Вирус Йокосе - Yokose virus

Вирус Йокосе
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Kitrinoviricota
Учебный класс:Flasuviricetes
Заказ:Амарилловиралес
Семья:Flaviviridae
Род:Флавивирус
Разновидность:
Вирус Йокосе
Синонимы.[1]

Yokase вирус

Вирус Йокосе (YOKV) принадлежит к роду Флавивирус семьи Flaviviridae.[2] Flaviviridae часто встречаются в членистоногие, такие как комары и клещи, а также могут инфицировать людей. Род Flavivirus включает более 50 известных вирусов, в том числе Желтая лихорадка, Вирус Западного Нила, Вирус Зика, и Японский энцефалит. Вирус йокосе - новый член семейства флавивирусов, который был идентифицирован только у нескольких видов летучих мышей. Летучие мыши были связаны с несколькими новыми зоонозный болезни, такие как Эбола и ОРВИ.[3]

Классификация вирусов

Фотография горы Ау, расположенной на острове Кюсю в Японии, где впервые был выделен вирус Йокосе.

Вирус Yokose относится к роду Флавивирус семьи Flaviviridae. Он был обнаружен в 1971 году в Йокосука на острове Кюсю, Япония. Штамм Oita-36 был выделен от видов летучих мышей. Miniopterus fuliginosus.[4] Молекулярно-генетический анализ показал, что вирус Yokose - новый представитель рода Flavivirus.[4] Флавивирусы обычно делятся на три группы: переносимые комарами, переносимые клещами и не переносимые переносчиками. Вирус йокоза классифицируется как NKV или неизвестный вектор. Это означает, что у него нет известного переносчика членистоногих. Однако есть некоторые свидетельства того, что он может заражать членистоногих, а именно через комаров. Было обнаружено, что вирус йокозе генетически близок к Вирус желтой лихорадки с аминокислотными последовательностями, близкими к Вирус летучих мышей Энтеббе.[4]

Вирусная структура и геном

Вирус Йокосе - это положительный смысл одноцепочечной РНК вируса. Он окутан и имеет икосоэдрическая симметрия с число триангуляции (T) из 3.[5] Его диаметр составляет примерно 50 нм. Геном не сегментирован и содержит 10 857 нуклеотидов.[4] Существует одна открытая рамка считывания (ORF) полипротеина из 3425 аминокислот, который кодирует три структурных белка и восемь неструктурных белков.[4] Структурные белки включают капсид (C), премембрану / мембрану (prM) и оболочку (E). Неструктурные белки включают NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, 2K, NS4B и NS5. Белок 2K не обнаружен во многих других флавивирусах. NS3 функционирует как протеаза и геликаза. NS5 функционирует как РНК-зависимая РНК-полимераза. NS1 важен в процессе репликации вируса. NS2A взаимодействует с NS3 и NS5, помогает в сборке вирусов и рекрутирует геном вирусной РНК в мембраносвязанный репликационный комплекс. Вторичные структуры, образованные 5 'и 3' нетранслирующей областью (NTR), влияют на транскрипцию и трансляцию. Вирус йокозы имеет мотив CS1 в 3 'NTR, который сохраняется у переносимых комарами флавивирусов, что позволяет предположить его способность инфицировать членистоногих.[4]

Цикл репликации

Вход в камеру

Белок вирусной оболочки (Е) прикрепляется к рецепторам клетки-хозяина и попадает в клетку через эндоцитоз. Затем белок оболочки претерпевает конформационные изменения в пределах эндосома при воздействии кислой природы эндосомы.[5] Белок оболочки и эндосомная мембрана сливаются, и вирус выделяется в цитоплазму.

Репликация и транскрипция

Вирусная РНК транслируется в полипротеины а затем расщепляется вирусными и клеточными протеазы в структурные (C, prM и E) и неструктурные белки (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, 2K, NS4B и NS5).[6] Репликация происходит на поверхности эндоплазматический ретикулум внутри мембранных сосудов. Комплементарная отрицательная смысловая цепь РНК образуется с помощью РНК-зависимой РНК-полимеразы (неструктурный белок NS5) для создания двухцепочечной РНК.[6] ДцРНК транскрибируется с образованием вирусного мРНК.

Сборка и выпуск

Вирус собирается внутри эндоплазматический ретикулум. А нуклеокапсид образуется и поглощает вирусные гликопротеины. Однако очень мало известно о процессе сборки флавивирусов. Имеются данные, свидетельствующие о том, что некоторые неструктурные белки, такие как NS2A, вносят вклад в сборку.[6] Собранное видение затем зарождается в аппарат Гольджи где белок prM расщепляется, что приводит к созреванию.[5] Затем вирус выходит из клетки через экзоцитоз и отключен, чтобы заразить другие клетки-хозяева.

Летучая мышь из района, где у летучих мышей были обнаружены антитела к вирусу Йокосе.

Хост и местоположение

Многое неизвестно о патогенность и вирулентность вируса Йокосе, в том числе у летучих мышей. Было обнаружено, что штамм XYBX1332, выделенный в Китае, вызывает цитопатические эффекты в клетках млекопитающих.[7] При исследовании летучих мышей, инфицированных вирусом Yokose, они не обнаружили никаких клинических признаков заболевания.[8]

В настоящее время идентифицированы только виды летучих мышей, являющиеся носителями штаммов вируса Yokose. Штамм Oita-36 был выделен от видов летучих мышей. Miniopterus fuliginosus и в настоящее время является основным штаммом вируса Yokose. Он был идентифицирован на Остров Кюсю у берегов Японии. Вирус Йокосе географически не ограничен Японскими островами, но также был изолирован во внутреннем Китае. Штамм XYBX1332 был выделен из видов летучих мышей. Myotis daubentonii в провинции Юньнань, Китай.[7] Однако этот штамм имеет геномные отличия по сравнению с исходным штаммом Oita-36, и необходимо провести дальнейшие исследования, чтобы сделать вывод, является ли это новым видом флавивируса. Антитела к вирусу Йокоза были обнаружены у летучих мышей, Rousettus leschenaultii, а также на Филиппинах и в Майласии.[8] Это показывает, что вирус Йокосе географически не ограничен японскими островами, но также может существовать во внутренних районах Азии.

До сих пор не было зарегистрировано случаев заражения вирусом Йокосе у людей или других животных. Исследователи обнаружили, что йокосе можно манипулировать для заражения клеток человека и реагировать на антитела других флавивирусов, присутствующих в клетках. Было обнаружено, что Вакцинация против желтой лихорадки был эффективен в нейтрализации вируса Йокоза в клетках человека.[4]

Патогенность и вирулентность

Многое неизвестно о патогенности и вирулентности вируса Йокосе. Было обнаружено, что штамм XYBX1332, выделенный в Китае, вызывает цитопатические эффекты в клетках млекопитающих.[7] При исследовании летучих мышей, инфицированных вирусом Yokose, они не обнаружили никаких клинических признаков заболевания.[8] Однако исследование, проведенное на летучей мыши альвеолярный эпителиальные клетки и клетки почек обнаружили, что заражение вирусом Йокоза вскоре после этого привело к репликации вируса и гибели клеток.[3]

Рекомендации

  1. ^ 1ICTV 7th Report van Regenmortel, MHV, Fauquet, CM, Bishop, DHL, Carstens, EB, Estes, MK, Lemon, SM, Maniloff, J., Mayo, MA, McGeoch, DJ, Pringle, CR и Wickner, RB (2000 г. ). Таксономия вирусов. Седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Academic Press, Сан-Диего, 1162 с. https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/ICTV%207th%20Report.pdf В архиве 2018-06-12 в Wayback Machine
  2. ^ «Вирус Йокосе». www.genome.jp. В архиве из оригинала на 13.12.2019. Получено 2019-12-13.
  3. ^ а б Омацу, Цутому; Ватанабэ, Шумпей; Акаши, Хироми; Ёсикава, Ясухиро (01.09.2007). «Биологические признаки летучих мышей по отношению к естественному резервуару появляющихся вирусов». Сравнительная иммунология, микробиология и инфекционные болезни. Специальный выпуск: Последние достижения в исследованиях возникающих инфекционных заболеваний в Азии и Океании. 30 (5): 357–374. Дои:10.1016 / j.cimid.2007.05.006. ISSN  0147-9571. ЧВК  7112585. PMID  17706776.
  4. ^ а б c d е ж грамм Тадзима, Сигэру; Такасаки, Томохико; Мацуно, Шигео; Накаяма, Микио; Куране, Ичиро (2005-02-05). «Генетическая характеристика вируса Йокосе, флавивируса, выделенного из летучих мышей в Японии». Вирусология. 332 (1): 38–44. Дои:10.1016 / j.virol.2004.06.052. ISSN  0042-6822. PMID  15661139.
  5. ^ а б c "Flavivirus ~ Страница ViralZone". viralzone.expasy.org. В архиве из оригинала на 2019-05-03. Получено 2019-12-13.
  6. ^ а б c Апте-Сенгупта, Свапна; Сирохи, Девика; Кун, Ричард Дж. (2014). «Сочетание репликации и сборки во флавивирусах». Текущее мнение в вирусологии. 0: 134–142. Дои:10.1016 / j.coviro.2014.09.020. ISSN  1879-6257. ЧВК  4268268. PMID  25462445.
  7. ^ а б c Фэн, Юнь; Рен, Сяоцзе; Сюй, Цзыцянь; Фу, Шихонг; Ли, Сяолун; Чжан, Хайлинь; Ян, Вэйхонг; Чжан, Южен; Лян, Годун (2019-01-11). «Генетическое разнообразие вируса Yokose, XYBX1332, выделенного от летучих мышей (Myotis daubentonii) в Китае». Журнал вирусологии. 16 (1): 8. Дои:10.1186 / s12985-018-1107-3. ISSN  1743-422X. ЧВК  6330390. PMID  30634973.
  8. ^ а б c Ватанабэ, Шумпей; Омацу, Цутому; Миранда, Мэри Э. Г .; Masangkay, Joseph S .; Уэда, Наоя; Эндо, Майко; Като, Кентаро; Тохья, Юкинобу; Йошикава, Ясухиро; Акаси, Хироми (2010). «Эпизоотология и экспериментальное заражение вирусом йокоза у летучих мышей».. Сравнительная иммунология, микробиология и инфекционные болезни. 33 (1): 25–36. Дои:10.1016 / j.cimid.2008.07.008. ISSN  1878-1667. ЧВК  7112705. PMID  18789527.