Кубилин - Cubilin

CUBN
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыCUBN, IFCR, MGA1, gp280, кубилин, IGS, IGS1
Внешние идентификаторыOMIM: 602997 MGI: 1931256 ГомолоГен: 37434 Генные карты: CUBN
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное местоположение для CUBN
Геномное местоположение для CUBN
Группа10п13Начинать16,823,966 бп[1]
Конец17,129,811 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CUBN 206775 в формате fs.png

PBB GE CUBN gnf1h06087 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001081

NM_001081084

RefSeq (белок)

NP_001072

NP_001074553

Расположение (UCSC)Chr 10: 16,82 - 17,13 МбChr 2: 13.28 - 13.49 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Кубилин это белок что у людей кодируется CUBN ген.[5][6][7]

Функция

Кубилин (CUBN) действует как рецептор внутреннего фактора витамина B12 комплексы. Роль рецептора подтверждается наличием 27 доменов CUB. Кубилин демонстрирует ограниченный способ экспрессии в соответствии с анализами белкового профиля и транскриптомики,[8] и по существу присутствует только в почках и тонком кишечнике.[9] Мутации в CUBN могут играть роль в аутосомно-рецессивной мегалобластной анемии.[7] Комплекс безжалостный и кубилин образует кубам рецептор.

Клиническое значение

Кубилин - это потенциал диагностический и прогностический биомаркер рака при раке почки.[10] Основываясь на данных о выживаемости пациентов, высокий уровень кубилина в опухолевых клетках является благоприятным прогностический биомаркер в карцинома почек.[11][12]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000107611 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000026726 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Козыраки Р., Кристиансен М., Силахтароглу А., Хансен С., Якобсен С., Томмеруп Н., Верруст П.Дж., Моэструп С.К. (июнь 1998 г.). "Внутренний фактор человека - витамин B12 рецептор, кубилин: молекулярная характеристика и хромосомное картирование гена 10p в области аутосомно-рецессивной мегалобластной анемии (MGA1) ». Кровь. 91 (10): 3593–600. Дои:10.1182 / blood.V91.10.3593. PMID  9572993.
  6. ^ Моэструп С.К., Козыраки Р., Кристиансен М., Кайсен Дж. Х., Расмуссен Х. Х., Браулт Д., Понтильон Ф., Года Ф. О., Кристенсен Е. И., Хаммонд Т. Г., Верруст П. Дж. (Март 1998 г.). «Внутренний фактор - витамин B12 рецептор и мишень тератогенных антител представляет собой мегалин-связывающий периферический мембранный белок, гомологичный онтогенетическим белкам ». J Biol Chem. 273 (9): 5235–42. Дои:10.1074 / jbc.273.9.5235. PMID  9478979.
  7. ^ а б «Энтрез Ген: кубилин CUBN (рецептор внутреннего фактора кобаламина)».
  8. ^ Улен, Матиас; Фагерберг, Линн; Hallström, Björn M .; Линдског, Сесилия; Оксволд, Пер; Мардиноглу, Адиль; Сивертссон, Аса; Кампф, Кэролайн; Шёстедт, Эвелина (23 января 2015 г.). «Тканевая карта протеома человека». Наука. 347 (6220): 1260419. Дои:10.1126 / science.1260419. ISSN  0036-8075. PMID  25613900. S2CID  802377.
  9. ^ "Тканевая экспрессия CUBN - Резюме - Атлас человеческого белка". www.proteinatlas.org. Получено 2017-09-06.
  10. ^ Гремель, Габриэла; Джуреинович, Дияна; Ниинивирта, Марджут; Лэрд, Александр; Юнгквист, Оскар; Йоханнессон, Хенрик; Бергман, Юлия; Эдквист, Пер-Хенрик; Навани, Санджай (04.01.2017). «Стратегия систематического поиска определяет кубилин как независимый прогностический маркер почечно-клеточной карциномы». BMC Рак. 17 (1): 9. Дои:10.1186 / s12885-016-3030-6. ISSN  1471-2407. ЧВК  5215231. PMID  28052770.
  11. ^ Улен, Матиас; Чжан, Ченг; Ли, Сунджэ; Шёстедт, Эвелина; Фагерберг, Линн; Бидхори, Голамреза; Бенфейтас, Руи; Ариф, Мухаммад; Лю, Чжэнтао (18.08.2017). «Атлас патологии транскриптома рака человека». Наука. 357 (6352): eaan2507. Дои:10.1126 / science.aan2507. ISSN  0036-8075. PMID  28818916.
  12. ^ «Экспрессия CUBN при раке почек - Атлас человеческого белка». www.proteinatlas.org. Получено 2017-09-06.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: O60494 (Кубилин) в PDBe-KB.