DDX6 - Википедия - DDX6

DDX6
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1VEC, 2 ВОСК, 2 ПУТИ, 4CRW, 4CT4, 4CT5, 5ANR
Идентификаторы
Псевдонимы	DDX6, HLR2, P54, RCK, DEAD-бокс-геликаза 6, IDDILF, Rck / p54
Внешние идентификаторы	OMIM: 600326 MGI: 104976 ГомолоГен: 3238 Генные карты: DDX6
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 11 (человек)
Конец	118,791,164 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 9 (мышь)
Конец	44,640,731 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• РНК-геликазная активность; • связывание нуклеотидов; • GO: 0008026 геликазная активность; • специфическое связывание белкового домена; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание нуклеиновой кислоты; • гидролазная активность; • Связывание АТФ; • Связывание РНК; • связывание кадгерина;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • RISC комплекс; • мембрана; • П-боди; • Гранула стресса; • митохондрия; • кольцо спермы; • Гранула P; • внешнее плотное волокно; • гетерохроматин; • ядро клетки; • цитозоль; • ядрышко; • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина; • хроматоидное тело; • перинуклеарная область цитоплазмы; • вогнутая сторона головки сперматозоида;
Биологический процесс	• отрицательная регуляция дифференцировки нейронов; • поддержание популяции стволовых клеток; • Раскрутка вторичной структуры РНК; • сборка тела цитоплазматической мРНК; • экзонуклеолитическая транскрибируемая ядерной мРНК катаболический процесс, вовлеченный в зависимый от деаденилирования распад; • упаковка генома вирусной РНК; • регулирование перевода; • сперматогенез; • дифференциация сперматид;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1656
	13209
	ENSG00000110367
	ENSMUSG00000032097
	P26196
	P54823
	NM_001257191; NM_004397
	NM_001110826; NM_007841; NM_181324; NM_001357702; NM_001357703
	NP_001244120; NP_004388
	NP_001104296; NP_031867; NP_851841; NP_001344631; NP_001344632
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Вероятная АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX6 является фермент что у людей кодируется DDX6 ген.^[5]^[6]

МЕРТВАЯ коробка белки, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), являются предполагаемыми РНК-геликазами. Они вовлечены в ряд клеточных процессов, связанных с изменением Вторичная структура РНК такие как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг и рибосома и сплайсосома сборка. Судя по структуре их распространения, некоторые члены этого семейства участвуют в эмбриогенез, сперматогенез, и рост клеток и деление. Этот ген кодирует белок DEAD-бокса. Это может способствовать распространение клеток и канцерогенез.^[6]

дальнейшее чтение

Акао Ю., Сето М., Ямамото К. и др. (1992). «Ген RCK, связанный с транслокацией t (11; 14), отличается от гена MLL / ALL-1 с транслокациями t (4; 11) и t (11; 19)». Рак Res. 52 (21): 6083–7. PMID 1394235.
Акао Ю., Марукава О., Морикава Х. и др. (1995). «Продукт-кандидат в протоонкоген rck / p54 представляет собой 54-килодальтонный белок D-E-A-D-бокса, дифференциально экспрессируемый в тканях человека и мыши». Рак Res. 55 (15): 3444–9. PMID 7614484.
Чжан WJ, Wu JY (1996). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсинге». Мол. Клетка. Биол. 16 (10): 5400–8. Дои:10.1128 / MCB.16.10.5400. ЧВК 231539. PMID 8816452.
Акияма К., Акао Ю., Ёкояма М. и др. (1999). «Экспрессия двух генов мертвого ящика (DDX1 и DDX6) не зависит от экспрессии MYCN в клеточных линиях нейробластомы человека». Biochem. Мол. Биол. Int. 47 (4): 563–8. Дои:10.1080/15216549900201603. PMID 10319407. S2CID 45609314.
Накагава Й., Морикава Х., Хирата И. и др. (1999). «Сверхэкспрессия rck / p54, белка DEAD-бокса, в колоректальных опухолях человека». Br. J. Рак. 80 (5–6): 914–7. Дои:10.1038 / sj.bjc.6690441. ЧВК 2362290. PMID 10360675.
Смилли Д.А., Соммервилл Дж. (2002). «РНК-геликаза p54 (DDX6) представляет собой белок-челнок, участвующий в ядерной сборке хранимых частиц мРНП». J. Cell Sci. 115 (Pt 2): 395–407. PMID 11839790.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Миядзи К., Накагава Ю., Мацумото К. и др. (2003). «Сверхэкспрессия DEAD-бокса / РНК-геликазы, rck / p54, в гепатоцитах человека от пациентов с хроническим гепатитом, связанным с вирусом гепатита С, и его влияние на гепатоцеллюлярный канцерогенез». J. Viral Hepat. 10 (4): 241–8. Дои:10.1046 / j.1365-2893.2003.00447.x. PMID 12823589. S2CID 36830183.
Мацуи Т., Хогецу К., Акао Ю. и др. (2004). «Кристаллизация и рентгеновский анализ N-концевого основного домена опухоль-ассоциированной человеческой DEAD-бокс-РНК-геликазы, rck / p54». Acta Crystallogr. D. 60 (Пт 1): 156–9. Дои:10.1107 / S0907444903024223. PMID 14684915.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Fenger-Grøn M, Fillman C, Norrild B, Lykke-Andersen J (2006). «Множественные процессинговые факторы организма и ARE-связывающий белок TTP активируют декапирование мРНК». Мол. Клетка. 20 (6): 905–15. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.10.031. PMID 16364915.
Мацуи Т., Хогецу К., Усукура Дж. И др. (2006). «Структурное понимание человеческого DEAD-бокс-белка rck / p54 в его распознавании субстрата с конформационными изменениями». Гены Клетки. 11 (4): 439–52. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2006.00951.x. PMID 16611246. S2CID 29643976.
Вичроски MJ, Робб GB, Rana TM (2006). "Факторы рестрикции человеческого ретровируса APOBEC3G и APOBEC3F локализуются в телах, обрабатывающих мРНК". PLOS Pathog. 2 (5): e41. Дои:10.1371 / journal.ppat.0020041. ЧВК 1458959. PMID 16699599.
Чу CY, Rana TM (2006). «Репрессия трансляции в человеческих клетках с помощью гена, индуцированного микроРНК, требует RCK / p54». ПЛОС Биол. 4 (7): e210. Дои:10.1371 / journal.pbio.0040210. ЧВК 1475773. PMID 16756390.
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
Нонхофф У., Ралсер М., Вельцель Ф. и др. (2007). «Атаксин-2 взаимодействует с DEAD / H-Box РНК-геликазой DDX6 и вмешивается в Р-тела и стрессовые гранулы». Мол. Биол. Клетка. 18 (4): 1385–96. Дои:10.1091 / mbc.E06-12-1120. ЧВК 1838996. PMID 17392519.

Эта статья о ген на хромосома человека 11 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110367 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032097 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1579499-5] Лу Д., Юнис Дж. Дж. (Июнь 1992 г.). «Клонирование, экспрессия и локализация гена РНК-геликазы из линии лимфоидных клеток человека с хромосомной точкой разрыва 11q23.3». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (8): 1967–72. Дои:10.1093 / nar / 20.8.1967. ЧВК 312313. PMID 1579499.

[entrez-6] а ^б "Ген Entrez: полипептид 6 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) DDX6".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

DDX6 - Википедия - DDX6

Рекомендации

дальнейшее чтение