Флавивирус - Flavivirus

Флавивирус
ТЕМ-микрофотография «вируса желтой лихорадки».
А ТЕМ микрофотография из Вирус желтой лихорадки
Модель капсида
Вирус Зика капсид модель, раскрашенная цепочками, PDB Вход 5ire[2]
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Kitrinoviricota
Учебный класс:Flasuviricetes
Заказ:Амарилловиралес
Семья:Flaviviridae
Род:Флавивирус
Типовой вид
Вирус желтой лихорадки[1]
Разновидность[1]

См. Текст

Флавивирус это род вирусов в семье Flaviviridae. Этот род включает вирус Западного Нила, вирус денге, вирус клещевого энцефалита, вирус желтой лихорадки, Вирус Зика и несколько других вирусы что может вызвать энцефалит,[3] а также специфичные для насекомых флавивирусы (ISF), такие как вирус слияния клеток (CFAV), Вирус Палм-Крик (PCV) и Вирус реки Парраматта (PaRV).[4] В то время как флавивирусы с двумя хозяевами могут инфицировать позвоночных, а также членистоногих, специфические для насекомых флавивирусы ограничиваются их компетентными членистоногими.[5]

Флавивирусы названы от вирус желтой лихорадки, тип вируса для семьи; слово Flavus означает "желтый" в латинский и желтая лихорадка, в свою очередь, названа из-за ее склонности вызывать желтый желтуха в пострадавших.[6]

У флавивирусов есть несколько общих аспектов: общий размер (40–65 нм), симметрия (окутанный, икосаэдр нуклеокапсид ), нуклеиновая кислота (позитивный смысл, одноцепочечный РНК около 10 000–11 000 баз), а появление в электронный микроскоп.

Большинство этих вирусов передаются в первую очередь при укусах инфицированных членистоногие (комар или клещ) и, следовательно, классифицируются как арбовирусы. Заражение человека большинством этих арбовирусов носит случайный характер, поскольку люди не могут реплицировать вирус на достаточно высоких уровнях. титры для повторного заражения членистоногих, необходимых для продолжения жизненного цикла вируса - тогда люди становятся тупиковый хост. Исключением являются желтая лихорадка, денге, и вирусы Зика. Для этих трех вирусов по-прежнему требуются комары-переносчики, но они достаточно хорошо адаптированы для человека, чтобы не обязательно зависеть от животных-хозяев (хотя они по-прежнему имеют важные пути передачи от животных).

Другие пути передачи вирусов арбовирусов включают обращение с тушами инфицированных животных, переливание крови, половые контакты, рождение ребенка и потребление непастеризованных молочных продуктов. Однако передача от нечеловеческих позвоночных к человеку без промежуточных членистоногих-переносчиков чаще всего происходит с низкой вероятностью. Например, ранние тесты на желтую лихорадку показали, что болезнь не заразительный.

Известные неарбовирусы семейства флавивирусов воспроизводятся либо у членистоногих, либо у позвоночных, но не у обоих сразу, причем один нечетный член рода влияет на нематода.[7]

Структура

Геном и полипротеин представителей рода Флавивирус

Вирусы в Flavivirus имеют оболочку с икосаэдрической и сферической геометрией, которая имеет псевдо-симметрию T = 3. Диаметр около 50 нм.[8]

Геном

Геномы представляют собой линейные РНК с положительным смыслом. Они не сегментированы и имеют длину около 10–11 т.п.н.[8]

Жизненный цикл

Жизненный цикл Вирус японского энцефалита (JEV)

Флавивирусы имеют геном положительной РНК и реплицируются в цитоплазма клеток-хозяев. В геном имитирует сотовый мРНК молекула во всех аспектах, за исключением отсутствия полиаденилированного (поли-А) хвост. Эта функция позволяет вирусу использовать клеточный аппарат для синтеза как структурных, так и неструктурных белков во время репликация. Сотовый рибосома имеет решающее значение для репликации флавивируса, так как он транслирует РНК аналогично клеточной мРНК, что приводит к синтезу одного полипротеин. В целом геном кодирует 3 структурных белка (Capsid, prM и Envelope) и 7 неструктурных белков (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, NS5).[9] Геномная РНК модифицируется на 5'-конце геномной РНК с положительной цепью со структурой cap-1 (me7-GpppA-me2).

