FBXW7 - Википедия - FBXW7

FBXW7
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2ОВП, 2OVQ, 2OVR, 5IBK
Идентификаторы
Псевдонимы	FBXW7, AGO, CDC4, FBW6, FBW7, FBX30, FBXO30, FBXW6, SEL-10, SEL10, hAgo, hCdc4, F-box и повторяющийся домен WD, содержащий 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 606278 MGI: 1354695 ГомолоГен: 117451 Генные карты: FBXW7
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 4 (человек)
Конец	152,536,092 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	84,979,198 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание с белками, мостик; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность активатора убиквитин-протеинтрансферазы; • идентичное связывание с белками; • связывание убиквитин-протеин-лигазы; • связывание циклина; • связывание остатков фосфотреонина; • активность убиквитин-протеинтрансферазы; • связывание убиквитина;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • Убиквитинлигазный комплекс Parkin-FBXW7-Cul1; • SCF убиквитин-лигазный комплекс; • нуклеоплазма; • ядрышко; • ядро клетки; • цитозоль; • митохондрия; • эндоплазматический ретикулум; • аппарат Гольджи; • перинуклеарная область цитоплазмы;
Биологический процесс	• положительная регуляция активности рецепторов, активируемых эпидермальным фактором роста; • положительное регулирование доставки белка в митохондрии; • отрицательная регуляция сигнального пути SREBP; • клеточный ответ на УФ; • отрицательная регуляция процесса биосинтеза триглицеридов; • стабилизация белка; • отрицательная регуляция пролиферации гепатоцитов; • сцепление сестринских хроматид; • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК; • регулирование локализации белка; • положительная регуляция индуцированного окислительным стрессом нейрона внутреннего апоптотического сигнального пути; • SCF-зависимый протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • развитие сосудистой сети; • регуляция аутофагии митохондрии; • отрицательная регуляция эндоредупликации ДНК; • положительная регуляция активности убиквитин-протеинтрансферазы; • положительная регуляция убиквитинирования белков, участвующих в убиквитин-зависимом катаболическом процессе белков; • убиквитинирование белков; • липидный гомеостаз; • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2; • регуляция клеточного цикла фазового перехода G1 / S; • регулирование хранения липидов; • GO: 0022415 вирусный процесс; • положительная регуляция катаболического процесса протеасомных белков; • положительная регуляция убиквитинирования белков; • отрицательная регуляция сигнального пути Notch; • полиубиквитинирование белков; • посттрансляционная модификация; • отрицательная регуляция развития остеокластов; • васкулогенез; • Notch сигнальный путь; • отрицательная регуляция экспрессии генов; • переработка убиквитина; • развитие легких; • дестабилизация белков; • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • регуляция миграции клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза; • отрицательная регуляция связывания ДНК с последовательностью регуляторной области РНК-полимеразы II; • регулирование циркадного ритма; • ритмический процесс;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	55294
	50754
	ENSG00000109670
	ENSMUSG00000028086
	Q969H0
	Q8VBV4
	NM_001013415; NM_001257069; NM_018315; NM_033632; NM_001349798
	NM_001177773; NM_001177774; NM_080428
	NP_001013433; NP_001243998; NP_060785; NP_361014; NP_001336727
	NP_001171244; NP_001171245; NP_536353
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Белок 7, содержащий F-бокс / повтор WD это белок что у людей кодируется FBXW7 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства белков F-бокса, который характеризуется мотивом приблизительно из 40 аминокислот, F-боксом. Белки F-бокса составляют одну из четырех субъединиц убиквитиновый протеин-лигазный комплекс называемые SCF (SKP1-cullin-F-box), которые функционируют в зависимости от фосфорилирования убиквитинирования. Белки F-бокса делятся на 3 класса: Fbw, содержащие домены WD-40, Fbls, содержащие повторы, богатые лейцином, и Fbx, содержащие либо различные модули взаимодействия белок-белок, либо не распознаваемые мотивы. Белок, кодируемый этим геном, ранее назывался FBX30 и принадлежит к классу Fbws; Помимо F-бокса, этот белок содержит 7 тандемных повторов WD40. Этот белок связывается напрямую с циклин E и, вероятно, нацелен на циклин E для убиквитин-опосредованного разложения. Другими хорошо известными пролиферативными мишенями FBXW7 являются c-Myc и Notch1. Моноаллельные мутации в этом гене обнаруживаются при спорадических формах рака [например, холангиокарцинома (35%), T-ALL (31%), карцинома эндометрия (16%), колоректальная карцинома (16%), рак мочевого пузыря (10%), карцинома желудка (6%), плоскоклеточный рак легкого (5%) и др.]. Эти результаты указывают на потенциальную роль гена в патогенезе рака человека. Несмотря на то, что он широко признан гаплонедостаточным опухолевым супрессором, мутации не обнаруживаются при некоторых формах рака, таких как острый миелоидный лейкоз и множественная миелома. Одна возможность состоит в том, что стабилизация субстрата FBXW7 вредна для этих новообразований. Например, субстрат C / EBPα FBXW7 подавляет AML.^[8] и множественные миеломы требуют конститутивной передачи сигналов NF-κB; следовательно, нарушение FBXW7-опосредованного убиквитилирования IκBd в этих опухолях приводит к гибели клеток.^[9]^[10]

Для этого гена были обнаружены три варианта транскрипта, кодирующие три разные изоформы.^[7]

Взаимодействия

FBXW7 был показан взаимодействовать с:

дальнейшее чтение

Робертсон Н.Г., Хетарпал У., Гутьеррес-Эспелета Г.А., Бибер Ф.Р., Мортон С.К. (1995). «Выделение новых и известных генов из библиотеки кДНК улитки человеческого плода с использованием субтрактивной гибридизации и дифференциального скрининга». Геномика. 23 (1): 42–50. Дои:10.1006 / geno.1994.1457. PMID 7829101.
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Оберг С., Ли Дж., Поли А., Вольф Э., Гурни М., Лендал У. (2001). «Внутриклеточный домен Notch убиквитинирован и негативно регулируется гомологом Sel-10 млекопитающих». J. Biol. Chem. 276 (38): 35847–53. Дои:10.1074 / jbc.M103992200. PMID 11461910.
Кепп Д.М., Шефер Л.К., Йе Х, Кейомарси К., Чу С., Харпер Дж. У., Элледж С. Дж. (2001). "Зависимое от фосфорилирования убиквитинирование циклина E убиквитинлигазой SCFFbw7". Наука. 294 (5540): 173–7. Дои:10.1126 / science.1065203. PMID 11533444. S2CID 23404627.
Моберг К. Х., Белл Д. В., Варер Д. К., Хабер Д. А., Харихаран И. К. (2001). «Archipelago регулирует уровни Cyclin E у Drosophila и мутирует в линиях раковых клеток человека». Природа. 413 (6853): 311–6. Дои:10.1038/35095068. PMID 11565033. S2CID 4372821.
Strohmaier H, Spruck CH, Kaiser P, Won KA, Sangfelt O, Reed SI (2001). «Человеческий F-бокс-белок hCdc4 нацелен на циклин E для протеолиза и мутирует в клеточной линии рака груди». Природа. 413 (6853): 316–22. Дои:10.1038/35095076. PMID 11565034. S2CID 478973.
Ву Г., Ляпина С., Дас И., Ли Дж., Герни М., Поли А., Чуй И., Деше Р. Дж., Китаевски Дж. (2001). «SEL-10 является ингибитором передачи сигналов Notch, который нацелен на Notch для убиквитин-опосредованной деградации белка». Мол. Клетка. Биол. 21 (21): 7403–15. Дои:10.1128 / MCB.21.21.7403-7415.2001. ЧВК 99913. PMID 11585921.
Spruck CH, Strohmaier H, Sangfelt O, Müller HM, Hubalek M, Müller-Holzner E, Marth C, Widschwendter M, Reed SI (2002). «Мутации гена hCDC4 при раке эндометрия». Рак Res. 62 (16): 4535–9. PMID 12183400.
Ли Дж., Поли AM, Майерс Р.Л., Шуанг Р., Брашлер Дж. Р., Ян Р., Буль А.Е., Рубль С., Гурни М.Э. (2002). «SEL-10 взаимодействует с пресенилином 1, облегчает его убиквитинирование и изменяет продукцию пептида A-бета». J. Neurochem. 82 (6): 1540–8. Дои:10.1046 / j.1471-4159.2002.01105.x. PMID 12354302. S2CID 29687815.
Старополи Дж. Ф., Макдермотт С., Мартинат С., Шульман Б., Демирева Е., Абелиович А. (2003). «Паркин является компонентом SCF-подобного комплекса убиквитинлигазы и защищает постмитотические нейроны от каинатной эксайтотоксичности». Нейрон. 37 (5): 735–49. Дои:10.1016 / S0896-6273 (03) 00084-9. PMID 12628165. S2CID 17024826.
Калхун Э.С., Джонс Дж. Б., Ашфак Р., Адсей В., Бейкер С. Дж., Валентин В., Хемпен П. М., Хильгерс В., Йео Си-Джей, Хрубан Р. Х., Керн С. Е. (2003). «Мутации BRAF и FBXW7 (CDC4, FBW7, AGO, SEL10) в различных подгруппах рака поджелудочной железы: потенциальные терапевтические цели». Являюсь. Дж. Патол. 163 (4): 1255–60. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63485-2. ЧВК 1868306. PMID 14507635.
Велкер М., Певец Дж., Лоэб К.Р., Грим Дж., Блохер А., Гуриен-Вест М., Клерман Б.Е., Робертс Дж. М. (2003). «Мультисайтовое фосфорилирование с помощью Cdk2 и GSK3 контролирует деградацию циклина E». Мол. Клетка. 12 (2): 381–92. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00287-9. PMID 14536078.
Бусино Л., Донзелли М., Кьеза М., Гуардаваккаро Д., Ганот Д., Доррелло Н. В., Хершко А., Пагано М., Дретта Г. Ф. (2003). «Распад Cdc25A бета-TrCP во время фазы S и в ответ на повреждение ДНК». Природа. 426 (6962): 87–91. Дои:10.1038 / природа02082. PMID 14603323. S2CID 768783.
Кассия Р., Морено-Буэно Дж., Родригес-Пералес С., Хардиссон Д., Сигудоса Дж. С., Паласиос Дж. (2004). «Амплификация гена циклина E (CCNE) и мутации hCDC4 при карциноме эндометрия». Дж. Патол. 201 (4): 589–95. Дои:10.1002 / путь.1474. PMID 14648662. S2CID 26390858.
Натери А.С., Риера-Санс Л., Да Коста С., Беренс А. (2004). «Убиквитинлигаза SCFFbw7 противодействует апоптотической передаче сигналов JNK». Наука. 303 (5662): 1374–8. Дои:10.1126 / science.1092880. PMID 14739463. S2CID 36368075.

Эта статья о ген на хромосома человека 4 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000109670 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028086 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10531037-5] Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (декабрь 1999 г.). «Семейство белков F-бокса млекопитающих». Curr Biol. 9 (20): 1180–2. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4. PMID 10531037. S2CID 14341845.

[pmid11425854-6] Gupta-Rossi N, Le Bail O, Gonen H, Brou C, Logeat F, Six E, Ciechanover A, Israël A (сентябрь 2001 г.). «Функциональное взаимодействие между SEL-10, белком F-бокса и ядерной формой активированного рецептора Notch1». J Biol Chem. 276 (37): 34371–8. Дои:10.1074 / jbc.M101343200. PMID 11425854.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: FBXW7 F-бокс и повторяющийся домен WD, содержащий 7».

[pmid20534483-8] Bengoechea-Alonso MT, Ericsson J (июнь 2010 г.). «Убиквитинлигаза Fbxw7 контролирует дифференцировку адипоцитов, воздействуя на C / EBPalpha для деградации». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (26): 11817–22. Дои:10.1073 / pnas.0913367107. ЧВК 2900639. PMID 20534483.

[pmid22388891-9] Бусино Л., Миллман С.Е., Скотто Л., Киратсус К.А., Басрур В., О'Коннор О., Хоффманн А., Эленитоба-Джонсон К.С., Пагано М. (март 2012 г.). «Опосредованная Fbxw7α и GSK3 деградация p100 является механизмом, способствующим выживанию при множественной миеломе». Природа клеточной биологии. 14 (4): 375–85. Дои:10.1038 / ncb2463. ЧВК 3339029. PMID 22388891.

[pmid23211527-10] Бусино Л., Миллман С.Е., Пагано М. (декабрь 2012 г.). «SCF-опосредованная деградация p100 (NF-κB2): механизмы и актуальность при множественной миеломе». Научная сигнализация. 5 (253): pt14. Дои:10.1126 / scisignal.2003408. ЧВК 3871187. PMID 23211527.

[pmid18765672-11] Каней-Исии К., Номура Т., Такаги Т., Ватанабе Н., Накаяма К.И., Исии С. (ноябрь 2008 г.). «Fbxw7 действует как убиквитинлигаза E3, которая нацелена на c-Myb для деградации, вызванной немо-подобной киназой (NLK)». J. Biol. Chem. 283 (45): 30540–8. Дои:10.1074 / jbc.M804340200. ЧВК 2662147. PMID 18765672.

[pmid18198341-12] Олсон Б.Л., Хок М.Б., Экхольм-Рид С., Вольшлегель Дж. А., Дев К. К., Кралли А., Рид С. И. (январь 2008 г.). «SCFCdc4 действует антагонистически по отношению к коактиватору транскрипции PGC-1alpha, направляя его на убиквитин-опосредованный протеолиз». Genes Dev. 22 (2): 252–64. Дои:10.1101 / gad.1624208. ЧВК 2192758. PMID 18198341.

[pmid12628165-13] а ^б Старополи Дж. Ф., Макдермотт С., Мартинат С., Шульман Б., Демирева Е., Абелиович А. (март 2003 г.). «Паркин является компонентом SCF-подобного комплекса убиквитинлигазы и защищает постмитотические нейроны от каинатной эксайтотоксичности». Нейрон. 37 (5): 735–49. Дои:10.1016 / s0896-6273 (03) 00084-9. PMID 12628165. S2CID 17024826.

[pmid11585921-14] Ву Г., Ляпина С., Дас И., Ли Дж., Гурни М., Поли А., Чуй И., Деше Р. Дж., Китаевски Дж. (Ноябрь 2001 г.). «SEL-10 является ингибитором передачи сигналов notch, который нацелен на notch для убиквитин-опосредованной деградации белка». Мол. Клетка. Биол. 21 (21): 7403–15. Дои:10.1128 / MCB.21.21.7403-7415.2001. ЧВК 99913. PMID 11585921.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

FBXW7 - Википедия - FBXW7

Содержание

Функция

Взаимодействия

Рекомендации

дальнейшее чтение