Денис Ноубл - Denis Noble

Эта статья о британском биологе. Для британского баритона см. Деннис Ноубл.

Денис Ноубл

CBE ФРС FMedSci MAE
Denis Noble.jpg
Родившийся (1936-11-16) 16 ноября 1936 г. (возраст 84 года)[1]
НациональностьБританский
ОбразованиеЭмануэль Скул
Альма-матерУниверситетский колледж Лондона (Бакалавр, магистр, доктор философии)
Супруг (а)
Сьюзан Дженнифер Барфилд
​
​
(м. 1965)​
[1]
Детиодин сын, одна дочь[1]
Награды
Научная карьера
Поля
УчрежденияОксфордский университет
ТезисИонная проводимость сердечной мышцы  (1961)
ДокторантОтто Хаттер
Интернет сайт

Денис Ноубл CBE ФРС FMedSci MAE[3] (родился 16 ноября 1936 г.) Британский биолог кто держал Бердон Сандерсон Председатель Сердечно-сосудистая физиология на Оксфордский университет с 1984 по 2004 год и был назначен почетным профессором и содиректором отдела вычислительной физиологии. Он один из пионеров системная биология и разработал первую жизнеспособную математическую модель рабочего сердце в 1960 г.[4][5][6][7][8]

Образование

Благородный получил образование в Эмануэль Скул и Университетский колледж Лондона (UCL).[1][4] В 1958 году он начал исследования механизмов сердцебиения. Это привело к появлению двух основополагающих статей в Природа в 1960 г.[9][10] давая первую правильную симуляцию сердца. Из этой работы стало ясно, что не было ни одного генератора, который контролировал сердцебиение, а скорее это был возникающая собственность петель обратной связи в различных каналах. В 1961 году он получил кандидат наук работает под руководством Отто Хаттер в UCL.[11][12]

Исследование

Исследования Нобл сосредоточены на использовании компьютерные модели из биологические органы и системы органов для интерпретации функции от молекулярного уровня до всего организма. Вместе с международными сотрудниками его команда использовала суперкомпьютеры для создания первого виртуального органа - виртуального сердца.[13][14]

В качестве генерального секретаря Международного союза физиологических наук 1993–2001 гг. Он сыграл важную роль в запуске Физиома Project, международный проект по использованию компьютерного моделирования для создания количественных физиологических моделей, необходимых для интерпретации геном, и он был избран президентом IUPS на его всемирном конгрессе в г. Киото в 2009.[15]

Ноубл также является философом биологии, и его книги Музыка жизни и Танцуй под мелодию жизни бросить вызов основам современных биологических наук, подвергнуть сомнению центральную догму, ее однонаправленный взгляд на информационный поток и навязывание восходящей методологии исследований в области наук о жизни[16]

Редукционизм

Его книга 2006 года Музыка жизни исследует некоторые из основных аспектов системной биологии и критически относится к идеям генетический детерминизм и генетический редукционизм. Он указывает, что есть много примеров петли обратной связи и "нисходящая причинность "в биологии, и что неразумно отдавать предпочтение одному уровню понимания над всеми остальными. Он также объясняет, что гены фактически работают в группах и системах, так что геном больше похож на набор органных труб, чем на «план жизни». Его книга 2016 года Танцуй под мелодию жизни излагает эти идеи в широком диапазоне от общего принципа относительности, примененного к биологии, до роли цели в эволюции и относительности эпистемологии.

Он контрастирует Докинз знаменитое заявление в Эгоистичный ген («Теперь они [гены] роятся ... в безопасности внутри гигантских неуклюжих роботов ... они создали нас, тело и разум; и их сохранение является окончательным обоснованием нашего существования») с альтернативной точкой зрения: «Теперь они [гены] заключены в огромные колонии, заперты внутри высокоинтеллектуальных существ, сформированы внешним миром, общаясь с ним посредством сложных процессов, посредством которых слепо, как по волшебству, проявляется функция. Они находятся в вас и во мне; мы - система, которая позволяет читать их код, и их сохранение полностью зависит от радости, которую мы испытываем, воспроизводя самих себя. Мы являемся окончательным обоснованием их существования ". Затем он предполагает, что между этими утверждениями нет эмпирической разницы, и говорит, что они различаются «метафорой» и «социологической или полемической точкой зрения».[17]

Он утверждает, что «парадигмы генетической причинности в биологических системах серьезно запутаны» и что «метафоры, которые хорошо служили нам на молекулярно-биологической фазе последних десятилетий, имеют ограниченное или даже вводящее в заблуждение влияние на многоуровневый мир системной биологии. Новые парадигмы необходимо, если мы хотим преуспеть в разгадывании многофакторной генетической причинности на более высоких уровнях физиологической функции и, таким образом, для объяснения феномена, о котором изначально говорила генетика ».[18]

Эволюция

Ноубл призвал к расширенный эволюционный синтез И более спорно замена для современный синтез.[19][20]

Он утверждал, что из исследований в области эпигенетики приобретенные характеристики могут передаваться по наследству и в отличие от современного синтеза, генетические изменения «далеко не случайны» и не всегда постепенный. Он также утверждал, что центральная догма молекулярной биологии был разрушен как "воплощение барьера Вейсмана",[21] и новый синтез объединит исследования физиологии с эволюционной биологией.[22][23][24]

Принципы системной биологии

Денис Ноубл на встрече по системной биологии в Chicheley Hall, Август 2013

Ноубл предложил десять принципов Системная биология:[25][26]

  1. Биологическая функциональность многоуровневая
  2. Передача информации не односторонняя
  3. ДНК - не единственный передатчик наследования
  4. Теория биологической относительности: нет привилегированного уровня причинности
  5. Генная онтология потерпит неудачу без понимания более высокого уровня
  6. Нет генетической программы
  7. Никаких программ другого уровня нет
  8. В мозгу нет программ
  9. Самость не объект
  10. Есть еще много всего, что предстоит открыть; подлинной «теории биологии» еще не существует

Карьера

  • 1961–1963 - ассистент кафедры физиологии Университетского колледжа Лондона.
  • 1961–1963 - заместитель начальника Коннот Холл (Лондонский университет)[27]
  • 1963–1984 - научный сотрудник и преподаватель, Баллиол-колледж, Оксфорд. Преподаватель физиологии
  • С 1967 - редактор журнала Прогресс в биофизике и молекулярной биологии[28]
  • 1969–1970 - Приглашенный профессор и приглашенный научный сотрудник Канадского MRC.
  • 1971–1989 - руководитель (префект) выпускного центра Баллиол-колледжа в г. Поместье Холивелл
  • 1975–1985 - руководитель группы грантов Программы MRC.
  • 1983–1985 - проректор Баллиол-колледжа.
  • 1986 - соучредитель Save British Science, ныне Кампания за науку и технику
  • 1984–2004 - профессор сердечно-сосудистой физиологии Бердона Сандерсона Оксфордского университета.
  • 1984–2004 гг. - научный сотрудник Баллиол-колледжа.
  • С 2004 г. - заслуженный профессор физиологии сердечно-сосудистой системы Оксфордского университета.
  • С 2004 г. - почетный научный сотрудник Баллиол-колледжа Оксфорда.
  • С 2004 г. - директор отдела вычислительной физиологии Оксфорда.
  • 2003–2007 - адъюнкт-профессор, Сианьский университет Цзяотун, Провинция Шэньси, Китай
  • С 2005 г. - приглашенный профессор, Осакский университет, Япония
  • 2009–2017 - президент Международного союза физиологических наук.[29]
  • С 2009 г. - соучредитель и редактор Голоса из Оксфорда[30]
  • 2011–2017 - главный редактор журнала Фокус интерфейса[31][32][33]
  • С 2014 г. - член и соучредитель The Third Way of Evolution.[34]

Публикации

Нобл опубликовал более 600 статей в научных журналах,[2][14] включая Природа,[9][10][35][36][37][38] Наука,[39][40] PNAS,[41] Журнал физиологии,[42][43][44][45][46] Прогресс в биофизике и молекулярной биологии;[47] Много статей в отечественной прессе. Он автор или редактор 12 книг, в том числе:

Награды и награды

Среди его основных приглашенных лекций - лекция Дарвина для Британская ассоциация в 1966 г.,[48] лекция Наума в Йель в 1977 г. и лекция Уэда на Токийский университет в 1985 и 1990 годах. Он был президентом медицинской секции Британская научная ассоциация 1991–92.

В 1979 году он был избран членом Королевское общество. Его номинация в Королевское общество гласит:

Отличился открытием медленно активируемые калиевые токи в сердце и количественный анализ их роли в контроле реполяризация и кардиостимуляторная активность; открытие ионный механизмы, с помощью которых адреналин увеличивается частота сердцебиения. Он показал, что терапевтические уровни сердечные гликозиды может увеличиваться, а не уменьшаться, калий градиентов в сердце, и опубликовал аналитическое исследование теория возбуждения мембраны и теория кабеля, которая обеспечивает современную основу для концепций запаса прочности, предельной длины, постоянных времени возбуждения и феномена повторяющегося срабатывания.[3]

Он был избран почетным членом Королевский колледж врачей в 1988 г. и почетный член в 1994 г., почетный член Американское физиологическое общество в 1996 г. и Физиологическое общество Японии в 1998 году. В 1989 году он был избран членом Academia Europaea. В 1998 году он также стал одним из основателей Академия медицинских наук.[49] В 1998 г. награжден орденом CBE.[50]

Имеет почетные докторские степени Университет Шеффилда (2004),[51] то Université de Bordeaux (2005) и Уорикский университет (2008).[52]

Он является почетным иностранным членом Королевская академия медицины Бельгии (1993),[53] из Istituto Lombardo Accademia di Scienze e Lettere, и получил медаль Павлова Российская Академия Наук (2004).

Личная жизнь

Он играет на классической гитаре и поет Окситанский трубадуры и народные песни (Oxford Trobadors[54]). Помимо английского, он читал лекции в Французский на YouTube, Итальянский на YouTube, Перформанс с Надау и Пейрагудой Окситанский,[55] Японский и корейский.[56]

Рекомендации

  1. ^ а б c d Анон (2014). «Благородный, профессор Денис». Кто есть кто. ukwhoswho.com (онлайн Oxford University Press ред.). A&C Black, отпечаток Bloomsbury Publishing plc. Дои:10.1093 / ww / 9780199540884.013.U29605. (подписка или Членство в публичной библиотеке Великобритании требуется) (требуется подписка)
  2. ^ а б Денис Ноубл публикации, проиндексированные Google ученый
  3. ^ а б "EC / 1979/28: Благородный, Денис". Лондон: Королевское общество. Архивировано из оригинал 29 мая 2014 г.. Получено 30 мая 2014.
  4. ^ а б биография В архиве 25 апреля 2006 г. Wayback Machine, Домашняя страница Дениса Ноубла.
  5. ^ Лекция Music of Life в Мариборе 2012 на YouTube
  6. ^ Лекция по Evolution IUPS Открытие пленарного заседания 2013 г. на YouTube
  7. ^ Ноубл, Д. (2013). «Физиология потрясает основы эволюционной биологии». Экспериментальная физиология. 98 (8): 1235–1243. Дои:10.1113 / expphysiol.2012.071134. PMID  23585325. S2CID  19689192.
  8. ^ Тен Тушер, К. Х. У. Дж. (2003). «Модель ткани желудочка человека». AJP: Сердце и физиология кровообращения. 286 (4): H1573 – H1589. Дои:10.1152 / ajpheart.00794.2003. PMID  14656705.
  9. ^ а б Благородный, Денис (1960). «Сердечная деятельность и возможности водителя ритма на основе уравнений Ходжкина-Хаксли». Природа. 188 (4749): 495–7. Bibcode:1960Натура.188..495Н. Дои:10.1038 / 188495b0. PMID  13729365. S2CID  4147174.
  10. ^ а б Хаттер, Отто Ф .; Благородный, Денис (1960). «Выпрямляющие свойства сердечной мышцы». Природа. 188 (4749): 495. Bibcode:1960Натура.188..495H. Дои:10.1038 / 188495a0. PMID  13717088. S2CID  4273708.
  11. ^ Благородный, Денис (1962). Ионная проводимость сердечной мышцы (Кандидатская диссертация). Университетский колледж Лондона.(требуется подписка)
  12. ^ Деннис Ноубл (2006). Музыка жизни, ISBN  0-19-929573-5
  13. ^ Все системы идут статья в Экономист 25 октября 2007 г. обсуждение работы Нобла
  14. ^ а б Публикации Дениса Нобла индексируется Scopus библиографическая база данных. (требуется подписка)
  15. ^ «Оклендский институт биоинженерии - Оклендский университет». www.Auckland.ac.nz. Получено 15 апреля 2019.
  16. ^ Вернер, Э. (2007). «СИСТЕМНАЯ БИОЛОГИЯ: Насколько центральным является геном?». Наука. 317 (5839): 753–754. Дои:10.1126 / science.1141807. S2CID  82065292.
  17. ^ Музыка жизни, стр. 12-14
  18. ^ Ноубл, Д. (сентябрь 2008 г.). «Гены и причинно-следственная связь». Философские труды Лондонского королевского общества. Серия A, Математические и физические науки. 366 (1878): 3001–3015. Bibcode:2008RSPTA.366.3001N. Дои:10.1098 / рста.2008.0086. ISSN  1364-503X. PMID  18559318. S2CID  17592966.
  19. ^ «Теория эволюции развивалась». Физиологическое общество.
  20. ^ «Замените современный синтез (неодарвинизм): интервью с Денисом Ноублом». HuffPost.
  21. ^ Благородный, Денис (2018). "Центральная догма или центральные дебаты?". Физиология. 33 (4): 246–249. Дои:10.1152 / Physiol.00017.2018. ISSN  1548-9213. PMID  29873598.
  22. ^ Благородный, Денис (2013). «Физиология потрясает основы эволюционной биологии». Экспериментальная физиология. 98 (8): 1235–1243. Дои:10.1113 / expphysiol.2012.071134. PMID  23585325. S2CID  19689192.
  23. ^ «Физиология и революция в эволюционной биологии». Голоса из Оксфорда.
  24. ^ Благородный, D; Яблонька, Е; Джойнер, MJ; Мюллер, Великобритания; Омхольт, SW (2014). «Эволюция развивается: физиология возвращается в центр внимания». Журнал физиологии. 592 (11): 2237–44. Дои:10.1113 / jphysiol.2014.273151. ЧВК  4048083. PMID  24882808.
  25. ^ Благородный, Д. (2008). «Клод Бернар, первый системный биолог и будущее физиологии». Экспериментальная физиология. 93 (1): 16–26. Дои:10.1113 / expphysiol.2007.038695. PMID  17951329. S2CID  3080457.
  26. ^ «Принцип системной биологии, иллюстрированный с помощью виртуального сердца». videolectures.net. Получено 15 апреля 2019.
  27. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал 30 июля 2018 г.. Получено 7 декабря 2013.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  28. ^ «Прогресс в биофизике и молекулярной биологии». Получено 15 апреля 2019 - через www.journals.elsevier.com.
  29. ^ IUPS
  30. ^ "Голоса из Оксфорда". Голоса из Оксфорда. Получено 15 апреля 2019.
  31. ^ Ноубл, Д. (2011). «Теория биологической относительности: нет привилегированного уровня причинности». Фокус интерфейса. 2 (1): 55–64. Дои:10.1098 / rsfs.2011.0067. ЧВК  3262309. PMID  23386960.
  32. ^ Благородный, Д. (2011). «Дифференциальные и интегральные взгляды на генетику в вычислительной системной биологии». Фокус интерфейса. 1 (1): 7–15. Дои:10.1098 / rsfs.2010.0444. ЧВК  3262251. PMID  22419970.
  33. ^ Благородный, Д. (2011). «Редакция». Фокус интерфейса. 1 (1): 1–2. Дои:10.1098 / rsfs.2010.0385. ЧВК  3262238. PMID  22419969.
  34. ^ «Дом - Третий путь эволюции». www.thethirdwayofevolution.com. Получено 15 апреля 2019.
  35. ^ Блейкмор, К; Докинз, Р. Благородный, D; Юдкин, М (2003). «Является ли научный бойкот оправданным?». Природа. 421 (6921): 314. Дои:10.1038 / 421314b. PMID  12540875. S2CID  47249920.
  36. ^ Egan, T. M .; Благородный, D; Благородный, С. Дж .; Пауэлл, Т; Твист, В. В. (1987). «Изопреналин активировал натрийзависимый входящий ток в желудочковых миоцитах». Природа. 328 (6131): 634–7. Bibcode:1987Натура.328..634E. Дои:10.1038 / 328634a0. PMID  2441262. S2CID  4324641.
  37. ^ Коэн, я; Джайлз, Вт; Благородный, Д. (1976). «Клеточная основа зубца Т электрокардиограммы». Природа. 262 (5570): 657–61. Bibcode:1976Натура.262..657C. Дои:10.1038 / 262657a0. PMID  958437. S2CID  4174864.
  38. ^ Холл, А. Э .; Благородный, Д. (1963). «Переходные реакции волокон Пуркинье на неоднородные токи». Природа. 199 (4900): 1294–5. Bibcode:1963Натура.199.1294H. Дои:10.1038 / 1991294a0. PMID  14074602. S2CID  4217721.
  39. ^ Благородный, Д. (2002). «Моделирование сердца - от генов до клеток и всего органа». Наука. 295 (5560): 1678–82. Bibcode:2002Наука ... 295.1678N. Дои:10.1126 / science.1069881. PMID  11872832. S2CID  6756983.
  40. ^ Хаусвирт, О; Благородный, D; Цзянь, Р. В. (1968). «Адреналин: механизм действия на потенциал кардиостимулятора в сердечных волокнах Пуркинье». Наука. 162 (3856): 916–7. Bibcode:1968Sci ... 162..916H. Дои:10.1126 / science.162.3856.916. PMID  4386717. S2CID  23508494.
  41. ^ Благородный, Д. (2002). «Раскрытие генетики и механизмов сердечной аритмии». Труды Национальной академии наук. 99 (9): 5755–6. Bibcode:2002PNAS ... 99.5755N. Дои:10.1073 / pnas.102171699. ЧВК  122846. PMID  11983875.
  42. ^ Благородный, Д. (1962). «Модификация уравнений Ходжкина-Хаксли, применимая к действию волокна Пуркинье и потенциалам кардиостимулятора». Журнал физиологии. 160 (2): 317–52. Дои:10.1113 / jphysiol.1962.sp006849. ЧВК  1359535. PMID  14480151.
  43. ^ McAllister, R.E .; Благородный, D; Цзянь, Р. В. (1975). «Реконструкция электрической активности сердечных волокон Пуркинье». Журнал физиологии. 251 (1): 1–59. Дои:10.1113 / jphysiol.1975.sp011080. ЧВК  1348375. PMID  1185607.
  44. ^ Благородный, D; Цзянь, Р. У. (1969). «Наружные мембранные токи активируются в диапазоне потенциалов плато в сердечных волокнах Пуркинье». Журнал физиологии. 200 (1): 205–31. Дои:10.1113 / jphysiol.1969.sp008689. ЧВК  1350425. PMID  5761944.
  45. ^ Благородный, D; Цзянь, Р. В. (1968). «Кинетика и выпрямительные свойства медленного калиевого тока в сердечных волокнах Пуркинье». Журнал физиологии. 195 (1): 185–214. Дои:10.1113 / jphysiol.1968.sp008454. ЧВК  1557911. PMID  5639799.
  46. ^ Благородный, Д. (1984). «Удивительное сердце: обзор последних достижений в области электрофизиологии сердца». Журнал физиологии. 353: 1–50. Дои:10.1113 / jphysiol.1984.sp015320. ЧВК  1193291. PMID  6090637.
  47. ^ Ноубл, Д. (2013). «Системная биология и репродукция». Прогресс в биофизике и молекулярной биологии. 113 (3): 355. Дои:10.1016 / j.pbiomolbio.2013.11.004. PMID  24314295.
  48. ^ Благородный, Д. (1966). «Начало сердцебиения (лекция Дарвина, Британская ассоциация)». Развитие науки. 23: 412–418.
  49. ^ "Профессор Денис Нобл | Академия медицинских наук".
  50. ^ "День рождения королевы почестей 1998". 12 июня 1998 г.
  51. ^ http://calendar.dept.shef.ac.uk/calendar/21_hon_grad.pdf
  52. ^ http://www2.warwick.ac.uk/alumni/ouralumni/hongrads/allhongrads/
  53. ^ http://www.armb.be/index.php?eID=tx_nawsecuredl&u=0&g=0&hash=9b3bbce437184c4e213127eb735def496c70980b&file=fileadmin/sites/armb/upload/armb_super_editor/armb_editor/pdf/Bulletin_de_l_Academie/2012/tableau_Acad_1.pdf
  54. ^ "Оксфорд Тробадорс". www.oxfordtrobadors.com. Получено 15 апреля 2019.
  55. ^ "Оксфорд Тробадорс". www.oxfordtrobadors.com. Получено 15 апреля 2019.
  56. ^ «Программа конференции Biovision». biovision.org. Архивировано из оригинал 25 июля 2011 г.. Получено 15 апреля 2019.