CD300LF - CD300LF

CD300LF
Белок CD300LF PDB 2nms.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыCD300LF, CD300f, CLM-1, CLM1, IREM-1, IREM1, IgSF13, LMIR3, NKIR, молекула CD300, как член семейства f
Внешние идентификаторыOMIM: 609807 MGI: 2442359 ГомолоГен: 51396 Генные карты: CD300LF
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение CD300LF
Геномное расположение CD300LF
Группа17q25.1Начинать74,694,311 бп[1]
Конец74,712,978 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001169153
NM_145634
NM_001347648

RefSeq (белок)

NP_001162624
NP_001334577
NP_663609

Расположение (UCSC)Chr 17: 74.69 - 74.71 МбChr 11: 115.12 - 115.13 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

CMRF35-подобная молекула 1, также известный как CD300lf, это белок что у человека кодируется CD300LF ген.[5][6] CD300lf принадлежит к семейству белков CD300. CD300lf - это мембрана гликопротеин который содержит иммоноглобулин домен и выражается миелоидный и тучные клетки[7] человека и других млекопитающих. Белок функционирует в иммунорегуляция[8] но может также сыграть роль в норовирус инфекции.

CD300lf и норовирусы

Было показано, что CD300lf действует как первичный рецептор для мышиный норовирус у мышей,[9][10] Человек норовирус не использует тот же рецептор при проникновении вируса.[11] Белки CD300lf человека и мыши примерно на 59% идентичны по своему составу. иммуноглобулин домены, причем большая часть этого изменения происходит в частях белка, называемых CDR3 и CC’loop.[12] Мышиный норовирус связывается с щелью между этими домены. Различия между мышиным и человеческим CD300lf способствуют развитию мышей норовирус хозяин ограничение видов, так как включение мышиного CD300lf в человеческие клетки делает их восприимчивыми к заражению мышиным вирусом.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186074 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000047798 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Кларк Х.Ф., Гурни А.Л., Абая Э., Бейкер К., Болдуин Д., Браш Дж. И др. (Октябрь 2003 г.). «Инициатива по открытию секретируемого белка (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: биоинформатическая оценка». Геномные исследования. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
  6. ^ «Ген Entrez: CD300LF, член семейства CD300, подобный молекуле f».
  7. ^ «CD300LF - предшественник CMRF35-подобной молекулы 1 - Homo sapiens (Человек) - ген и белок CD300LF». www.uniprot.org. Получено 2019-03-16.
  8. ^ Восс О., Тиан Л., Мураками Ю., Колиган Д. Е., Кшевски К. (02.10.2015). «Возникающая роль рецепторов CD300 в регуляции эффероцитоза миелоидных клеток». Молекулярная и клеточная онкология. 2 (4): e964625. Дои:10.4161/23723548.2014.964625. ЧВК  4905414. PMID  27308512.
  9. ^ Nelson CA, Wilen CB, Dai YN, Orchard RC, Kim AS, Stegeman RA, Hsieh LL, Smith TJ, Virgin HW, Fremont DH (сентябрь 2018 г.). «Структурная основа взаимодействия мышиного норовируса желчных кислот и рецептора CD300lf». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 115 (39): E9201 – E9210. Дои:10.1073 / pnas.1805797115. ЧВК  6166816. PMID  30194229.
  10. ^ а б Orchard RC, Wilen CB, Doench JG, Baldridge MT, McCune BT, Lee YC, Lee S, Pruett-Miller SM, Nelson CA, Fremont DH, Virgin HW (август 2016 г.). «Открытие белкового клеточного рецептора норовируса». Наука. 353 (6302): 933–6. Дои:10.1126 / science.aaf1220. ЧВК  5484048. PMID  27540007.
  11. ^ Graziano VR, Walker FC, Kennedy EA, Wei J, Ettayebi K, Strine MS и др. (Апрель 2020 г.). «CD300lf является основным физиологическим рецептором норовируса мыши, но не норовируса человека». Патогены PLOS. 16 (4): e1008242. Дои:10.1371 / journal.ppat.1008242. ЧВК  7162533. PMID  32251490.
  12. ^ Маркес Дж. А., Гальфре Э, Дупе Ф, Флот Д, Моран О, Димаси Н. (март 2007 г.). «Кристаллическая структура внеклеточного домена рецептора ингибитора, экспрессируемого на миелоидных клетках IREM-1». Журнал молекулярной биологии. 367 (2): 310–8. Дои:10.1016 / j.jmb.2007.01.011. PMID  17275839.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка