Шпилька с капсидом флавивируса cHP - Flavivirus capsid hairpin cHP
шпилька капсида флавивируса cHP | |
---|---|
Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности cHP | |
Идентификаторы | |
Символ | cHP |
Рфам | RF00617 |
Прочие данные | |
РНК тип | Снг |
Домен (ы) | Вирусы |
ТАК | ТАК: 0000233 |
PDB структуры | PDBe |
В Шпилька с капсидом флавивируса cHP консервированный РНК заколка для волос структура определены в капсид кодирующая область нескольких флавивирус геномы. Эти положительные нити РНК геномы переведено в виде единого полипептида и впоследствии расщепляется на составляющие белки, первым из которых является белок капсида. Шпилька cHP расположена в области кодирования капсида между двумя AUG стартовые кодоны. Было показано, что цис-элемент cHP запускает прямую трансляцию с субоптимального первого стартового кодона.[1] Способность cHP к прямому инициированию с первого стартового кодона пропорциональна его термодинамической стабильности, зависит от положения и не зависит от последовательности. Было продемонстрировано, что как AUG, так и консервативный cHP необходимы для эффективной репликации вируса в клетках человека и комаров.[1]
Рекомендации
- ^ а б Клайд К., Харрис Э (2006). «Вторичная структура РНК в кодирующей области вируса денге типа 2 направляет выбор стартового кодона трансляции и необходима для репликации вируса». J Virol. 80 (5): 2170–2182. Дои:10.1128 / JVI.80.5.2170-2182.2006. ЧВК 1395379. PMID 16474125.
внешняя ссылка
Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |