GTF3C5 - GTF3C5

GTF3C5
Идентификаторы
ПсевдонимыGTF3C5, TFIIIC63, TFIIICepsilon, TFiiiC2-63, субъединица 5 общего фактора транскрипции IIIC
Внешние идентификаторыOMIM: 604890 MGI: 1917489 ГомолоГен: 40806 Генные карты: GTF3C5
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение GTF3C5
Геномное расположение GTF3C5
Группа9q34.13Начинать133,030,675 бп[1]
Конец133,058,503 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE GTF3C5 217876 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001122823
NM_001286709
NM_012087

NM_001290484
NM_148928

RefSeq (белок)

NP_001116295
NP_001273638
NP_036219

NP_001277413
NP_683730

Расположение (UCSC)Chr 9: 133.03 - 133.06 МбChr 2: 28,57 - 28,58 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Общий фактор транскрипции 3С полипептид 5 это белок что у людей кодируется GTF3C5 ген.[5][6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции GTF3C5. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Gtf3c5tm2a (КОМП) Wtsi[11][12] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[13][14][15]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[9][16] Было проведено 24 испытания на мутант мышей и двух значительных отклонений не наблюдалось.[9] Нет гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши; у этих животных не наблюдалось никаких дополнительных значительных отклонений от нормы.[9]

Взаимодействия

GTF3C5 был показан взаимодействовать с GTF3C2[5] и GTF3C4.[17]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000148308 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026816 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Се Й.Дж., Ван З., Ковельман Р., Рёдер Р.Г. (июль 1999 г.). «Клонирование и характеристика двух эволюционно консервативных субъединиц (TFIIIC102 и TFIIIC63) человеческого TFIIIC и их участие в функциональных взаимодействиях с TFIIIB и РНК-полимеразой III». Мол. Клетка. Биол. 19 (7): 4944–52. Дои:10.1128 / mcb.19.7.4944. ЧВК  84305. PMID  10373544.
  6. ^ «Ген Entrez: общий фактор транскрипции GTF3C5 IIIC, полипептид 5, 63 кДа».
  7. ^ "Сальмонелла данные о заражении Gtf3c5 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ "Citrobacter данные о заражении Gtf3c5 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ а б c d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  10. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  11. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  12. ^ "Информатика генома мыши".
  13. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  14. ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  15. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  16. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
  17. ^ Се Й.Дж., Кунду Т.К., Ван З., Ковельман Р., Рёдер Р.Г. (ноябрь 1999 г.). «Субъединица TFIIIC90 TFIIIC взаимодействует с множеством компонентов механизма РНК-полимеразы III и обладает гистон-специфической ацетилтрансферазной активностью». Мол. Клетка. Биол. 19 (11): 7697–704. Дои:10.1128 / mcb.19.11.7697. ЧВК  84812. PMID  10523658.

дальнейшее чтение