ФАНСА - FANCE
Анемия Фанкони, белок группы комплементации E это белок что у людей кодируется ФАНСА ген.[5][6][7] Группа комплементации анемии Фанкони (FANC) в настоящее время включает ФАНКА, FANCB, FANCC, FANCD1 (также называемый BRCA2), FANCD2, ФАНСА, FANCF, FANCG, и FANCL. Анемия Фанкони - это генетически гетерогенное рецессивное заболевание, характеризующееся цитогенетической нестабильностью, гиперчувствительностью к сшивающим агентам ДНК, повышенным разрывом хромосом и дефектной репарацией ДНК. Члены группы комплементации анемии Фанкони не имеют сходства последовательностей; они связаны своей сборкой в общий ядерный белковый комплекс. Этот ген кодирует белок для группы комплементации groufcrp E.[7]
А ядерный комплекс, содержащий белок FANCE (а также FANCC, FANCF и FANCG ) необходим для активации FANCD2 белок для моноубиквитинированный изоформа.[8] В нормальных немутантных клетках FANCD2 моноубихинируется в ответ на повреждение ДНК. FANCE вместе с FANCC действует как адаптер субстрата для этой реакции [9] Активированный белок FANCD2 локализуется совместно с BRCA1 (белок предрасположенности к раку груди) на ионизирующее излучение -индуцированные очаги и в синаптонемные комплексы из мейотический хромосомы. Активированный белок FANCD2 может действовать до инициации мейотическая рекомбинация, возможно, для подготовки хромосом к синапсам или для регулирования последующих событий рекомбинации.[8]
Экспрессия гена
Утверждается, что FANCE экспрессируется в 151 органе с самым высоким уровнем в женских половых железах.[10]
Хромосомное расположение
Расположение гена находится в 6p21.31, где p - короткое плечо хромосомы 6 в положении 21.31.[11]
Расположение на молекулярном уровне находится в парах оснований от 35 452 339 до 35 467 106 на хромосоме 6 (Homo sapiens Annotation Release 109, GRCh38.p12) [11]
Характеристики белка
Основной комплекс FA содержит ядерный мультисубъединичный комплекс, состоящий из 8 белков FA.[12] Это добавляет одну убиквитирующую цепь к FANCD2 после повреждения ДНК или удвоения давления.[13]
Для сбора FANCC, FANCE важен в ядре и в сборке основного комплекса. Некоторые характеристики FANCE заключаются в том, что он может установить себя с убиквитинированный FANCD2, BRCA2 и сконструированные ядерные фокусы. Кроме того, это единственный член, показывающий прямое соединение с FANCD2 и обеспечивающий необходимые связи между основным комплексом FA и FANCD2.[14]
В структуре FANCE есть эпитоп на его поверхности, что важно для его связывания с FANCD2. Существование повторяющегося спирального мотива было неясно при анализе аминокислот.
Структура белка
Он состоит из 13 α-спиралей, 1 310-спираль и отсутствие β-цепи. Длинная неглобулярная форма, размер n 70 Å. Ширина 30 Å и толщина 20 Å. Белок непрерывно сворачивается вправо от N- к C-концу. Идентифицировать его легко по спирали на конце C-конца.[14]
Функция
Он восстанавливает поперечные связи ДНК и необходим для накопления в ядре FANCC, обеспечивая критический мост между комплексом FA и FANCD2.[15]
Приложения
- FANCE находит применение в Вестерн-блоттинг и IHC-P (Иммуногистохимия), где предсказанная молекулярная масса составляла 58 кДа при Вестерн-блоттинге, а восстановление антигена цитратным буфером pH 6 было выполнено до начала ИГХ-П.[15]
- FANCE также используется в Генное картирование, Вот отображение гомозиготности, где он слит с 3 клетками ДНК, что поможет в расчете чувствительности к композитам митомицина С, сшивающего агента ДНК (Sigma). Затем он также исследует использование микросателлитных маркеров D6S422 и D6S1610,[16] для ссылки. Отсюда хромосомная область на хромосоме 6p расположена для FANCE.[17]
- Иммуноблоттинг показали, что мутанты FANCE-L348M и FANCE-E263K демонстрируют деление в ядерной мембране FA-E EUFA409 LCL, что указывает на то, что независимо от того, имеет ли FANCE предполагаемые сигналы ядерной локализации,[18] он ограничивается в первую очередь ядром.[19]
Взаимодействия
FANCE был показан взаимодействовать с участием:
- ФАНКА,[20][21][22][23]
- FANCD2,[22][24][25]
- FANCF[22][26]
- FANCG,[20][21][22] и
- FANCC.[20][21][22][24][26]
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112039 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000007570 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Joenje H, Lo ten Foe JR, Oostra AB, van Berkel CG, Rooimans MA, Schroeder-Kurth T., Wegner RD, Gille JJ, Buchwald M, Arwert F (сентябрь 1995 г.). «Классификация пациентов с анемией Фанкони с помощью анализа комплементации: доказательства пятого генетического подтипа». Кровь. 86 (6): 2156–60. Дои:10.1182 / blood.V86.6.2156.bloodjournal8662156. PMID 7662964.
- ^ de Winter JP, Léveillé F, van Berkel CG, Rooimans MA, van Der Weel L, Steltenpool J, Demuth I, Morgan NV, Alon N, Bosnoyan-Collins L, Lightfoot J, Leegwater PA, Waisfisz Q, Komatsu K, Arwert F , Pronk JC, Мэтью CG, Digweed M, Buchwald M, Joenje H (ноябрь 2000 г.). «Выделение кДНК, представляющей ген группы Е комплементации анемии Фанкони». Американский журнал генетики человека. 67 (5): 1306–8. Дои:10.1016 / S0002-9297 (07) 62959-0. ЧВК 1288571. PMID 11001585.
- ^ а б "Entrez Gene: анемия FANCE Fanconi, группа комплементации E".
- ^ а б Гарсия-Игера И., Танигучи Т., Ганесан С., Мейн М.С., Тиммерс С., Хейна Дж., Громпе М., Д'Андреа А.Д. (февраль 2001 г.). «Взаимодействие белков анемии Фанкони и BRCA1 в общем пути». Молекулярная клетка. 7 (2): 249–62. Дои:10.1016 / с1097-2765 (01) 00173-3. PMID 11239454.
- ^ ван Твест С., Мерфи В.Дж., Ходсон С., Тан В., Свуэк П., О'Рурк Дж. Дж., Хейерхорст Дж., Крисмани В., Динс А.Д. (январь 2017 г.). «Механизм убиквитинирования и деубиквитинирования в пути анемии Фанкони». Молекулярная клетка. 65 (2): 247–259. Дои:10.1016 / j.molcel.2016.11.005. PMID 27986371.
- ^ "FANCE - белок группы E анемии Fanconi - Homo sapiens (человек) - ген и белок FANCE". www.uniprot.org. Получено 2018-11-09.
- ^ а б «Группа комплементации FANCE FA [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-11-09.
- ^ Медхерст А. Л., Хубер П. А., Вайсфис К., де Винтер Дж. П., Мэтью К. Г. (февраль 2001 г.). «Прямые взаимодействия пяти известных белков анемии Фанкони предполагают общий функциональный путь». Молекулярная генетика человека. 10 (4): 423–9. Дои:10,1093 / чмг / 10.4.423. PMID 11157805.
- ^ Гарсия-Игера И., Танигучи Т., Ганесан С., Мейн М.С., Тиммерс С., Хейна Дж., Громпе М., Д'Андреа А.Д. (февраль 2001 г.). «Взаимодействие белков анемии Фанкони и BRCA1 в общем пути». Молекулярная клетка. 7 (2): 249–62. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00173-3. PMID 11239454.
- ^ а б Ноокала Р.К., Хуссейн С., Пеллегрини Л. (2007). «Понимание анемии Фанкони из структуры человеческого FANCE». Исследования нуклеиновых кислот. 35 (5): 1638–48. Дои:10.1093 / нар / гкм033. ЧВК 1865054. PMID 17308347.
- ^ а б "Антитело Anti-FANCE (ab126177) | Abcam". www.abcam.com. Получено 2018-11-09.
- ^ Вайсфис К., Саар К., Морган Н.В., Алтай К., Лигуотер ПА, де Винтер Дж. П., Комацу К., Эванс Г. Р., Вегнер Р. Д., Рейс А., Йоэнже Х., Арверт Ф., Мэтью К. Г., Пронк Дж. К., Дигвид М. (май 1999 г.). «Ген анемии Фанкони группы E, FANCE, отображается на хромосоме 6p». Американский журнал генетики человека. 64 (5): 1400–5. Дои:10.1086/302385. ЧВК 1377877. PMID 10205272.
- ^ Вайсфис К., Саар К., Морган Н.В., Алтай К., Лигуотер ПА, де Винтер Дж. П., Комацу К., Эванс Г. Р., Вегнер Р. Д., Рейс А., Йоэнже Х., Арверт Ф., Мэтью К. Г., Пронк Дж. К., Дигвид М. (май 1999 г.). «Ген анемии Фанкони группы E, FANCE, отображается на хромосоме 6p». Американский журнал генетики человека. 64 (5): 1400–5. Дои:10.1086/302385. ЧВК 1377877. PMID 10205272.
- ^ de Winter JP, Léveillé F, van Berkel CG, Rooimans MA, van Der Weel L, Steltenpool J, Demuth I, Morgan NV, Alon N, Bosnoyan-Collins L, Lightfoot J, Leegwater PA, Waisfisz Q, Komatsu K, Arwert F , Pronk JC, Мэтью CG, Digweed M, Buchwald M, Joenje H (ноябрь 2000 г.). «Выделение кДНК, представляющей ген группы Е комплементации анемии Фанкони». Американский журнал генетики человека. 67 (5): 1306–8. Дои:10.1016 / с0002-9297 (07) 62959-0. ЧВК 1288571. PMID 11001585.
- ^ Танигучи Т., Д'Андреа А.Д. (октябрь 2002 г.). «Белок анемии Fanconi, FANCE, способствует накоплению FANCC в ядрах». Кровь. 100 (7): 2457–62. Дои:10.1182 / кровь-2002-03-0860. PMID 12239156.
- ^ а б c Танигучи Т., Д'Андреа А.Д. (октябрь 2002 г.). «Белок анемии Fanconi, FANCE, способствует накоплению FANCC в ядрах». Кровь. 100 (7): 2457–62. Дои:10.1182 / кровь-2002-03-0860. PMID 12239156.
- ^ а б c Медхерст А. Л., Хубер П. А., Вайсфис К., де Винтер Дж. П., Мэтью К. Г. (февраль 2001 г.). «Прямые взаимодействия пяти известных белков анемии Фанкони предполагают общий функциональный путь». Молекулярная генетика человека. 10 (4): 423–9. Дои:10,1093 / чмг / 10.4.423. PMID 11157805.
- ^ а б c d е Пейс П., Джонсон М., Тан В. М., Мозедейл Г., С. С., Хоатлин М., де Винтер Дж., Йоэндж Х., Гергели Ф., Патель К. Дж. (Июль 2002 г.). «FANCE: связь между сборкой и активностью комплекса анемии Фанкони». Журнал EMBO. 21 (13): 3414–23. Дои:10.1093 / emboj / cdf355. ЧВК 125396. PMID 12093742.
- ^ Meetei AR, de Winter JP, Medhurst AL, Wallisch M, Waisfisz Q, van de Vrugt HJ, Oostra AB, Yan Z, Ling C, Bishop CE, Hoatlin ME, Joenje H, Wang W (октябрь 2003 г.). «Новая убиквитинлигаза недостаточна при анемии Фанкони». Природа Генетика. 35 (2): 165–70. Дои:10,1038 / ng1241. PMID 12973351. S2CID 10149290.
- ^ а б Гордон С.М., Бухвальд М. (июль 2003 г.). «Белковый комплекс анемии Фанкони: картирование белковых взаимодействий в дрожжевых 2- и 3-гибридных системах». Кровь. 102 (1): 136–41. Дои:10.1182 / кровь-2002-11-3517. PMID 12649160.
- ^ Хуссейн С., Уилсон Дж. Б., Медхерст А. Л., Хейна Дж., Витт Э, Анант С., Дэвис А., Массон Дж. Ю., Моисей Р., Вест СК, де Винтер Дж. П., Эшворт А., Джонс, Нью-Джерси, Мэтью К. Г. (июнь 2004 г.). «Прямое взаимодействие FANCD2 с BRCA2 в путях ответа на повреждение ДНК». Молекулярная генетика человека. 13 (12): 1241–8. Дои:10,1093 / hmg / ddh135. PMID 15115758.
- ^ а б Левейе Ф., Блом Э., Медхерст А.Л., Бир П., Лагмани М., Джонсон М., Ройманс М.А., Собек А., Вайсфис К., Арверт Ф., Патель К.Дж., Хоатлин М.Э., Джоендже Х., де Винтер Дж.П. (сентябрь 2004 г.). «Продукт гена анемии Фанкони FANCF представляет собой гибкий адаптерный белок». Журнал биологической химии. 279 (38): 39421–30. Дои:10.1074 / jbc.M407034200. PMID 15262960.
дальнейшее чтение
- Wegner RD, Henrichs I, Joenje H, Schroeder-Kurth T. (декабрь 1996 г.). «Группа комплементации анемии Фанкони E: клинико-цитогенетические данные первого пациента». Клиническая генетика. 50 (6): 479–82. Дои:10.1111 / j.1399-0004.1996.tb02716.x. PMID 9147877. S2CID 23242981.
- Joenje H, Oostra AB, Wijker M, di Summa FM, van Berkel CG, Rooimans MA, Ebell W, van Weel M, Pronk JC, Buchwald M, Arwert F (октябрь 1997 г.). «Доказательства по крайней мере восьми генов анемии Фанкони». Американский журнал генетики человека. 61 (4): 940–4. Дои:10.1086/514881. ЧВК 1715980. PMID 9382107.
- Вайсфис К., Саар К., Морган Н.В., Алтай К., Лигуотер П.А., де Винтер Дж. П., Комацу К., Эванс Г.Р., Вегнер Р.Д., Рейс А., Йоендже Х., Арверт Ф., Мэтью К.Г., Пронк Дж. «Ген анемии Фанкони группы E, FANCE, отображается на хромосоме 6p». Американский журнал генетики человека. 64 (5): 1400–5. Дои:10.1086/302385. ЧВК 1377877. PMID 10205272.
- Медхерст А. Л., Хубер П. А., Вайсфис К., де Винтер Дж. П., Мэтью К. Г. (февраль 2001 г.). «Прямые взаимодействия пяти известных белков анемии Фанкони предполагают общий функциональный путь». Молекулярная генетика человека. 10 (4): 423–9. Дои:10,1093 / чмг / 10.4.423. PMID 11157805.
- Пейс П., Джонсон М., Тан В. М., Мозедейл Г., С. С., Хоатлин М., де Винтер Дж., Йоэндж Х., Гергели Ф., Патель К. Дж. (Июль 2002 г.). «FANCE: связь между сборкой и активностью комплекса анемии Фанкони». Журнал EMBO. 21 (13): 3414–23. Дои:10.1093 / emboj / cdf355. ЧВК 125396. PMID 12093742.
- Танигучи Т., Д'Андреа А.Д. (октябрь 2002 г.). «Белок анемии Fanconi, FANCE, способствует накоплению FANCC в ядрах». Кровь. 100 (7): 2457–62. Дои:10.1182 / кровь-2002-03-0860. PMID 12239156.
- Гордон С.М., Бухвальд М. (июль 2003 г.). «Белковый комплекс анемии Фанкони: картирование белковых взаимодействий в дрожжевых 2- и 3-гибридных системах». Кровь. 102 (1): 136–41. Дои:10.1182 / кровь-2002-11-3517. PMID 12649160.
- Meetei AR, Sechi S, Wallisch M, Yang D, Young MK, Joenje H, Hoatlin ME, Wang W (май 2003 г.). «Мультипротеиновый ядерный комплекс связывает анемию Фанкони и синдром Блума». Молекулярная и клеточная биология. 23 (10): 3417–26. Дои:10.1128 / MCB.23.10.3417-3426.2003. ЧВК 164758. PMID 12724401.
- Meetei AR, de Winter JP, Medhurst AL, Wallisch M, Waisfisz Q, van de Vrugt HJ, Oostra AB, Yan Z, Ling C, Bishop CE, Hoatlin ME, Joenje H, Wang W (октябрь 2003 г.). «Новая убиквитинлигаза недостаточна при анемии Фанкони». Природа Генетика. 35 (2): 165–70. Дои:10,1038 / ng1241. PMID 12973351. S2CID 10149290.
- Хуссейн С., Уилсон Дж. Б., Медхерст А. Л., Хейна Дж., Витт Э, Анант С., Дэвис А., Массон Дж. Ю., Моисей Р., Вест СК, де Винтер Дж. П., Эшворт А., Джонс, Нью-Джерси, Мэтью К. Г. (июнь 2004 г.). «Прямое взаимодействие FANCD2 с BRCA2 в путях ответа на повреждение ДНК». Молекулярная генетика человека. 13 (12): 1241–8. Дои:10,1093 / hmg / ddh135. PMID 15115758.
- Ван Х, Андреассен ПР, Д'Андреа А.Д. (июль 2004 г.). «Функциональное взаимодействие моноубиквитинированных FANCD2 и BRCA2 / FANCD1 в хроматине». Молекулярная и клеточная биология. 24 (13): 5850–62. Дои:10.1128 / MCB.24.13.5850-5862.2004. ЧВК 480901. PMID 15199141.
- Meetei AR, Levitus M, Xue Y, Medhurst AL, Zwaan M, Ling C, Rooimans MA, Bier P, Hoatlin M, Pals G, de Winter JP, Wang W, Joenje H (ноябрь 2004 г.). «Х-сцепленное наследование группы В комплементации анемии Фанкони». Природа Генетика. 36 (11): 1219–24. Дои:10,1038 / ng1458. PMID 15502827.
- Meetei AR, Medhurst AL, Ling C, Xue Y, Singh TR, Bier P, Steltenpool J, Stone S, Dokal I, Mathew CG, Hoatlin M, Joenje H, de Winter JP, Wang W (сентябрь 2005 г.). «Человеческий ортолог белка репарации ДНК архей Hef является дефектным в группе комплементации анемии Фанкони M». Природа Генетика. 37 (9): 958–63. Дои:10,1038 / ng1626. ЧВК 2704909. PMID 16116422.
- Гордон С.М., Алон Н., Бухвальд М. (октябрь 2005 г.). «FANCC, FANCE и FANCD2 образуют тройной комплекс, необходимый для целостности пути ответа на повреждение ДНК при анемии Фанкони». Журнал биологической химии. 280 (43): 36118–25. Дои:10.1074 / jbc.M507758200. PMID 16127171.
внешние ссылки
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q9HB96 (Белок группы Е анемии Фанкони) на PDBe-KB.
Эта статья о ген на хромосома человека 6 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |