Фибрилларин - Википедия - Fibrillarin
| Фибрилларин | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 pyrococcus horikoshii, фибрилларин, пре-РРНК, процессирующий белок | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Фибрилларин | ||||||||
| Pfam | PF01269 | ||||||||
| Pfam клан | CL0063 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000692 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00489 | ||||||||
| SCOP2 | 1фбн / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
рРНК 2'-O-метилтрансфераза фибрилларин является фермент что у людей кодируется FBL ген.[5][6][7]
Функция
Этот генный продукт является компонентом ядрышковой частицы малого ядерного рибонуклеопротеина (snRNP), которая, как считается, участвует на первом этапе процессинга прерибосомной (r) РНК. Это связано с U3, U8, и U13 малых ядрышковых РНК и располагается в плотном фибриллярном компоненте (ДФК) ядрышко. Кодируемый белок содержит N-концевой повторяющийся домен, который богат остатками глицина и аргинина, как и фибрилларины у других видов. Его центральная область напоминает РНК-связывающий домен и содержит консенсусную последовательность РНП. Антисыворотки примерно 8% людей с аутоиммунным заболеванием склеродермия узнают фибрилларин.[7]
Фибрилларин является компонентом нескольких рибонуклеопротеидов, включая ядрышковый малый ядерный рибонуклеопротеин (SnRNP ) и один из двух классов малые ядрышковые рибонуклеопротеины (сноРНП). SnRNA функционируют в Сплайсинг РНК в то время как snoRNPs функционируют в рибосомная РНК обработка.
Фибрилларин связан с U3, U8 и U13. малые ядерные РНК у млекопитающих и аналогичен дрожжевому белку NOP1. Фибрилларин имеет хорошо консервативную последовательность из примерно 320 аминокислот и содержит 3 домена: N-концевую область, богатую Gly / Arg; центральный домен, напоминающий другие РНК-связывающие белки и содержащий консенсусную последовательность, подобную РНП-2; и С-концевой альфа-спиральный домен. Эволюционно связанный белок процессинга пре-рРНК, у которого отсутствует домен, богатый Gly / Arg, был обнаружен у различных архей.
Исследование Schultz et al. показали, что белок 15,5 кДа, связывающий K-поворот (называемый у дрожжей Snu13), взаимодействует с сплайсосома белки hPRP31, hPRP3, hPRP4, CYPH и небольшие ядрышковые рибонуклеопротеины NOP56, NOP58 и фибрилларин. Белок 15,5 кДа имеет сходство последовательностей с другими РНК-связывающими белками, такими как рибосомные белки S12, L7a и L30 и белок snoRNP. NHP2. SnRNP U4 / U6 содержит белок массой 15,5 кДа.[8] Белок 15,5 кДа также существует в составе рибонуклеопротеинового комплекса, который связывает мотив B / C U3-бокса. Белок 15,5 кДа также существует как один из четырех ядерных белков C / D малый ядрышковый рибонуклеопротеин который опосредует метилирование прерибосомных РНК.
Структурные доказательства, подтверждающие идею о том, что фибрилларин является мяРНК метилтрансфераза был рассмотрен.[9]
Взаимодействия
Было показано, что фибрилларин взаимодействовать с DDX5[10] и SMN1.[11]
Рекомендации
- ^ а б c ENSG00000280548 GRCh38: Общий выпуск 89: ENSG00000105202, ENSG00000280548 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000046865 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Aris JP, Blobel G (февраль 1991 г.). «Клонирование кДНК и секвенирование человеческого фибрилларина, консервативного ядрышкового белка, распознаваемого аутоиммунными антисыворотками». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (3): 931–5. Bibcode:1991ПНАС ... 88..931А. Дои:10.1073 / пнас.88.3.931. ЧВК 50928. PMID 1846968.
- ^ Янсен Р.П., Hurt EC, Керн Х., Лехтонен Х., Кармо-Фонсека М., Лапейре Б., Толлервей Д. (май 1991 г.). «Эволюционное сохранение человеческого ядрышкового белка фибрилларина и его функциональная экспрессия в дрожжах». Журнал клеточной биологии. 113 (4): 715–29. Дои:10.1083 / jcb.113.4.715. ЧВК 2288999. PMID 2026646.
- ^ а б «Энтрез Ген: фибрилларин FBL».
- ^ Контакты белок-белок и белок-РНК вносят вклад в 15.5K-опосредованную сборку snRNP U4 / U6 и snoRNP Box C / D Аннемари Шульц, Стефани Ноттротт, Николас Джеймс Уоткинс и Рейнхард Люрманн в Молекулярная и клеточная биология (2006) Том 26, страницы 5146–5154.
- ^ Строение и функция малых ядрышковых рибонуклеопротеидов Стив Л. Рейчоу, Томоко Хамма, Адриан Р. Ферре-д'Амаре и Габриэле Варани в Исследования нуклеиновых кислот (2007) Том 35, страницы 1452–1464.
- ^ Николь С.М., Каушевич М., Прескотт А.Р., Фуллер-Пейс Ф.В. (июнь 2000 г.). «Ядерная DEAD-бокс-РНК геликаза p68 взаимодействует с ядрышковым белком фибрилларином и специфически колокализуется в формирующихся ядрышках во время телофазы». Экспериментальные исследования клеток. 257 (2): 272–80. Дои:10.1006 / excr.2000.4886. PMID 10837141.
- ^ Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (июль 2001 г.). «Белок выживания мотонейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1». Текущая биология. 11 (14): 1079–88. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00316-5. PMID 11509230. S2CID 12392702.
дальнейшее чтение
- Baserga SJ, Yang XD, Steitz JA (сентябрь 1991 г.). «Неповрежденная последовательность Box C в мяРНК U3 необходима для связывания фибрилларина, белка, общего для основного семейства ядрышковых мяРНП». Журнал EMBO. 10 (9): 2645–51. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07807.x. ЧВК 452965. PMID 1714385.
- Окано Ю., Стин В.Д., Медсгер Т.А. (январь 1992 г.). «Аутоантитела к ядрышечному рибонуклеопротеину U3 (фибрилларин) у пациентов с системным склерозом». Артрит и ревматизм. 35 (1): 95–100. Дои:10.1002 / арт.1780350114. PMID 1731817.
- Lischwe MA, Ochs RL, Reddy R, Cook RG, Yeoman LC, Tan EM, Reichlin M, Busch H (ноябрь 1985 г.). «Очистка и частичная характеристика антигена ядрышковой склеродермии (Mr = 34000; pI, 8,5), богатого NG, NG-диметиларгинином». Журнал биологической химии. 260 (26): 14304–10. PMID 2414294.
- Méhes G, Pajor L (июнь 1995 г.). «Экспрессия нуклеолина и фибрилларина в стимулированных лимфоцитах и дифференцирующихся клетках HL-60. Анализ проточной цитометрии». Распространение клеток. 28 (6): 329–36. Дои:10.1111 / j.1365-2184.1995.tb00074.x. PMID 7626687. S2CID 34753195.
- Лю Кью, Дрейфус Джи (июль 1996 г.). «Новая ядерная структура, содержащая выживший белок двигательных нейронов». Журнал EMBO. 15 (14): 3555–65. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00725.x. ЧВК 451956. PMID 8670859.
- Магулас С., Зацепина О.В., Джордан П.В., Джордан Э.Г., Фрид М. (февраль 1998 г.). «Белок SURF-6 является компонентом ядрышкового матрикса и обладает высокой способностью связывания нуклеиновых кислот in vitro». Европейский журнал клеточной биологии. 75 (2): 174–83. Дои:10.1016 / s0171-9335 (98) 80059-9. PMID 9548374.
- Ай Л.С., Линь СН, Се М., Ли К. (октябрь 1999 г.). «Метилирование аргинина глицина и богатого аргинином пептида, полученного из последовательностей человеческого FMRP и фибрилларина». Труды Национального научного совета Китайской Республики. Часть B, Науки о жизни. 23 (4): 175–80. PMID 10518318.
- Пинтар Л., Кресслер Д., Лапейр Б. (февраль 2000 г.). «Spb1p представляет собой ядрышковый белок дрожжей, связанный с Nop1p и Nop58p, который способен связывать S-аденозил-L-метионин in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 20 (4): 1370–81. Дои:10.1128 / MCB.20.4.1370-1381.2000. ЧВК 85287. PMID 10648622.
- Николь С.М., Каушевич М., Прескотт А.Р., Фуллер-Пейс Ф.В. (июнь 2000 г.). «Ядерная DEAD-бокс-РНК геликаза p68 взаимодействует с ядрышковым белком фибрилларином и специфически колокализуется в формирующихся ядрышках во время телофазы». Экспериментальные исследования клеток. 257 (2): 272–80. Дои:10.1006 / excr.2000.4886. PMID 10837141.
- Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (июль 2001 г.). «Белок выживания мотонейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1». Текущая биология. 11 (14): 1079–88. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00316-5. PMID 11509230. S2CID 12392702.
- Чжоу X, Тан Ф.К., Сюн М., Милевич Д.М., Фегали, Калифорния, Фрицлер М.Дж., Ревейлл Д.Д., Арнетт ФК (декабрь 2001 г.). «Системный склероз (склеродермия): определенные аутоантигенные гены избирательно сверхэкспрессируются в фибробластах склеродермии». Журнал иммунологии. 167 (12): 7126–33. Дои:10.4049 / jimmunol.167.12.7126. PMID 11739535.
- Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х., Манн М., Ламонд А. И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Текущая биология. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
- Cimato TR, Tang J, Xu Y, Guarnaccia C, Herschman HR, Pongor S, Aletta JM (февраль 2002 г.). «Опосредованное фактором роста нервов увеличение метилирования белка происходит преимущественно на сайтах метилирования аргинина I типа и включает протеин-аргининметилтрансферазу 1». Журнал неврологических исследований. 67 (4): 435–42. Дои:10.1002 / jnr.10123. PMID 11835310. S2CID 8041481.
- Fujiyama S, Yanagida M, Hayano T., Miura Y, Isobe T., Fujimori F, Uchida T, Takahashi N (июнь 2002 г.). «Выделение и протеомная характеристика прерибосомных рибонуклеопротеиновых комплексов человека, связывающих парвулин». Журнал биологической химии. 277 (26): 23773–80. Дои:10.1074 / jbc.M201181200. PMID 11960984.
- Whitehead SE, Jones KW, Zhang X, Cheng X, Terns RM, Terns MP (декабрь 2002 г.). «Детерминанты взаимодействия белка SMN, вызывающего мышечную атрофию позвоночника, с диметиларгинин-модифицированным боксом H / ACA малым ядрышковым рибонуклеопротеином GAR1». Журнал биологической химии. 277 (50): 48087–93. Дои:10.1074 / jbc.M204551200. PMID 12244096.
- Эррера-Эспарса Р., Крузе Л., фон Эссен М., Кампос Л., Барбоса О., Боллен Дж. Дж., Бадильо И., Авалос-Диас Е. (октябрь 2002 г.). «U3 snoRNP связывается с фибрилларином, компонентом комковатого ядрышкового домена склеродермии». Архив дерматологических исследований. 294 (7): 310–7. Дои:10.1007 / s00403-002-0338-7. PMID 12373336. S2CID 10316081.
- Chen M, Rockel T, Steinweger G, Hemmerich P, Risch J, von Mikecz A (октябрь 2002 г.). «Субклеточное рекрутирование фибрилларина в нуклеоплазматические протеасомы: последствия для процессинга ядрышкового аутоантигена». Молекулярная биология клетки. 13 (10): 3576–87. Дои:10.1091 / mbc.02-05-0083. ЧВК 129967. PMID 12388758.
- Уоткинс, штат Нью-Джерси, Дикманнс А., Люрманн Р. (декабрь 2002 г.). «Консервативный стебель II бокс-мотива C / D важен для локализации ядрышка и необходим вместе с белком 15.5K для иерархической сборки бокс-C / D snoRNP». Молекулярная и клеточная биология. 22 (23): 8342–52. Дои:10.1128 / MCB.22.23.8342-8352.2002. ЧВК 134055. PMID 12417735.
PDB галерея | |
|---|---|
|
