Снижение метилирования ДНК I (DDM1) - Decrease in DNA Methylation I (DDM1)

DDM1, Снижение метилирования ДНК I, является растительным геном, который кодирует ремоделирующую нуклеосому, которая способствует Метилирование ДНК. Ген DDM1 подробно описан в Arabidopsis thaliana а также в кукуруза. Было описано, что белок подобен белкам ремоделирования хроматина SWI2 / SNF2.[1]

Поскольку метилирование ДНК происходит в основном в сменные элементы (TE),[2] DDM1, как полагают, играет решающую роль в подавлении звука TE.

Arabidopsis thaliana (A. thaliana)

DDM1 необходим для метилирования ДНК в гетерохроматин сменные элементы.[3] Поэтому DDM1 часто заглушает мобильные элементы, но мутации в Arabidopsis thaliana не является смертельным для эмбриона.[3] Мутанты DDM1 также были описаны как эпигенетическая связь между производством салициловой кислоты и гетерозис.[4] A. thaliana имеет единственную копию гена DDM1.

Кукуруза

DDM1 изучается на кукурузе. В отличие от A. thaliana, кукуруза имеет две копии гена: CHR101 и CHR106.[5] У кукурузы двойной мутант DDM1 приводит к летальному исходу для эмбриона. Однако другие исследования используют гетерозигота мутант. Геном кукурузы на 80% состоит из транспозонов.[6] поэтому функция DDM1 очень важна.

Рекомендации

  1. ^ Чо, Ын Джу; Чхве, Сын Хи; Ким, Джи Хонг; Ким, Джи Ын; Ли, Мин Хи; Чанг, Бён Йеуп; Ву, Хе Рён; Ким, Джин-Хонг; Кандела, Гектор (11 января 2016 г.). «Мутация в специфичных для растений SWI2 / SNF2-подобных белках ремоделирования хроматина, DRD1 и DDM1, задерживает старение листьев у Arabidopsis thaliana». PLOS ONE. 11 (1): e0146826. Дои:10.1371 / journal.pone.0146826. ЧВК  4709239. PMID  26752684.
  2. ^ Закон, Джули А.; Якобсен, Стивен Э. (март 2010 г.). «Установление, поддержание и изменение паттернов метилирования ДНК у растений и животных». Природа Обзоры Генетика. 11 (3): 204–220. Дои:10.1038 / nrg2719. ISSN  1471-0056. ЧВК  3034103. PMID  20142834.
  3. ^ а б Земах, Ассаф; Ким, М. Ивонн; Се, Пинг-Хунг; Коулман-Дерр, Девин; Эшед-Уильямс, Леор; Тао, Ка; Хармер, Стейси Л .; Зильберман, Даниил (март 2013). «Ремоделлер нуклеосом арабидопсиса DDM1 позволяет ДНК-метилтрансферазам получать доступ к H1-содержащему гетерохроматину». Клетка. 153 (1): 193–205. Дои:10.1016 / j.cell.2013.02.033. ЧВК  4035305. PMID  23540698.
  4. ^ Чжан, Цинчжу; Ли, Яньцян; Сюй, Дао; Шривастава, Ашиш Кумар; Ван, Донг; Цзэн, Лян; Ян, Лань; Он, Ли; Чжан, Хэн (декабрь 2016 г.). «Ремоделирующий хроматин DDM1 способствует гибкости гибридов, регулируя метаболизм салициловой кислоты». Cell Discovery. 2 (1): 16027. Дои:10.1038 / celldisc.2016.27. ISSN  2056-5968. ЧВК  4977722. PMID  27551435.
  5. ^ Ли, Цин; Eichten, Steven R .; Германсон, Питер Дж .; Zaunbrecher, Virginia M .; Сонг, Джавон; Вендт, Дженнифер; Розенбаум, Хайди; Madzima, Thelma F .; Слоан, Эми Э. (декабрь 2014 г.). «Генетические нарушения метилома кукурузы». Растительная клетка. 26 (12): 4602–4616. Дои:10.1105 / tpc.114.133140. ISSN  1040-4651. ЧВК  4311211. PMID  25527708.
  6. ^ Schnable, P. S .; Посуда, Д .; Fulton, R. S .; Stein, J.C .; Wei, F .; Пастернак, С .; Liang, C .; Zhang, J .; Фултон, Л. (20 ноября 2009 г.). «Геном кукурузы B73: сложность, разнообразие и динамика». Наука. 326 (5956): 1112–1115. Дои:10.1126 / science.1178534. ISSN  0036-8075. PMID  19965430.