Депендопарвовирус - Википедия - Dependoparvovirus

Депендопарвовирус
Аденоассоциированные вирусы.jpg
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Моноднавирия
Королевство:Shotokuvirae
Тип:Cossaviricota
Учебный класс:Quintoviricetes
Заказ:Piccovirales
Семья:Parvoviridae
Подсемейство:Parvovirinae
Род:Депендопарвовирус
Типовой вид
Аденоассоциированный зависимый парвовирус А

Депендопарвовирус (ранее Депендовирус или же Группа аденоассоциированных вирусов) - род подсемейства Parvovirinae из вирус семья Parvoviridae;[1][2] они относятся к группе II вирусов согласно Балтиморская классификация. Некоторые зависимые парвовирусы также известны как аденоассоциированные вирусы, потому что они не могут копировать продуктивно в своих клетка-хозяин без клетки коинфицированный по вспомогательный вирус например, аденовирус, а герпесвирус, или вирус осповакцины.

Разновидность

В настоящее время существует десять признанных видов:[3]

Вирусология

Депендопарвовирусы имеют икосаэдр форма, размер 22 нм[4] состоит из 60 белков клиновидной формы, число триангуляции = 1). В каждом капсомере присутствуют три белка (VP1, VP2 и VP3). Каждый капсид состоит из белков 5 VP1, 5 VP2 и 50 VP3. У капсида нет конверта.[5]

Геном представляет собой одиночную молекулу одноцепочечной ДНК длиной 4,7 килобаз. У него всего две открытые рамки для чтения. 3'-открытая рамка считывания представляет собой структурный белок капсида, cap, который может быть сплайсирован для образования двух РНК, одна для белка вириона 1 (VP1), а другая, в конечном итоге, дает VP2 и VP3. Второй ген, rep, может быть сплайсирован с четырьмя разными неструктурными регуляторными белками, которые все помогают в репликации генома. Эти белки названы Rep 78, Rep68, Rep 52 и Rep 40 в зависимости от их молекулярной массы.[4]

Из-за инвертированных концевых повторов (ITR) на каждом конце генома Т-образный вторичная структура сформирован. Дополнительные области оставляют 3 ' гидроксил группа одноцепочечных для начала репликации. Эта 3'-гидроксильная группа используется в качестве грунтовка для ведущая нить синтез. Создаются как положительные, так и отрицательные смысловые цепи ДНК. Двухцепочечные промежуточные соединения образуются на протяжении всей репликации; это означает, что две нити, положительное и отрицательное, будут совпадать.[4][5]

Диапазон хостов

Эти вирусы способны размножаться у всех позвоночных. Они ограничены только вирусом, которым они должны заразиться, также известным как вирус-помощник. Эти вспомогательные вирусы необходимы для репликации зависимого парвовируса. Распространенным вирусом-помощником у людей является аденовирус.[нужна цитата ]

Генная терапия

Депендопарвовирус недостаточно заразен, чтобы вызвать иммунная реакция; это делает его хорошим вирусом для использования в качестве инструмента генной терапии. Генная терапия является возможным лечением различных расстройств и заболеваний, имеющих генетическое происхождение. Вирусные векторы в настоящее время разрабатываются для переноса генов в клетки человека. Поскольку этот вирус не стимулирует иммунный ответ, его можно эффективно использовать несколько раз без нейтрализации до заражения.[нужна цитата ] . Еще одна причина, по которой эти вирусы являются надежными векторами, - это известная точка вставки генома. Этот вирус всегда вставляет свое содержимое в одно и то же место на 19 хромосоме.[нужна цитата ] Такая предсказуемость может снизить вероятность внедрения в важную область, которая может нарушить нормальную функцию генов или повысить риск развития рака.[6]

В настоящее время одна из проблем, связанных с использованием этого вируса в качестве терапевтического инструмента, заключается в том, что геном довольно мал. Если в геноме менее 5 килобайт, количество генетического материала, которое может поместиться в капсид, ограничено. В настоящее время ведется работа по увеличению объема информации, которую может доставить этот вектор. Этого можно достичь с помощью ITR, обнаруженных как на 5 ', так и на 3' конце генома. Поскольку ITR имеют одинаковую последовательность, при их удалении будут открыты дополнительные цепи. Дополнительные пряди могут подвергаться рекомбинация и объединить два вставленных фрагмента размером 5 КБ.[7]

Рекомендации

  1. ^ Котмор, Сан-Франциско; Agbandje-McKenna, M; Канути, М; Chiorini, JA; Эйс-Хубингер, А; Хьюз, Дж; Mietzsch, M; Modha, S; Ольястро, М; Пензес, JJ; Пинтель, диджей; Цю, Дж; Содерлунд-Венермо, М; Tattersall, P; Tijssen, P; и Консорциум отчетов ICTV (2019). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Parvoviridae". Журнал общей вирусологии. 100 (3): 367–368. Дои:10.1099 / jgv.0.001212. ЧВК  6537627. PMID  30672729.
  2. ^ «10-й отчет ICTV (2018)».
  3. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 27 апреля 2020.
  4. ^ а б c Гонсалвеш, М. (2005). «Аденоассоциированный вирус: от дефектного вируса к эффективному переносчику». Журнал вирусологии. 2 (1): 43–60. Дои:10.1186 / 1743-422X-2-43. ЧВК  1131931. PMID  15877812.
  5. ^ а б Управление ICTVdB (2006). Бюхен-Осмонд, К. (ред.). «ICTVdB - Универсальная база данных вирусов, версия 4: Dependovirus». Колумбийский университет, Нью-Йорк, США. Получено 4 мая 2009.
  6. ^ Экскоффон, К; и другие. (2009). «Направленная эволюция аденоассоциированного вируса в инфекционный респираторный вирус». Труды Национальной академии наук. 106 (10): 3865–3870. Bibcode:2009PNAS..106.3865E. Дои:10.1073 / pnas.0813365106. ЧВК  2646629. PMID  19237554.
  7. ^ Ghosh, A .; Yue, Y .; Лай, Ю. и Дуань, Д. (2008). «Система гибридных векторов расширяет возможности упаковки аденоассоциированных вирусных векторов трансген-независимым образом» (PDF). Молекулярная терапия. 16 (1): 124–130. Дои:10.1038 / sj.mt.6300322. PMID  17984978.

внешняя ссылка