

Хранилище образцов NHGRI для генетических исследований человека

В апреле 2003 года хранилище образцов NHGRI для генетических исследований человека успешно завершило секвенирование генома человека. Их миссия сейчас - принять участие в широком спектре исследований, направленных на понимание функции и структуры этого генома и его роли в здоровье и болезнях.

Коллекция клеток Аллена

Коллекция клеток Аллена - это источник индуцированных человеком плюрипотентных стволовых клеток, происходящих из родительской линии WTC-11, в которой информация о пациенте не идентифицирована.

Ресурсы по исследованию аутизма

Ресурс по исследованиям аутизма, финансируемый штатом Нью-Джерси, был создан для поддержки исследований аутизма в семьях, где один ребенок страдает, а другой проявляет признаки связанного с ним значительного нарушения развития или где затронуты несколько детей.

Американская диабетическая ассоциация, исследование GENNID

Целью исследования GENNID Американской диабетической ассоциации является создание банка клеток и национальной базы данных, состоящей из генетического материала и информации из известных семей с инсулинозависимым диабетом. Центр предоставляет исследователям образцы и информацию, необходимую для проведения исследований генетической связи и поиска генов этого состояния.

Репозиторий CHDI

ДНК Хантингтона доступны в репозитории CHDI, и вскоре будут доступны другие белки, такие как антигенные пептиды и антитела, а также клеточные линии.

Хранилище клеток и ДНК CDC

Образцы ДНК, полученные из трансформированных клеточных линий, для использования в молекулярно-генетическом тестировании, доступны в Программе координации эталонных материалов для генетического тестирования Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC). Эти образцы взяты из таких болезней, как болезнь Хантингтона, муковисцидоз, синдром ломкой Х-хромосомы, альфа-талассемия и синдром Мюнке.

Репозиторий USIDNET

Репозиторий USIDNET был создан для предоставления функциональных лимфоидных клеток и ДНК, полученных от пациентов с многочисленными заболеваниями, связанными с первичным иммунодефицитом. К ним относятся редкие нарушения, связанные с функцией иммунных клеток, и нарушения, вызванные нарушениями комплемента, антител и других механизмов иммунной системы.

Эталонный геном человека Института Дж. Крейга Вентера (HuRef)

Справочный геном человека Института Дж. Крейга Вентера (HuRef) предоставляет ДНК от Дж. Крейга Вентера, чей геном был секвенирован и собран. Образцы ДНК получают из линии лимфобластоидных клеток из образца периферической крови человека.

Генетический репозиторий NEI-AREDS

Генетический репозиторий NEI-AREDS был создан для того, чтобы выяснить, как развиваются и прогрессируют катаракта и дегенерация желтого пятна, поскольку они являются двумя из основных причин потери зрения у пожилых людей. В исследовании также были проверены определенные минералы и витамины, чтобы определить, могут ли они помочь замедлить или предотвратить эти состояния.[4]

Межгорный биорепозиторийБиорепозиторий Intermountain - лучший в своем классе биобанк, созданный Intermountain в 1970-х годах. Межгорный биорепозиторий - один из самых больших и наиболее полных доступных биохранилищ. хранит более 4,5 миллионов биологических образцов, сохраненных в формалине и залитых парафином. Эти исторические образцы имеют возраст 10 лет и старше и больше не используются для оказания немедленной клинической помощи.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Информационный бюллетень ISBER, том №1, выпуск №1
  2. ^ «Геномная медицина: стандартные операционные процедуры (СОП) биобанков». Внутри биобанкинга. 2015-12-08. Получено 2017-10-16.
  3. ^ «Важность стандартных операционных процедур (SOPS) в биобанкинге». Биорепозиторий. Получено 2017-10-16.
  4. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2017-10-07. Получено 2017-10-07.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)

внешняя ссылка