ФАНСА - FANCE

ФАНСА
Протеин FANCE PDB 2ilr.png
Доступные конструкции
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыФАНСА, FACE, FAE, группа комплементации анемии Фанкони E, группа комплементации FA E
Внешние идентификаторыOMIM: 613976 MGI: 1920025 ГомолоГен: 11066 Генные карты: ФАНСА
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное местоположение для FANCE
Геномное местоположение для FANCE
Группа6п21.31Начните35,452,338 бп[1]
Конец35,467,102 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE FANCE 220255 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_021922

NM_001163819
NM_001163820
NM_028348

RefSeq (белок)

NP_068741

н / д

Расположение (UCSC)Chr 6: 35.45 - 35.47 МбChr 17: 28.31 - 28.33 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Анемия Фанкони, белок группы комплементации E это белок что у людей кодируется ФАНСА ген.[5][6][7] Группа комплементации анемии Фанкони (FANC) в настоящее время включает ФАНКА, FANCB, FANCC, FANCD1 (также называемый BRCA2), FANCD2, ФАНСА, FANCF, FANCG, и FANCL. Анемия Фанкони - это генетически гетерогенное рецессивное заболевание, характеризующееся цитогенетической нестабильностью, гиперчувствительностью к сшивающим агентам ДНК, повышенным разрывом хромосом и дефектной репарацией ДНК. Члены группы комплементации анемии Фанкони не имеют сходства последовательностей; они связаны своей сборкой в ​​общий ядерный белковый комплекс. Этот ген кодирует белок для группы комплементации groufcrp E.[7]

А ядерный комплекс, содержащий белок FANCE (а также FANCC, FANCF и FANCG ) необходим для активации FANCD2 белок для моноубиквитинированный изоформа.[8] В нормальных немутантных клетках FANCD2 моноубихинируется в ответ на повреждение ДНК. FANCE вместе с FANCC действует как адаптер субстрата для этой реакции [9] Активированный белок FANCD2 локализуется совместно с BRCA1 (белок предрасположенности к раку груди) на ионизирующее излучение -индуцированные очаги и в синаптонемные комплексы из мейотический хромосомы. Активированный белок FANCD2 может действовать до инициации мейотическая рекомбинация, возможно, для подготовки хромосом к синапсам или для регулирования последующих событий рекомбинации.[8]

Экспрессия гена

Утверждается, что FANCE экспрессируется в 151 органе с самым высоким уровнем в женских половых железах.[10]

Хромосомное расположение

Расположение гена находится в 6p21.31, где p - короткое плечо хромосомы 6 в положении 21.31.[11]

Расположение на молекулярном уровне находится в парах оснований от 35 452 339 до 35 467 106 на хромосоме 6 (Homo sapiens Annotation Release 109, GRCh38.p12) [11]

Характеристики белка

Основной комплекс FA содержит ядерный мультисубъединичный комплекс, состоящий из 8 белков FA.[12] Это добавляет одну убиквитирующую цепь к FANCD2 после повреждения ДНК или удвоения давления.[13]

Для сбора FANCC, FANCE важен в ядре и в сборке основного комплекса. Некоторые характеристики FANCE заключаются в том, что он может установить себя с убиквитинированный FANCD2, BRCA2 и сконструированные ядерные фокусы. Кроме того, это единственный член, показывающий прямое соединение с FANCD2 и обеспечивающий необходимые связи между основным комплексом FA и FANCD2.[14]

В структуре FANCE есть эпитоп на его поверхности, что важно для его связывания с FANCD2. Существование повторяющегося спирального мотива было неясно при анализе аминокислот.

Структура белка

Он состоит из 13 α-спиралей, 1 310-спираль и отсутствие β-цепи. Длинная неглобулярная форма, размер n 70 Å. Ширина 30 Å и толщина 20 Å. Белок непрерывно сворачивается вправо от N- к C-концу. Идентифицировать его легко по спирали на конце C-конца.[14]

Функция

Он восстанавливает поперечные связи ДНК и необходим для накопления в ядре FANCC, обеспечивая критический мост между комплексом FA и FANCD2.[15]

Приложения

  • FANCE находит применение в Вестерн-блоттинг и IHC-P (Иммуногистохимия), где предсказанная молекулярная масса составляла 58 кДа при Вестерн-блоттинге, а восстановление антигена цитратным буфером pH 6 было выполнено до начала ИГХ-П.[15]
  • FANCE также используется в Генное картирование, Вот отображение гомозиготности, где он слит с 3 клетками ДНК, что поможет в расчете чувствительности к композитам митомицина С, сшивающего агента ДНК (Sigma). Затем он также исследует использование микросателлитных маркеров D6S422 и D6S1610,[16] для ссылки. Отсюда хромосомная область на хромосоме 6p расположена для FANCE.[17]
  • Иммуноблоттинг показали, что мутанты FANCE-L348M и FANCE-E263K демонстрируют деление в ядерной мембране FA-E EUFA409 LCL, что указывает на то, что независимо от того, имеет ли FANCE предполагаемые сигналы ядерной локализации,[18] он ограничивается в первую очередь ядром.[19]

Взаимодействия

FANCE был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112039 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000007570 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Joenje H, Lo ten Foe JR, Oostra AB, van Berkel CG, Rooimans MA, Schroeder-Kurth T., Wegner RD, Gille JJ, Buchwald M, Arwert F (сентябрь 1995 г.). «Классификация пациентов с анемией Фанкони с помощью анализа комплементации: доказательства пятого генетического подтипа». Кровь. 86 (6): 2156–60. Дои:10.1182 / blood.V86.6.2156.bloodjournal8662156. PMID  7662964.
  6. ^ de Winter JP, Léveillé F, van Berkel CG, Rooimans MA, van Der Weel L, Steltenpool J, Demuth I, Morgan NV, Alon N, Bosnoyan-Collins L, Lightfoot J, Leegwater PA, Waisfisz Q, Komatsu K, Arwert F , Pronk JC, Мэтью CG, Digweed M, Buchwald M, Joenje H (ноябрь 2000 г.). «Выделение кДНК, представляющей ген группы Е комплементации анемии Фанкони». Американский журнал генетики человека. 67 (5): 1306–8. Дои:10.1016 / S0002-9297 (07) 62959-0. ЧВК  1288571. PMID  11001585.
  7. ^ а б "Entrez Gene: анемия FANCE Fanconi, группа комплементации E".
  8. ^ а б Гарсия-Игера И., Танигучи Т., Ганесан С., Мейн М.С., Тиммерс С., Хейна Дж., Громпе М., Д'Андреа А.Д. (февраль 2001 г.). «Взаимодействие белков анемии Фанкони и BRCA1 в общем пути». Молекулярная клетка. 7 (2): 249–62. Дои:10.1016 / с1097-2765 (01) 00173-3. PMID  11239454.
  9. ^ ван Твест С., Мерфи В.Дж., Ходсон С., Тан В., Свуэк П., О'Рурк Дж. Дж., Хейерхорст Дж., Крисмани В., Динс А.Д. (январь 2017 г.). «Механизм убиквитинирования и деубиквитинирования в пути анемии Фанкони». Молекулярная клетка. 65 (2): 247–259. Дои:10.1016 / j.molcel.2016.11.005. PMID  27986371.
  10. ^ "FANCE - белок группы E анемии Fanconi - Homo sapiens (человек) - ген и белок FANCE". www.uniprot.org. Получено 2018-11-09.
  11. ^ а б «Группа комплементации FANCE FA [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-11-09.
  12. ^ Медхерст А. Л., Хубер П. А., Вайсфис К., де Винтер Дж. П., Мэтью К. Г. (февраль 2001 г.). «Прямые взаимодействия пяти известных белков анемии Фанкони предполагают общий функциональный путь». Молекулярная генетика человека. 10 (4): 423–9. Дои:10,1093 / чмг / 10.4.423. PMID  11157805.
  13. ^ Гарсия-Игера И., Танигучи Т., Ганесан С., Мейн М.С., Тиммерс С., Хейна Дж., Громпе М., Д'Андреа А.Д. (февраль 2001 г.). «Взаимодействие белков анемии Фанкони и BRCA1 в общем пути». Молекулярная клетка. 7 (2): 249–62. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00173-3. PMID  11239454.
  14. ^ а б Ноокала Р.К., Хуссейн С., Пеллегрини Л. (2007). «Понимание анемии Фанкони из структуры человеческого FANCE». Исследования нуклеиновых кислот. 35 (5): 1638–48. Дои:10.1093 / нар / гкм033. ЧВК  1865054. PMID  17308347.
  15. ^ а б "Антитело Anti-FANCE (ab126177) | Abcam". www.abcam.com. Получено 2018-11-09.
  16. ^ Вайсфис К., Саар К., Морган Н.В., Алтай К., Лигуотер ПА, де Винтер Дж. П., Комацу К., Эванс Г. Р., Вегнер Р. Д., Рейс А., Йоэнже Х., Арверт Ф., Мэтью К. Г., Пронк Дж. К., Дигвид М. (май 1999 г.). «Ген анемии Фанкони группы E, FANCE, отображается на хромосоме 6p». Американский журнал генетики человека. 64 (5): 1400–5. Дои:10.1086/302385. ЧВК  1377877. PMID  10205272.
  17. ^ Вайсфис К., Саар К., Морган Н.В., Алтай К., Лигуотер ПА, де Винтер Дж. П., Комацу К., Эванс Г. Р., Вегнер Р. Д., Рейс А., Йоэнже Х., Арверт Ф., Мэтью К. Г., Пронк Дж. К., Дигвид М. (май 1999 г.). «Ген анемии Фанкони группы E, FANCE, отображается на хромосоме 6p». Американский журнал генетики человека. 64 (5): 1400–5. Дои:10.1086/302385. ЧВК  1377877. PMID  10205272.
  18. ^ de Winter JP, Léveillé F, van Berkel CG, Rooimans MA, van Der Weel L, Steltenpool J, Demuth I, Morgan NV, Alon N, Bosnoyan-Collins L, Lightfoot J, Leegwater PA, Waisfisz Q, Komatsu K, Arwert F , Pronk JC, Мэтью CG, Digweed M, Buchwald M, Joenje H (ноябрь 2000 г.). «Выделение кДНК, представляющей ген группы Е комплементации анемии Фанкони». Американский журнал генетики человека. 67 (5): 1306–8. Дои:10.1016 / с0002-9297 (07) 62959-0. ЧВК  1288571. PMID  11001585.
  19. ^ Танигучи Т., Д'Андреа А.Д. (октябрь 2002 г.). «Белок анемии Fanconi, FANCE, способствует накоплению FANCC в ядрах». Кровь. 100 (7): 2457–62. Дои:10.1182 / кровь-2002-03-0860. PMID  12239156.
  20. ^ а б c Танигучи Т., Д'Андреа А.Д. (октябрь 2002 г.). «Белок анемии Fanconi, FANCE, способствует накоплению FANCC в ядрах». Кровь. 100 (7): 2457–62. Дои:10.1182 / кровь-2002-03-0860. PMID  12239156.
  21. ^ а б c Медхерст А. Л., Хубер П. А., Вайсфис К., де Винтер Дж. П., Мэтью К. Г. (февраль 2001 г.). «Прямые взаимодействия пяти известных белков анемии Фанкони предполагают общий функциональный путь». Молекулярная генетика человека. 10 (4): 423–9. Дои:10,1093 / чмг / 10.4.423. PMID  11157805.
  22. ^ а б c d е Пейс П., Джонсон М., Тан В. М., Мозедейл Г., С. С., Хоатлин М., де Винтер Дж., Йоэндж Х., Гергели Ф., Патель К. Дж. (Июль 2002 г.). «FANCE: связь между сборкой и активностью комплекса анемии Фанкони». Журнал EMBO. 21 (13): 3414–23. Дои:10.1093 / emboj / cdf355. ЧВК  125396. PMID  12093742.
  23. ^ Meetei AR, de Winter JP, Medhurst AL, Wallisch M, Waisfisz Q, van de Vrugt HJ, Oostra AB, Yan Z, Ling C, Bishop CE, Hoatlin ME, Joenje H, Wang W (октябрь 2003 г.). «Новая убиквитинлигаза недостаточна при анемии Фанкони». Природа Генетика. 35 (2): 165–70. Дои:10,1038 / ng1241. PMID  12973351. S2CID  10149290.
  24. ^ а б Гордон С.М., Бухвальд М. (июль 2003 г.). «Белковый комплекс анемии Фанкони: картирование белковых взаимодействий в дрожжевых 2- и 3-гибридных системах». Кровь. 102 (1): 136–41. Дои:10.1182 / кровь-2002-11-3517. PMID  12649160.
  25. ^ Хуссейн С., Уилсон Дж. Б., Медхерст А. Л., Хейна Дж., Витт Э, Анант С., Дэвис А., Массон Дж. Ю., Моисей Р., Вест СК, де Винтер Дж. П., Эшворт А., Джонс, Нью-Джерси, Мэтью К. Г. (июнь 2004 г.). «Прямое взаимодействие FANCD2 с BRCA2 в путях ответа на повреждение ДНК». Молекулярная генетика человека. 13 (12): 1241–8. Дои:10,1093 / hmg / ddh135. PMID  15115758.
  26. ^ а б Левейе Ф., Блом Э., Медхерст А.Л., Бир П., Лагмани М., Джонсон М., Ройманс М.А., Собек А., Вайсфис К., Арверт Ф., Патель К.Дж., Хоатлин М.Э., Джоендже Х., де Винтер Дж.П. (сентябрь 2004 г.). «Продукт гена анемии Фанкони FANCF представляет собой гибкий адаптерный белок». Журнал биологической химии. 279 (38): 39421–30. Дои:10.1074 / jbc.M407034200. PMID  15262960.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q9HB96 (Белок группы Е анемии Фанкони) на PDBe-KB.