Fibrobacter succinogenes - Fibrobacter succinogenes

Фибробактерии
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Тип:
Фибробактерии
Учебный класс:
Фибробактерии
Заказ:
Fibrobacterales
Семья:
Fibrobacteraceae
Род:
Фибробактер
Разновидность:
F. succinogenes
Биномиальное имя
Fibrobacter succinogenes
(Hungate, 1950) Montgomery et al., 1988
Подвиды
Синонимы
  • Bacteroides succinogenes Hungate, 1950 год.
  • Ruminobacter succinogenes (Hungate, 1950) Prevot, 1966

Fibrobacter succinogenes целлюлозолитик бактерия виды в роду Фибробактер. Он присутствует в рубец крупного рогатого скота. Бета-глюканы - его предпочтительный субстрат в рубце, а продукты его переваривания включают формиат, ацетат и сукцинат. Fibrobacter succinogenes образует характерные протяженные бороздки в кристаллический целлюлоза, а также довольно легко отделяется от подложки при пробоподготовке.[1]

Близкие отношения Fibrobacter succinogenes к Bacteroidetes и Хлороби тип

Филогенетические исследования, основанные на последовательностях белков RpoC и гиразы B, показывают, что Fibrobacter succinogenes тесно связан с видами из филы Bacteroidetes и Хлороби.[2] Fibrobacter succinogenes и виды из этих двух других филюмов также разветвляются в том же положении на основе консервативных инделей сигнатур в ряде важных белков.[3] И, наконец, что наиболее важно, сравнительные геномные исследования выявили две консервативные сигнатуры инделей (вставка из 5-7 аминокислот в белке RpoC и вставка из 13-16 аминокислот в серин гидроксиметилтрансфераза ) и один сигнатурный белок (PG00081), которые уникально разделяются Fibrobacter succinogenes и все виды из Bacteroidetes и Хлороби тип.[4] Все эти результаты убедительно свидетельствуют о том, что Fibrobacter succinogenes разделял общего предка с Bacteroidetes и Хлороби виды, за исключением всех других бактерий, и эти виды должны быть признаны частью единого «FCB» суперфилум.[2][4]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Палмквист, Д. (1995). «Усвояемость хлопкового волокна и цельных семян масличных культур микроорганизмами рубца». Наука и технология кормов для животных. 56 (3–4): 231–42. Дои:10.1016/0377-8401(95)00830-6.
  2. ^ а б Гупта Р.С. (2008). «Характеристики филогении и сигнатурных последовательностей Fibrobacteres, Chlorobi и Bacteroidetes». Критические обзоры в микробиологии. 30 (2): 123–43. Дои:10.1080/10408410490435133. PMID  15239383.
  3. ^ Гриффитс Э., Гупта Р.С. (сентябрь 2001 г.). «Использование сигнатурных последовательностей в различных белках для определения относительного порядка ветвления бактериальных подразделений: свидетельство того, что Fibrobacter разошлись в одно и то же время с Chlamydia и подразделением Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides». Микробиология. 147 (Пт 9): 2611–22. Дои:10.1099/00221287-147-9-2611. PMID  11535801.
  4. ^ а б Гупта Р.С., Лоренцини Э. (май 2007 г.). «Филогения и молекулярные сигнатуры (консервативные белки и инделки), специфичные для видов Bacteroidetes и Chlorobi». BMC Эволюционная биология. 7: 71. Дои:10.1186/1471-2148-7-71. ЧВК  1887533. PMID  17488508.

внешняя ссылка