Клеточные структуры кэпа РНК образуются под действием РНК-трифосфатазы с гуанилилтрансферазой, N7-метилтрансферазой и 2'-O-метилтрансферазой. Вирус кодирует эти действия в своих неструктурных белках. Белок NS3 кодирует РНК трифосфатаза в пределах своего геликазного домена. Он использует сайт гидролиза АТФ геликазой для удаления γ-фосфата с 5'-конца РНК. N-концевой домен неструктурного белка 5 (NS5) имеет как N7-метилтрансфераза и гуанилилтрансфераза активности, необходимые для формирования структур кэпа зрелой РНК. Аффинность связывания РНК снижается при наличии АТФ или же GTP и усилен S-аденозил метионин.[10] Этот белок также кодирует 2'-O-метилтрансферазу.

Репликационный комплекс, образованный на цитоплазматической стороне ER мембрана

Один раз переведено полипротеин расщепляется комбинацией протеаз вируса и хозяина с высвобождением зрелого полипептид товары.[11] Тем не менее, клеточная посттрансляционная модификация зависит от наличия поли-А-хвоста; поэтому этот процесс не зависит от хоста. Вместо этого полипротеин содержит автокаталитический функция, которая автоматически высвобождает первый пептид, вирусспецифический фермент. Затем этот фермент может раскалывать оставшийся полипротеин в отдельные продукты. Одним из продуктов раскола является полимераза, ответственный за синтез молекулы отрицательной РНК. Следовательно, эта молекула действует как матрица для синтеза геномного потомство РНК.

Репликация геномной РНК флавивируса происходит на шероховатой эндоплазматической сети мембраны в мембранных отсеках. Впоследствии собираются новые вирусные частицы. Это происходит во время подающий надежды процесс, который также отвечает за накопление оболочки и клетки лизис.

Киназа 2 рецептора, связанная с G-белком (также известная как ADRBK1), по-видимому, важна для проникновения и репликации для некоторых Flaviviridae.[12]

Естественными хозяевами служат люди, млекопитающие, комары и клещи. Маршруты передачи зооноз и кусаться.[8]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
ФлавивирусЛюди; млекопитающие; комары; клещиЭпителий: кожа; эпителий: почка; эпителий: кишечник; эпителий: семенникиКлатрин-опосредованный эндоцитозСекрецияЦитоплазмаЦитоплазмаЗооноз; укус членистоногого

Элементы вторичной структуры РНК

Геном (+) смысловой РНК Флавивирус содержит 5 'и 3' непереведенные регионы (UTR).

5'UTR

Основная статья: Флавивирус 5 'UTR

5'UTR имеют длину 95–101 нуклеотидов в Вирус денге.[13] В 5'UTR флавивируса есть два консервативных структурных элемента: большая петля ствола (SLA) и петля короткого ствола (SLB). SLA складывается в Y-образную структуру с боковой петлей для ножки и небольшой верхней петлей.[13][14] SLA, вероятно, действует как промотор и необходим для синтеза вирусной РНК.[15][16] SLB участвует во взаимодействиях между 5'UTR и 3'UTR, что приводит к циклизации вирусной РНК, которая необходима для репликации вируса.[17]

3'UTR

Основная статья: Флавивирус 3 'UTR
Прогнозируемая вторичная структура Флавивирус Петля ствола 3'UTR IV

3'UTR обычно имеют длину 0,3–0,5 т.п.н. и содержат ряд высококонсервативных второстепенные конструкции которые сохраняются и ограничиваются флавивирус семья. Большая часть анализа была проведена с использованием вирус Западного Нила (WNV) для изучения функции 3'UTR.

В настоящее время в 3'UTR WNV идентифицировано 8 вторичных структур: SL-I, SL-II, SL-III, SL-IV, DB1, DB2 (в том порядке, в котором они находятся с 3'UTR). и CRE.[18][19] Некоторые из этих вторичных структур были охарактеризованы и важны для облегчения вирусная репликация и защищает 3'UTR от 5 ' эндонуклеаза пищеварение. Устойчивость к нуклеазам защищает нижележащий 3'-UTR фрагмент РНК от деградации и имеет важное значение для индуцированной вирусом цитопатичности и патогенности.

  • SL-II

Было высказано предположение, что SL-II способствует устойчивости к нуклеазам.[19] Это может быть связано с другим петля для шпильки определены в 5'UTR Вирус японского энцефалита (JEV) геном.[20] Шпилька JEV значительно преобладает при инфицировании клетки-хозяина, и было высказано предположение, что структура шпильки может играть роль в регуляции синтеза РНК.

  • SL-IV

Эта вторичная структура расположена в 3'UTR генома Флавивирус перед элементами БД. Функция этой консервативной структуры неизвестна, но считается, что она способствует устойчивости к рибонуклеазам.

  • DB1 / DB2
Прогнозируемая вторичная структура Флавивирус Элемент БД

Эти две консервативные вторичные структуры также известны как элементы псевдоповторения. Первоначально они были идентифицированы в геноме Вирус денге и находятся рядом друг с другом в пределах 3'UTR. По всей видимости, они широко сохраняются в пределах Flaviviradae. Эти элементы DB имеют вторичную структуру, состоящую из трех спиралей, и они играют роль в обеспечении эффективной трансляции. Удаление DB1 имеет небольшое, но значительное сокращение трансляции, но удаление DB2 малоэффективно. Удаление как DB1, так и DB2 уменьшено перевод эффективность вирусного генома до 25%.[18]

  • CRE

CRE является цис-действующим элементом репликации, также известным как элементы 3'SL РНК, и считается важным для репликации вируса, способствуя образованию «комплекса репликации».[21] Хотя были представлены доказательства существования псевдоузел структура этой РНК, по-видимому, не является хорошо консервативной для флавивирусов.[22] Было показано, что делеции 3 'UTR флавивирусов являются летальными для инфекционных клонов.

Консервированная шпилька cHP

А консервированная шпилька (cHP) структура была позже обнаружена в нескольких Флавивирус геномы и считается прямым переводом белков капсида. Он расположен ниже по течению от AUG. стартовый кодон.[23]

Роль вторичных структур РНК в продукции sfRNA

Субгеномная РНК флавивируса (sfRNA) является продолжением 3 'UTR и, как было показано, играет роль в репликации флавивирусов и патогенезе.[24] sfRNA продуцируется неполной деградацией геномной вирусной РНК клетками-хозяевами 5'-3 'экзорибонуклеаза 1 (XRN1).[25] По мере того как XRN1 разрушает вирусную РНК, он останавливается на стержневых петлях, образованных вторичной структурой 5 'и 3' UTR.[26] Эта пауза приводит к появлению непереваренного фрагмента геномной РНК, известного как sfRNA. sfRNA влияет на жизненный цикл флавивируса в зависимости от концентрации. Накопление sfRNA вызывает (1) антагонизацию врожденного иммунного ответа клетки, что снижает защиту хозяина от вируса.[27] (2) ингибирование активности XRN1 и Dicer для модификации путей РНКи, которые разрушают вирусную РНК.[28] (3) модификация комплекса репликации вируса для увеличения репродукции вируса.[29] В целом, sfRNA участвует во множестве путей, которые ставят под угрозу защиту хозяина и способствуют заражению флавивирусами.

Эволюция

Флавивирусы можно разделить на 2 группы: одна с вирусами, переносимыми переносчиками, а другая - с неизвестным вектором.[30] Кладу переносчиков, в свою очередь, можно подразделить на кладу, переносимую комарами, и кладу, переносимую клещами. Эти группы можно снова разделить.[31]

Группу комаров можно разделить на две ветви: одна ветвь содержит нейротропные вирусы, часто связанные с энцефалитом у людей или домашнего скота. Эта ветвь имеет тенденцию распространяться Culex видов и иметь птичьи водоемы. Вторая ветвь - это ненейротропные вирусы, которые связаны с геморрагической болезнью человека. В них обычно Aedes виды как переносчики и приматы-хозяева.

Клещевые вирусы также образуют две отдельные группы: одна связана с морские птицы а другой - вирусы комплекса клещевого энцефалита - связаны в первую очередь с грызуны.

Вирусы, у которых отсутствует известный вектор, можно разделить на три группы: одна тесно связана с вирусами, переносимыми комарами, которые связаны с летучие мыши; второй, генетически более далекий, также связан с летучими мышами; и третья группа связана с грызунами.

Кажется вероятным, что передача клещей могла происходить от группы комаров.[32]

У морского паука обнаружен частичный геном флавивируса Endeis spinosa.[33] Последовательности родственны последовательностям флавивирусов, специфичных для насекомых. В настоящее время неясно, как эта последовательность вписывается в эволюцию этой группы вирусов.

