Шпилька с капсидом флавивируса cHP - Flavivirus capsid hairpin cHP

шпилька капсида флавивируса cHP
RF00617.jpg
Идентификаторы
СимволcHP
РфамRF00617
Прочие данные
РНК типСнг
Домен (ы)Вирусы
ТАКТАК: 0000233
PDB структурыPDBe

В Шпилька с капсидом флавивируса cHP консервированный РНК заколка для волос структура определены в капсид кодирующая область нескольких флавивирус геномы. Эти положительные нити РНК геномы переведено в виде единого полипептида и впоследствии расщепляется на составляющие белки, первым из которых является белок капсида. Шпилька cHP расположена в области кодирования капсида между двумя AUG стартовые кодоны. Было показано, что цис-элемент cHP запускает прямую трансляцию с субоптимального первого стартового кодона.[1] Способность cHP к прямому инициированию с первого стартового кодона пропорциональна его термодинамической стабильности, зависит от положения и не зависит от последовательности. Было продемонстрировано, что как AUG, так и консервативный cHP необходимы для эффективной репликации вируса в клетках человека и комаров.[1]

Рекомендации

  1. ^ а б Клайд К., Харрис Э (2006). «Вторичная структура РНК в кодирующей области вируса денге типа 2 направляет выбор стартового кодона трансляции и необходима для репликации вируса». J Virol. 80 (5): 2170–2182. Дои:10.1128 / JVI.80.5.2170-2182.2006. ЧВК  1395379. PMID  16474125.

внешняя ссылка