DCTN1 - DCTN1

DCTN1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1TXQ, 2COY, 2HKN, 2HKQ, 2HL3, 2HL5, 2HQH, 3E2U, 3TQ7
Идентификаторы
Псевдонимы	DCTN1, DAP-150, DP-150, P135, динактин субъединица 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601143 MGI: 107745 ГомолоГен: 3011 Генные карты: DCTN1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 2 (человек)
Конец	74,392,087 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	83,200,117 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • клеточно-двигательная активность; • связывание микротрубочек; • связывание тубулина; • связывание динеинового комплекса; • связывание протеинкиназы; • связывание тау-белка;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • центросома; • мембрана; • динактиновый комплекс; • Retromer; • передний край ячейки; • динеиновый комплекс; • микротрубочки; • цитоскелет; • кинетохора; • центр организации микротрубочек; • ядро клетки; • ядерная оболочка; • центриоль; • шпиндель; • цитозоль; • актиновый цитоскелет; • плюс-конец микротрубочки; • полюс шпинделя; • область коры клеток; • клеточная кора; • комплекс, связанный с микротрубочками; • аксон; • проекция нейрона; • тело нейрональной клетки; • цитоскелет промежуточных филаментов; • центриолярный субдистальный придаток;
Биологический процесс	• процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II; • развитие нервной системы; • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт; • транспорт по микротрубочке; • IRE1-опосредованный ответ развернутого белка; • ретроградный транспорт, эндосома к Гольджи; • G2 / M переход митотического клеточного цикла; • меланосомный транспорт; • центриоль-центриольное сцепление; • положительное регулирование полимеризации микротрубочек; • закрепление микротрубочек на центросоме; • разборка ядерной оболочки; • положительная регуляция зарождения микротрубочек; • стыковка цилиарного базального тела; • неподвижная сборка ресничек; • GO: 0007067 митотический клеточный цикл; • установление ориентации митотического веретена; • регуляция организации митотического веретена; • клеточный цикл; • деление клеток; • регуляция G2 / M перехода митотического клеточного цикла; • транспорт; • развитие нервно-мышечного соединения; • развитие вентрального спинного мозга; • нервно-мышечный процесс; • моторное поведение; • нейронно-клеточный гомеостаз; • аксональный транспорт; • поддержание структуры синапсов; • положительная регуляция развития нервно-мышечных соединений; • поддержание проекции нейронов;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1639
	13191
	ENSG00000204843
	ENSMUSG00000031865
	Q14203
	O08788
NM_001135040; NM_001135041; NM_001190836; NM_001190837; NM_004082;
	NM_023019; NM_001378991; NM_001378992
	NM_001198866; NM_001198867; NM_007835; NM_001347310
NP_001128512; NP_001128513; NP_001177765; NP_001177766; NP_004073;
	NP_075408; NP_001365920; NP_001365921
	NP_001185795; NP_001185796; NP_001334239; NP_031861
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Субъединица динактина 1 это белок что у людей кодируется DCTN1 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует самый большой подразделение из динактин, макромолекулярный комплекс, состоящий из 23 субъединиц (11 индивидуальных белков размером от 22 до 150 кДа).^[6] Динактин связывается с цитоплазматическим динеин, грузовые адаптеры dynein и микротрубочки.^[7] Он участвует в разнообразных клеточных функциях, включая: ER -к-Гольджи транспорт, центростремительное движение лизосомы и эндосомы, формирование шпинделя, движение хромосом, ядерное позиционирование и аксоногенез.

Эту субъединицу обычно называют p150-склеенной.^[5] Он присутствует в двух копиях на динактиновый комплекс и образует гибкую ветвь длиной ≈75 нм, отходящую от основной части динактина.^[6] Плечо с клеем p150 содержит сайты связывания для микротрубочек,^[8] микротрубочка плюс белок связывания кончика EB1,^[9] и N-конец промежуточной цепи динеина.^[10]^[11]

Альтернативный сплайсинг этого гена приводит по крайней мере к двум функционально различным изоформам: экспрессируемой повсеместно и специфичной для мозга. Основываясь на его цитогенетическом расположении, этот ген считается геном-кандидатом для мышечной дистрофии конечностей и поясов.^[12]

Взаимодействия

DCTN1 был показан взаимодействовать с:

дальнейшее чтение

Waterman-Storer CM, Karki S, Holzbaur EL (февраль 1995 г.). «Компонент p150Glued динактинового комплекса связывается как с микротрубочками, так и с актиновым белком центрактином (Arp-1)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (5): 1634–8. Дои:10.1073 / pnas.92.5.1634. ЧВК 42574. PMID 7878030.
Паскаль Б.М., Хольцбаур Е.Л., Пфистер К.К., Кларк С., Мейер Д.И., Валле РБ (июль 1993 г.). «Характеристика полипептида 50 кДа в препаратах цитоплазматического динеина выявляет комплекс с p150GLUED и новым актином». Журнал биологической химии. 268 (20): 15318–23. PMID 8325901.
Vaughan KT, Vallee RB (декабрь 1995 г.). «Цитоплазматический динеин связывает динактин посредством прямого взаимодействия между промежуточными цепями и p150Glued». Журнал клеточной биологии. 131 (6 Pt 1): 1507–16. Дои:10.1083 / jcb.131.6.1507. ЧВК 2120689. PMID 8522607.
Holzbaur EL, Tokito MK (февраль 1996 г.). «Локализация гена DCTN1, кодирующего p150, приклеенного к хромосоме 2p13 человека путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика. 31 (3): 398–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0068. PMID 8838327.
Токито М.К., Хауленд Д.С., Ли В.М., Хольцбаур Е.Л. (август 1996 г.). «Функционально различные изоформы динактина экспрессируются в нейронах человека». Молекулярная биология клетки. 7 (8): 1167–80. Дои:10.1091 / mbc.7.8.1167. ЧВК 275970. PMID 8856662.
Сахни М., Чжоу XM, Бакири Л., Шлессингер Дж., Барон Р., Леви Дж. Б. (декабрь 1996 г.). «Идентификация нового 135-кДа Grb2-связывающего белка в остеокластах». Журнал биологической химии. 271 (51): 33141–7. Дои:10.1074 / jbc.271.51.33141. PMID 8955163.
Бланги А., Арно Л., Нигг Е.А. (август 1997 г.). «Фосфорилирование протеинкиназой p34cdc2 регулирует связывание связанного с кинезином моторного HsEg5 с субъединицей динактина p150». Журнал биологической химии. 272 (31): 19418–24. Дои:10.1074 / jbc.272.31.19418. PMID 9235942.
Кортхаус Д., Ведемейер Н., Ленгелинг А., Ронсик М., Джокуш Г., Шмитт-Джон Т. (июль 1997 г.). «Интегрированная радиационная гибридная карта хромосомы 2p13 человека: возможное участие динактина в нервно-мышечных заболеваниях». Геномика. 43 (2): 242–4. Дои:10.1006 / geno.1997.4789. PMID 9244444.
Уотерман-Сторер CM, Карки С.Б., Кузнецов С.А., Табб Дж.С., Вайс Д.Г., Лэнгфорд Г.М., Хольцбаур Е.Л. (октябрь 1997 г.). «Взаимодействие между цитоплазматическим динеином и динактином необходимо для быстрого аксонального транспорта». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (22): 12180–5. Дои:10.1073 / пнас.94.22.12180. ЧВК 23743. PMID 9342383.
Engelender S, Sharp AH, Colomer V, Tokito MK, Lanahan A, Worley P, Holzbaur EL, Ross CA (декабрь 1997 г.). «Связанный с гентингтином белок 1 (HAP1) взаимодействует с p150Glued субъединицей динактина». Молекулярная генетика человека. 6 (13): 2205–12. Дои:10.1093 / hmg / 6.13.2205. PMID 9361024.
Ли Ш., Gutekunst CA, Херш С.М., Ли XJ (февраль 1998 г.). «Взаимодействие белка, ассоциированного с хантингтином, с динактином P150Glued». Журнал неврологии. 18 (4): 1261–9. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.18-04-01261.1998. ЧВК 6792727. PMID 9454836.
Карки С., Ламонте Б., Хольцбаур Е.Л. (август 1998 г.). «Характеристика субъединицы p22 динактина выявляет локализацию цитоплазматического динеина и динактина в среднем теле делящихся клеток». Журнал клеточной биологии. 142 (4): 1023–34. Дои:10.1083 / jcb.142.4.1023. ЧВК 2132867. PMID 9722614.
Коллин Г.Б., Нишина П.М., Маршалл Дж. Д., Наггерт Дж. К. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий DCTN1: геномная структура и оценка как кандидат на синдром Альстрёма». Геномика. 53 (3): 359–64. Дои:10.1006 / geno.1998.5542. PMID 9799602.
Tokito MK, Holzbaur EL (ноябрь 1998 г.). «Геномная структура DCTN1, гена-кандидата для мышечной дистрофии конечностей и пояса (LGMD2B)». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1442 (2–3): 432–6. Дои:10.1016 / S0167-4781 (98) 00195-X. PMID 9805007.
Bingham JB, Schroer TA (февраль 1999 г.). «Саморегулируемая полимеризация актинового белка Arp1». Текущая биология. 9 (4): 223–6. Дои:10.1016 / S0960-9822 (99) 80095-5. PMID 10074429. S2CID 208851.
Хайманн К., Персиваль Дж. М., Вайнбергер Р., Ганнинг П., Стоу Дж. Л. (апрель 1999 г.). «Специфические изоформы актин-связывающих белков на различных популяциях везикул, полученных из Гольджи». Журнал биологической химии. 274 (16): 10743–50. Дои:10.1074 / jbc.274.16.10743. PMID 10196146.
Eckley DM, Gill SR, Melkonian KA, Bingham JB, Goodson HV, Heuser JE, Schroer TA (октябрь 1999 г.). «Анализ субкомплексов динактина показывает новый родственный актину белок, связанный с заостренным концом минифиламента arp1». Журнал клеточной биологии. 147 (2): 307–20. Дои:10.1083 / jcb.147.2.307. ЧВК 2174220. PMID 10525537.
Карки С., Токито М.К., Хольцбаур Е.Л. (февраль 2000 г.). «Субъединица динактина с высококонсервативным мотивом, богатым цистеином, напрямую взаимодействует с Arp1». Журнал биологической химии. 275 (7): 4834–9. Дои:10.1074 / jbc.275.7.4834. PMID 10671518.
Vancoillie G, Lambert J, Haeghen YV, Westbroek W., Mulder A, Koerten HK, Mommaas AM, Van Oostveldt P, Naeyaert JM (декабрь 2000 г.). «Совместная локализация динактиновых субъединиц P150Glued и P50 с меланосомами в нормальных меланоцитах человека». Исследование пигментных клеток. 13 (6): 449–57. Дои:10.1034 / j.1600-0749.2000.130607.x. PMID 11153697.

внешняя ссылка

GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о синдроме Перри

Эта статья о ген на хромосома 2 человека это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000204843 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031865 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1828535-5] а ^б Holzbaur EL, Hammarback JA, Paschal BM, Kravit NG, Pfister KK, Vallee RB (июнь 1991 г.). «Гомология 150K цитоплазматического динеин-ассоциированного полипептида с геном Drosophila Glued». Природа. 351 (6327): 579–83. Дои:10.1038 / 351579a0. PMID 1828535. S2CID 4263574.

[:0-6] а ^б Urnavicius L, Zhang K, Diamant AG, Motz C, Schlager MA, Yu M, Patel NA, Robinson CV, Carter AP (март 2015 г.). «Структура динактинового комплекса и его взаимодействие с динеином». Наука. 347 (6229): 1441–1446. Дои:10.1126 / science.aaa4080. ЧВК 4413427. PMID 25814576.

[7] Чианфрокко М.А., ДеСантис М.Э., Лешцинер А.Э., Рек-Петерсон С.Л. (2015). «Механизм и регуляция цитоплазматического динеина». Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития. 31: 83–108. Дои:10.1146 / annurev-cellbio-100814-125438. ЧВК 4644480. PMID 26436706.

[8] Waterman-Storer CM, Karki S, Holzbaur EL (февраль 1995 г.). «Компонент p150Glued динактинового комплекса связывается как с микротрубочками, так и с актиновым белком центрактином (Arp-1)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (5): 1634–8. Дои:10.1073 / pnas.92.5.1634. ЧВК 42574. PMID 7878030.

[9] Berrueta L, Tirnauer JS, Schuyler SC, Pellman D, Bierer BE (апрель 1999 г.). «APC-ассоциированный белок EB1 ассоциируется с компонентами динактинового комплекса и промежуточной цепи цитоплазматического динеина». Текущая биология. 9 (8): 425–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (99) 80190-0. PMID 10226031. S2CID 14191776.

[10] Карки С., Хольцбаур Е.Л. (декабрь 1995 г.). «Аффинная хроматография демонстрирует прямое связывание между цитоплазматическим динеином и динактиновым комплексом». Журнал биологической химии. 270 (48): 28806–11. Дои:10.1074 / jbc.270.48.28806. PMID 7499404.

[11] Vaughan KT, Vallee RB (декабрь 1995 г.). «Цитоплазматический динеин связывает динактин посредством прямого взаимодействия между промежуточными цепями и p150Glued». Журнал клеточной биологии. 131 (6 Pt 1): 1507–16. Дои:10.1083 / jcb.131.6.1507. ЧВК 2120689. PMID 8522607.

[entrez-12] «Ген Entrez: DCTN1 динактин 1 (p150, склеенный гомолог, Drosophila)».

[pmid15107855-13] Ким Дж. К., Бадано Дж. Л., Сиболд С., Эсмаил М. А., Хилл Дж., Хоскинс Б. Э., Лейтч С. К., Веннер К., Ансли С. Дж., Росс А. Дж., Леру М. Р., Катсанис Н., Билз П. Л. (май 2004 г.). «Белок Барде-Бидла BBS4 направляет груз в перицентриолярную область и необходим для закрепления микротрубочек и развития клеточного цикла». Природа Генетика. 36 (5): 462–70. Дои:10,1038 / ng1352. PMID 15107855.

[pmid14581450-14] Лю Дж.Дж., Дин Дж., Коваль А.С., Нардин Т., Аллен Э., Делькруа Д.Д., Ву С., Мобли В., Фукс Э., Ян Й. (октябрь 2003 г.). «BPAG1n4 необходим для ретроградного аксонального транспорта в сенсорных нейронах». Журнал клеточной биологии. 163 (2): 223–9. Дои:10.1083 / jcb.200306075. ЧВК 2173519. PMID 14581450.

[pmid8955163-15] Сахни М., Чжоу XM, Бакири Л., Шлессингер Дж., Барон Р., Леви Дж. Б. (декабрь 1996 г.). «Идентификация нового 135-кДа Grb2-связывающего белка в остеокластах». Журнал биологической химии. 271 (51): 33141–7. Дои:10.1074 / jbc.271.51.33141. PMID 8955163.

[pmid12401177-16] Short B, Preisinger C, Schaletzky J, Kopajtich R, Barr FA (октябрь 2002 г.). «Rab6 GTPase регулирует рекрутирование динактинового комплекса на мембраны Гольджи». Текущая биология. 12 (20): 1792–5. Дои:10.1016 / s0960-9822 (02) 01221-6. PMID 12401177. S2CID 14031165.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

DCTN1 - DCTN1

Содержание

Функция

Взаимодействия

Рекомендации

дальнейшее чтение

внешняя ссылка