Для некоторых из этих вирусов были сделаны оценки времени расхождения.[34] Происхождение этих вирусов, по-видимому, произошло не менее 9400–14000 лет назад. Штаммы денге Старого и Нового Света разошлись между 150 и 450 лет назад. Штаммы европейского и дальневосточного клещевого энцефалита разошлись примерно 1087 (1610–649) лет назад. Вирусы европейского клещевого энцефалита и вируса лупинга разошлись около 572 (844–328) лет назад. Эта последняя оценка согласуется с историческими записями. Вирус Кунджин отделился от вируса Западного Нила примерно 277 (475–137) лет назад. Это время соответствует заселению Австралии из Европы. Группа японского энцефалита, по-видимому, возникла в Африке 2000–3000 лет назад, а затем сначала распространилась в Юго-Восточную Азию, а затем мигрировала в остальную Азию.

Филогенетический Исследования вируса Западного Нила показали, что он появился как отдельный вирус около 1000 лет назад.[35] Этот первоначальный вирус развился в две отдельные линии, линия 1 и ее многочисленные профили, и является источником передачи эпидемии в Африке и во всем мире. Lineage 2 считалась Африкой зооноз. Однако в 2008 году линия 2, ранее наблюдаемая только у лошадей в Африке к югу от Сахары и на Мадагаскаре, начала появляться у лошадей в Европе, где первая известная вспышка заболевания затронула 18 животных в Венгрии в 2008 году.[36] Вирус Lineage 1 West Nile был обнаружен в Южной Африке в 2010 г. кобыла и ее прерывание плод; ранее только вирус линии 2 Западного Нила был обнаружен у лошадей и людей в Южной Африке.[37] Случай со смертельным исходом в 2007 г. косатка в Техас расширил известные диапазон хостов вируса Западного Нила включить китообразные.[38]

Вирус омской геморрагической лихорадки, по-видимому, эволюционировал в течение последних 1000 лет.[39] Вирусные геномы можно разделить на 2 клады - A и B. Клада A имеет пять генотипов, а клад B - один. Эти клады отделились около 700 лет назад. По всей видимости, это разделение произошло в Курганской области. Впоследствии клад А был разделен на кладу C, D и E 230 лет назад. Клады C и E, по-видимому, происходят из Новосибирской и Омской областей соответственно. Ондатра Ondatra zibethicus который очень чувствителен к этому вирусу, был занесен в этот район в 1930-х годах.

Таксономия

Разновидность

В роду Флавивирус существует 53 определенных вида:[40]

Сортировка по вектору

Список видов и штаммов флавивирусов по векторам


Виды и сорта, отсортированные по векторам:

Клещевые вирусы

Млекопитающее группа клещевых вирусов

Морская птица группа клещевых вирусов

Вирусы, переносимые комарами

Вирусы, переносчики которых неизвестны

Вирусы беспозвоночных

Вирусы, известные только после секвенирования

Другие флавивирусы

Вакцина

Очень успешный вакцина против желтой лихорадки 17D, введенный в 1937 году, привел к резкому снижению эпидемической активности.

Эффективный инактивированный японский энцефалит и Клещевой энцефалит вакцины были внедрены в середине 20 века. Неприемлемые побочные эффекты вызвали изменения от инактивированного мозга мыши Вакцина против японского энцефалита к более безопасным и эффективным вакцинам второго поколения против японского энцефалита. Они могут найти широкое применение для эффективной профилактики этого тяжелого заболевания среди огромного населения Азии - Севера, Юга и Юго-Востока.

Вирусы денге ежегодно вызывают многие миллионы инфекций из-за того, что они передаются успешным глобальным переносчиком комаров. Поскольку борьба с комарами не удалась, несколько вакцины против денге находятся на разных стадиях развития. CYD-TDV, продаваемый под торговым названием Dengvaxia, представляет собой четырехвалентную химерную вакцину, которая сплайсирует структурные гены четырех вирусов денге на основу желтой лихорадки 17D.[43][44] Dengvaxia одобрена в пяти странах.[45]

Рекомендации

  1. ^ а б «Таксономия вирусов: выпуск 2018b». Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2019 г.. Получено 16 марта 2019.}}
  2. ^ Сирохи Д., Чен З., Сан Л., Клозе Т., Пирсон Т.К., Россманн М.Г., Кун Р.Дж. (апрель 2016 г.). «КриоЭМ структура вируса Зика с разрешением 3,8 Å». Наука. 352 (6284): 467–470. Bibcode:2016Научный ... 352..467S. Дои:10.1126 / science.aaf5316. ЧВК  4845755. PMID  27033547.
  3. ^ Ши, Пи-Й (редактор) (2012). Молекулярная вирусология и борьба с флавивирусами. Caister Academic Press. ISBN  978-1-904455-92-9.CS1 maint: дополнительный текст: список авторов (связь)
  4. ^ Маклин, Брианна Дж .; Хобсон-Петерс, Джоди; Уэбб, Кэмерон Э .; Уоттерсон, Дэниел; Prow, Натали А .; Нгуен, Хонг Дуйен; Холл-Менделин, Соня; Уоррилоу, Дэвид; Johansen, Cheryl A .; Янсен, Кэсси С.; ван ден Херк, Эндрю Ф .; Биби, Найджел В .; Шнеттлер, Эстер; Барнард, Росс Т .; Холл, Рой А. (2015). «Новый флавивирус, специфичный для насекомых, реплицируется только в клетках, полученных из Aedes, и сохраняется с высокой распространенностью в популяциях диких Aedes vigilax в Сиднее, Австралия». Вирусология. 486: 272–283. Дои:10.1016 / j.virol.2015.07.021. PMID  26519596.
  5. ^ Эльрефей, Ахмед МЭ; Абдельнаби, Рана; Росалес Росас, Ана Люсия; Ван, Ланьцзяо; Басу, Санджай; Деланг, Лин (сентябрь 2020 г.). «Понимание механизмов, лежащих в основе ограничения вирусов, специфичных для насекомых». Вирусы. 12 (9): 964. Дои:10.3390 / v12090964.
  6. ^ Самое раннее упоминание о «желтой лихорадке» встречается в рукописи 1744 г. Доктор Джон Митчелл Вирджинии; копии рукописи были отправлены г. Cadwallader Colden, врач из Нью-Йорка, и доктору Бенджамин Раш Филадельфии; в конце концов рукопись была переиздана в 1814 году.
    (Доктор Джон Митчелл) (написано: 1744; перепечатано: 1814) «Отчет о желтой лихорадке, которая преобладала в Вирджинии в 1737, 1741 и 1742 годах, в письме покойному Кадвалладеру Колдену, эсквайру из Нью-Йорка, от покойного Джона Митчелла, доктора медицинских наук штата Вирджиния», Американский медицинский и философский регистр, 4 : 181-215. Термин «желтая лихорадка» появляется на стр. 186. На стр. 188, Митчелл упоминает «… чумка была тем, что в Америке принято называть желтой лихорадкой». Однако на страницах 191–192 он заявляет: «… Я рассмотрю причину желтизны, которая настолько заметна в этой чуме, что дала ей название Желтая лихорадка».
    Доктор Митчелл неправильно диагностировал болезнь, которую он наблюдал и лечил, и, вероятно, это была болезнь Вейля или гепатит. См .: Саул Джарчо (1957) «Джон Митчелл, Бенджамин Раш и Желтая лихорадка». Вестник истории медицины, 31 (2) : 132–6.
  7. ^ а б Бекал С., Домье Л.Л., Гонфа Б., МакКоппин Н.К., Ламберт К.Н., Бхалерао К. (2014). «Новый флавивирус в нематоде соевых бобов». Журнал общей вирусологии. 95 (Pt 6): 1272–1280. Дои:10.1099 / vir.0.060889-0. PMID  24643877.
  8. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  9. ^ Рис, C .; Lenches, E .; Eddy, S .; Shin, S .; Листы, р .; Штраус, Дж. (23 августа 1985 г.). «Нуклеотидная последовательность вируса желтой лихорадки: значение для экспрессии и эволюции гена флавивируса». Наука. 229 (4715): 726–33. Bibcode:1985Научный ... 229..726R. Дои:10.1126 / science.4023707. PMID  4023707. Получено 14 ноября 2016.
  10. ^ Хендерсон Б.Р., Саиди Б.Дж., Кампаньола Дж., Гейсс Б.Дж. (2011). Jeang K (ред.). «Анализ связывания РНК с помощью фермента, улавливающего РНК NS5 вируса Денге». PLOS ONE. 6 (10): e25795. Bibcode:2011PLoSO ... 625795H. Дои:10.1371 / journal.pone.0025795. ЧВК  3192115. PMID  22022449.
  11. ^ Sun, G .; Larsen, C .; Baumgarth, N .; Klem, E; Р. Шойерманн (26 января 2017 г.). «Комплексная аннотация зрелых пептидов и генотипов вируса Зика». PLOS ONE. 12 (1): e0170462. Bibcode:2017PLoSO..1270462S. Дои:10.1371 / journal.pone.0170462. ЧВК  5268401. PMID  28125631.
  12. ^ Ле Соммер С., Барроуз Нью-Джерси, Брэдрик С.С., Пирсон Дж. Л., Гарсия-Бланко Массачусетс (2012). Майкл С.Ф. (ред.). «G-белок-связанная рецепторная киназа 2 способствует проникновению и репликации флавивирусов». PLOS Negl Trop Dis. 6 (9): e1820. Дои:10.1371 / journal.pntd.0001820. ЧВК  3441407. PMID  23029581.
  13. ^ а б Гебхард Л.Г., Филоматори К.В., Гамарник А.В. (2011). «Функциональные элементы РНК в геноме вируса денге». Вирусы. 3 (9): 1739–56. Дои:10.3390 / v3091739. ЧВК  3187688. PMID  21994804.
  14. ^ Бринтон MA, Dispoto JH (1988). «Анализ последовательности и вторичной структуры 5'-концевой области РНК генома флавивируса». Вирусология. 162 (2): 290–9. Дои:10.1016/0042-6822(88)90468-0. PMID  2829420.
  15. ^ Filomatori CV, Лодейро М.Ф., Альварес Д.Е., Самса М.М., Пьетрасанта Л., Гамарник А.В. (2006). «5'-элемент РНК способствует синтезу РНК вируса денге в кольцевом геноме». Genes Dev. 20 (16): 2238–49. Дои:10.1101 / gad.1444206. ЧВК  1553207. PMID  16882970.
  16. ^ Ю. Л., Номагучи М., Падманабхан Р., Маркофф Л. (2008). «Особые требования к элементам 5'- и 3'-концевых областей в синтезе РНК флавивируса и репликации вируса». Вирусология. 374 (1): 170–85. Дои:10.1016 / j.virol.2007.12.035. ЧВК  3368002. PMID  18234265.
  17. ^ Альварес Д.Е., Лодейро М.Ф., Лудуэнья С.Дж., Пьетрасанта Л.И., Гамарник А.В. (2005). «Дальнодействующие РНК-РНК-взаимодействия делают циркулярный геном вируса денге». J Virol. 79 (11): 6631–43. Дои:10.1128 / JVI.79.11.6631-6643.2005. ЧВК  1112138. PMID  15890901.
  18. ^ а б Чиу В.В., Кинни Р.М., Дреер Т.В. (июль 2005 г.). «Контроль трансляции 5'- и 3'-концевыми областями генома вируса денге». Дж. Вирол. 79 (13): 8303–15. Дои:10.1128 / JVI.79.13.8303-8315.2005. ЧВК  1143759. PMID  15956576.
  19. ^ а б Пийлман Г.П., Функ А., Кондратьева Н. и др. (Декабрь 2008 г.). «Для патогенности требуется высокоструктурированная, устойчивая к нуклеазам, некодирующая РНК, продуцируемая флавивирусами». Клеточный микроб-хозяин. 4 (6): 579–91. Дои:10.1016 / j.chom.2008.10.007. PMID  19064258.
  20. ^ Линь К.С., Чанг Х.Л., Чанг Р.Й. (май 2004 г.). «Накопление 3'-концевого фрагмента генома в клетках млекопитающих и комаров, инфицированных вирусом японского энцефалита». Дж. Вирол. 78 (10): 5133–8. Дои:10.1128 / JVI.78.10.5133-5138.2004. ЧВК  400339. PMID  15113895.
  21. ^ Цзэн Л., Фалгоут Б., Марков Л. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация специфических нуклеотидных последовательностей в консервативном 3'-SL в геноме вируса денге 2 типа, необходимом для репликации». Дж. Вирол. 72 (9): 7510–22. Дои:10.1128 / JVI.72.9.7510-7522.1998. ЧВК  109990. PMID  9696848.
  22. ^ Ши П. Я., Бринтон М. А., Телятина Дж. М., Чжун Ю. Ю., Уилсон В. Д. (апрель 1996 г.). «Доказательства существования структуры псевдоузла на 3'-конце геномной РНК флавивируса». Биохимия. 35 (13): 4222–30. Дои:10.1021 / bi952398v. PMID  8672458.
  23. ^ Клайд К., Харрис Э (2006). «Вторичная структура РНК в кодирующей области вируса денге типа 2 направляет выбор стартового кодона трансляции и необходима для репликации вируса». J Virol. 80 (5): 2170–2182. Дои:10.1128 / JVI.80.5.2170-2182.2006. ЧВК  1395379. PMID  16474125.
  24. ^ Биде, Кателл; Гарсиа-Бланко, Мариано А. (1 сентября 2014 г.). «Флавивирусные РНК: оружие и цели в войне между вирусом и хозяином». Биохимический журнал. 462 (2): 215–230. Дои:10.1042 / BJ20140456. ISSN  0264-6021. PMID  25102029.
  25. ^ Чапман, Эрих G .; Константино, Дэвид А .; Rabe, Jennifer L .; Луна, Стефани Л .; Вилуш, Джеффри; Nix, Jay C .; Кифт, Джеффри С. (18 апреля 2014 г.). «Структурные основы продукции патогенных субгеномных флавивирусных РНК (sfRNA)». Наука. 344 (6181): 307–310. Bibcode:2014Наука ... 344..307C. Дои:10.1126 / science.1250897. ISSN  0036-8075. ЧВК  4163914. PMID  24744377.
  26. ^ Функ, Аннеке; Чыонг, Кэтрин; Нагасаки, Томоко; Торрес, Шесси; Флоден, Надя; Мелиан, Эсекьель Балмори; Эдмондс, Джуди; Дун, Хунпин; Ши, Пей-Юн (1 ноября 2010 г.). «Структуры РНК, необходимые для производства РНК субгеномных флавивирусов». Журнал вирусологии. 84 (21): 11407–11417. Дои:10.1128 / JVI.01159-10. ISSN  0022-538X. ЧВК  2953152. PMID  20719943.
  27. ^ Чанг, Руэй-И; Сюй, Та-Вэнь; Чен, Йен-Линь; Лю, Шу-Фань; Цай, Йи-Джер; Линь Юнь-Тонг; Чен И-Шиуань; Фань И-Синь (27 сентября 2013 г.). «Некодирующая РНК вируса японского энцефалита подавляет активацию интерферона, блокируя ядерную транслокацию фактора 3, регулирующего интерферон». Ветеринарная микробиология. 166 (1–2): 11–21. Дои:10.1016 / j.vetmic.2013.04.026. PMID  23755934.
  28. ^ Луна, Стефани Л .; Андерсон, Джон Р .; Кумагаи, Ютаро; Wilusz, Кэрол Дж .; Акира, Шизуо; Хромых, Александр А .; Вилуш, Джеффри (1 ноября 2012 г.). «Некодирующая РНК, продуцируемая флавивирусами, переносимыми членистоногими, ингибирует клеточную экзорибонуклеазу XRN1 и изменяет стабильность мРНК хозяина». РНК. 18 (11): 2029–2040. Дои:10.1261 / rna.034330.112. ISSN  1355-8382. ЧВК  3479393. PMID  23006624.
  29. ^ Clarke, B.D .; Роби, Дж. А .; Слончак, А .; Хромых, А.А. (3 августа 2015 г.). «Функциональные некодирующие РНК, полученные из нетранслируемой 3'-области флавивируса». Вирусные исследования. Специальный выпуск: Функции концов геномов вирусов с положительной цепью РНК. 206: 53–61. Дои:10.1016 / j.virusres.2015.01.026. PMID  25660582.
  30. ^ Куно Г., Чанг Г.Дж., Цучия К.Р., Карабацос Н., Кропп CB (1998). «Филогения рода Flavivirus». J Virol. 72 (1): 73–83. Дои:10.1128 / JVI.72.1.73-83.1998. ЧВК  109351. PMID  9420202.
  31. ^ Гонт М.В., Салл А.А., де Ламбаллери Х, Фальконар А.К., Дживанян Т.И., Гулд Э.А. (2001). «Филогенетические отношения флавивирусов коррелируют с их эпидемиологией, ассоциацией болезней и биогеографией». Дж. Ген Вирол. 82 (8): 1867–1876. Дои:10.1099/0022-1317-82-8-1867. PMID  11457992.
  32. ^ Кук С., Холмс ЕС (2006). «Мультигенный анализ филогенетических отношений между флавивирусами (семейство: Flaviviridae) и эволюция передачи переносчиков». Arch Virol. 151 (2): 309–325. Дои:10.1007 / s00705-005-0626-6. PMID  16172840.
  33. ^ Конвей MJ (2015). «Идентификация последовательности флавивируса у морского членистоногого». PLOS ONE. 10 (12): e0146037. Bibcode:2015PLoSO..1046037C. Дои:10.1371 / journal.pone.0146037. ЧВК  4699914. PMID  26717191.
  34. ^ Муро, Грегори; Повар, Шелли; Лемей, Филипп; Нугайред, Антуан; Форрестер, Наоми Л .; Хаснатинов, Максим; Charrel, Remi N .; Ферт, Эндрю Э .; Гулд, Эрнест А .; Де Ламбаллери, Ксавье (2015). «Новые взгляды на эволюцию, таксономию и биогеографическую историю флавивирусов, расширенные анализом канонических и альтернативных последовательностей кодирования». PLOS ONE. 10 (2): e0117849. Bibcode:2015PLoSO..1017849M. Дои:10.1371 / journal.pone.0117849. ЧВК  4342338. PMID  25719412.
  35. ^ Галли М., Бернини Ф., Цехендер Г. (июль 2004 г.). "Александр Македонский и вирусный энцефалит Западного Нила". Возникающий зараз. Дис. 10 (7): 1330–2, ответ автора 1332–3. Дои:10.3201 / eid1007.040396. PMID  15338540.
  36. ^ Уэст, Кристи (8 февраля 2010 г.). «Развивается другая генетическая линия вируса Западного Нила?». Лошадь. Получено 10 февраля 2010. Из заявлений Орсоли Кутаси, DVM, Университета Сент-Иштван, Венгрия, на съезде Американской ассоциации коневодов, 5–9 декабря 2009 г.
  37. ^ Вентер М., Человек С., ван Никерк С., Уильямс Дж., Ван Иден С., Фриман Ф. (август 2011 г.). «Смертельное неврологическое заболевание и аборт у кобыл, инфицированных вирусом Западного Нила линии 1, Южная Африка». Возникающий зараз. Дис. 17 (8): 1534–6. Дои:10.3201 / eid1708.101794. ЧВК  3381566. PMID  21801644.
  38. ^ Сент-Леже Дж., Ву Дж., Андерсон М., Далтон Л., Нильсон Э, Ван Д. (2011). «Инфекция вируса Западного Нила у косаток, Техас, США, 2007». Возникающий зараз. Дис. 17 (8): 1531–3. Дои:10.3201 / eid1708.101979. ЧВК  3381582. PMID  21801643.
  39. ^ Каран, Людмила С .; Чиккоцци, Массимо; Якименко, Валерий В .; Прести, Алессандра Ло; Селла, Элеонора; Зехендер, Джангульельмо; Резца, Джованни; Платонов, Александр Евгеньевич (2014). «Выведенная история эволюции вируса Омской геморрагической лихорадки». Журнал медицинской вирусологии. 86 (7): 1181–1187. Дои:10.1002 / jmv.23856. PMID  24259273.
  40. ^ «Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)». talk.ictvonline.org. Получено 16 ноября 2020.
  41. ^ ван ден Херк, Эндрю Ф .; Суен, Вилли В .; Холл, Рой А.; О'Брайен, Кейтлин А .; Билефельдт-Оманн, Хелле; Хобсон-Петерс, Джоди; Кольман, Агата М. Г. (2016). «Недавно обнаруженный флавивирус из группы вирусов желтой лихорадки демонстрирует ограниченную репликацию у позвоночных». Журнал общей вирусологии. 97 (5): 1087–1093. Дои:10.1099 / jgv.0.000430. PMID  26878841. S2CID  43127614.
  42. ^ а б c d е Парри, Рис; Асгари, Сасан (15 июля 2019 г.). «Открытие новых флавивирусов ракообразных и головоногих моллюсков: понимание эволюции и циркуляции флавивирусов между морскими беспозвоночными и позвоночными-хозяевами». Журнал вирусологии. 93 (14). Дои:10.1128 / JVI.00432-19. ЧВК  6600200. PMID  31068424.
  43. ^ Thisyakorn, U. (2014). «Последние разработки и будущие направления в вакцинах против денге». Терапевтические достижения в области вакцин. 2 (1): 3–9. Дои:10.1177/2051013613507862. ЧВК  3991153. PMID  24757522.
  44. ^ Яух, Лорен Э. (2014). Разработка вакцины против вируса денге. Достижения в вирусных исследованиях. 88. С. 315–372. Дои:10.1016 / B978-0-12-800098-4.00007-6. ISBN  9780128000984. PMID  24373316.
  45. ^ «Вопросы и ответы ВОЗ по вакцинам против денге». WHO.int. Получено 1 октября 2016.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка