Пиридоксальзависимые декарбоксилазы IV группы - Википедия - Group IV pyridoxal-dependent decarboxylases
| Пиридоксаль-зависимая декарбоксилаза, пиридоксаль-связывающий домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура d, l-лизинового комплекса диаминопимелатдекарбоксилазы | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Orn_Arg_deC_N | ||||||||
| Pfam | PF02784 | ||||||||
| Pfam клан | CL0036 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR022644 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00685 | ||||||||
| SCOP2 | 1qu4 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
| Пиридоксаль-зависимая декарбоксилаза, С-концевой листовой домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 димерный интерфейсный мутант орнитиндекарбоксилазы обнаруживает структуру геммедиаминового интермедиата | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Orn_DAP_Arg_deC | ||||||||
| Pfam | PF00278 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR022643 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00685 | ||||||||
| SCOP2 | 1qu4 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии пиридоксальзависимые декарбоксилазы группы IV площадь семья из ферменты в составе орнитиндекарбоксилаза EC 4.1.1.17, лизин декарбоксилаза EC 4.1.1.18, аргининдекарбоксилаза EC 4.1.1.19 и диаминопимелатдекарбоксилазаEC 4.1.1.20.[1] Он также известен как семейство декарбоксилазы Orn / Lys / Arg класса II.
Пиридоксаль-5'-фосфат -зависимый аминокислота декарбоксилазы можно разделить на четыре группы на основе аминокислотная последовательность. Группа IV включает эукариотический орнитин и лизин декарбоксилаза и прокариотический биосинтетический тип аргинин декарбоксилаза и диаминопимелат декарбоксилаза.[1]
Члены этой семьи, скорее всего, эволюционный связанных, не имеют обширных областей сходства последовательностей. В белки содержать консервированный лизин остаток, который известен, в мышь ODC должен быть сайтом присоединения пиридоксаль-фосфатной группы.[2] В белки также содержат отрезок из трех последовательных глицин остатков и было предложено быть частью субстрат -обвязочная область.[3]
Смотрите также
- Пиридоксальзависимые декарбоксилазы I группы
- Пиридоксальзависимые декарбоксилазы II группы
- Пиридоксальзависимые декарбоксилазы III группы
Рекомендации
- ^ а б Сандмайер Э., Хейл Т.И., Кристен П. (май 1994 г.). «Множественное эволюционное происхождение пиридоксаль-5'-фосфат-зависимых декарбоксилаз аминокислот». Евро. J. Biochem. 221 (3): 997–1002. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1994.tb18816.x. PMID 8181483.
- ^ Пулин Р., Лу Л., Акерманн Б., Бей П., Пегг А. Э. (январь 1992 г.). «Механизм необратимой инактивации орнитиндекарбоксилазы мышей альфа-дифторметилорнитином. Характеристика последовательностей в сайтах связывания ингибитора и кофермента». J. Biol. Chem. 267 (1): 150–8. PMID 1730582.
- ^ Мур Р.К., Бойл С.М. (август 1990 г.). «Нуклеотидная последовательность и анализ гена speA, кодирующего биосинтетическую аргининдекарбоксилазу в Escherichia coli». J. Bacteriol. 172 (8): 4631–40. Дои:10.1128 / jb.172.8.4631-4640.1990. ЧВК 213298. PMID 2198270.