FASTKD1 - Википедия - FASTKD1

FASTKD1
Идентификаторы
ПсевдонимыFASTKD1, FAST киназные домены 1
Внешние идентификаторыOMIM: 617529 MGI: 2444596 ГомолоГен: 36420 Генные карты: FASTKD1
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение FASTKD1
Геномное расположение FASTKD1
Группа2q31.1Начинать169,528,508 бп[1]
Конец169,573,875 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

79675

320720

Ансамбль

ENSG00000138399

ENSMUSG00000027086

UniProt

Q53R41

Q6DI86

RefSeq (мРНК)

NM_001281476
NM_024622
NM_001322046
NM_001322048
NM_001322049

NM_177244

RefSeq (белок)

NP_001268405
NP_001308975
NP_001308977
NP_001308978
NP_078898

NP_796218

Расположение (UCSC)Chr 2: 169,53 - 169,57 МбChr 2: 69.69 - 69.71 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

FAST киназный домен, содержащий белок 1 это белок что у людей кодируется FASTKD1 ген на хромосоме 2.[5][6] Этот белок является частью семейства FASTKD, известного своей регуляцией энергетического баланса митохондрии под напряжением.[7] FASTKD1 также является РНК-связывающий белок и был связан с рак эндометрия.[8][9]

Структура

FASTKD1 разделяет структурные характеристики семейства FASTKD, включая N-концевой митохондриальный целевой домен и три C-терминал домены: два FAST-киназоподобных домена (FAST_1 и FAST_2) и РНК-связывающий домен (RAP).[7][10] Митохондриальный целевой домен направляет FASTKD1 для импорта в митохондрии. Хотя функции C-концевых доменов неизвестны, RAP, возможно, связывает РНК во время транс-сплайсинга.[7]

Функция

Как член семейства FASTKD, FASTKD1 локализуется в митохондриях, чтобы модулировать их энергетический баланс, особенно в условиях стресса. Хотя FASTKD1 экспрессируется повсеместно во всех тканях, он более широко проявляется в скелетные мышцы, сердечная мышца, и другие ткани, обогащенные митохондриями.[7] FASTKD1 утвержден как РНК-связывающий белок.[8][11]

Клиническое значение

FASTKD1 является важным элементом апоптоза. Во время нормального эмбриологический процессов или во время повреждения клеток (например, ишемия-реперфузия во время сердечные приступы и удары ) или во время разработки и процессов в рак, апоптотическая клетка претерпевает структурные изменения, включая сжатие клеток, образование пузырей плазматической мембраны, ядерную конденсацию и фрагментацию ДНК и ядро. Далее следует фрагментация на апоптотические тельца, которые быстро удаляются фагоциты, тем самым предотвращая воспалительный отклик.[12] Это способ гибели клеток, определяемый характерными морфологическими, биохимическими и молекулярными изменениями. Сначала он был описан как «усадочный некроз», а затем этот термин был заменен на апоптоз, чтобы подчеркнуть его противоположную роль. митоз в кинетике тканей. На более поздних стадиях апоптоза вся клетка становится фрагментированной, образуя ряд апоптотических тел, связанных с плазматической мембраной, которые содержат ядерные и / или цитоплазматические элементы. Ультраструктурный вид некроз Совершенно иначе, основными признаками которого являются набухание митохондрий, разрушение плазматической мембраны и распад клеток. Апоптоз встречается во многих физиологический и патологический процессы. Он играет важную роль во время эмбриональный развитие как запрограммированная гибель клеток и сопровождает множество нормальных инволюционных процессов, в которых оно служит механизмом для удаления «нежелательных» клеток.

FASTKD1 был идентифицирован как потенциальный молекулярный биомаркер за рак эндометрия, рак женских половых путей, особенно при использовании аспирата матки[9] Это открытие является основой для разработки высокочувствительного и специфического минимально инвазивного метода лечения показы рака эндометрия. Соответственно, скрининг экспрессии генов на 52 карцинома образцы и серии количественных ПЦР валидация на 19 парных карциномах и образцах нормальной ткани и на 50 карциномах и не карциномах матка аспираты были выполнены для выявления и проверки потенциальных биомаркеров рака эндометрия.[9] Кроме того, в другом исследовании была разработана стратегия изучения сигнатур экспрессии генов, связанных с выживаемостью в острый лимфобластный лейкоз (ALL) для поиска аномальной активности гена, который состоит из применения нескольких фильтров к наборам транскриптомных данных из двух педиатрических исследований ALL. Шесть генов, экспрессия которых при лейкозе взрывы были связаны с прогнозом: три гена, предсказывающих плохой прогноз (AK022211, FASTKD1 и STARD4 ) и три гена, связанных с благоприятным исходом (CAMSAP1, PCGF6 и SH3RF3 ). Таким образом, похоже, что FASTKD1 также может играть роль в ВСЕ.[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138399 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027086 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ "FAST kinase domains 1".
  6. ^ «Ген Entrez: домены киназы FAST 1».
  7. ^ а б c d Симарро М., Хименес-Кассина А., Кедерша Н., Лазаро Дж. Б., Адельмант Г. О., Марто Дж. А., Ри К., Тисдейл С., Даниал Н., Бенарафа С., Ордунья А., Андерсон П. (октябрь 2010 г.). «Протеин 3, содержащий быстрый киназный домен, является митохондриальным белком, необходимым для клеточного дыхания». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 401 (3): 440–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. ЧВК  2963690. PMID  20869947.
  8. ^ а б Кастелло А, Фишер Б., Эйхельбаум К., Хорос Р., Бекманн Б.М., Стрейн С., Дэйви Н.Э., Хамфрис Д.Т., Прейсс Т., Штайнметц Л.М., Крайгсвельд Дж., Хентце М.В. (июнь 2012 г.). «Понимание биологии РНК из атласа мРНК-связывающих белков млекопитающих». Клетка. 149 (6): 1393–406. Дои:10.1016 / j.cell.2012.04.031. PMID  22658674.
  9. ^ а б c Colas E, Perez C, Cabrera S, Pedrola N, Monge M, Castellvi J, Eyzaguirre F, Gregorio J, Ruiz A, Llaurado M, Rigau M, Garcia M, Ertekin T, Montes M, Lopez-Lopez R, Carreras R, Xercavins J, Ortega A, Maes T, Rosell E, Doll A, Abal M, Reventos J, Gil-Moreno A (ноябрь 2011 г.). «Молекулярные маркеры карциномы эндометрия, обнаруженные в аспирате матки». Международный журнал рака. 129 (10): 2435–44. Дои:10.1002 / ijc.25901. PMID  21207424. S2CID  11956280.
  10. ^ Йунг К.Т., Дас С., Чжан Дж., Ломничи А., Охеда С.Р., Сюй К.Ф., Нойберт Т.А., Самуэльс Х.Х. (июнь 2011 г.). «Новый транскрипционный комплекс, который избирательно модулирует апоптоз клеток рака груди посредством регуляции FASTKD2». Молекулярная и клеточная биология. 31 (11): 2287–98. Дои:10.1128 / MCB.01381-10. ЧВК  3133243. PMID  21444724.
  11. ^ Baltz AG, Munschauer M, Schwanhäusser B, Vasile A, Murakawa Y, Schueler M, Youngs N, Penfold-Brown D, Drew K, Milek M, Wyler E, Bonneau R, Selbach M, Dieterich C, Landthaler M (июнь 2012 г.) . «Протеом, связанный с мРНК, и его глобальный профиль занятости в транскриптах, кодирующих белок». Молекулярная клетка. 46 (5): 674–90. Дои:10.1016 / j.molcel.2012.05.021. PMID  22681889.
  12. ^ Керр Дж. Ф., Уилли А. Х., Карри А. Р. (август 1972 г.). «Апоптоз: основное биологическое явление с широким спектром влияния на кинетику тканей». Британский журнал рака. 26 (4): 239–57. Дои:10.1038 / bjc.1972.33. ЧВК  2008650. PMID  4561027.
  13. ^ Wang J, Mi JQ, Debernardi A, Vitte AL, Emadali A, Meyer JA, Charmpi K, Ycart B, Callanan MB, Carroll WL, Khochbin S, Rousseaux S (июнь 2015 г.). «Сигнатура экспрессии шести генов определяет агрессивные подтипы и предсказывает исход острого лимфобластного лейкоза у детей и взрослых». Oncotarget. 6 (18): 16527–42. Дои:10.18632 / oncotarget.4113. ЧВК  4599287. PMID  26001296.