Суперсемейство галоациддегидрогеназ - Haloacid dehydrogenase superfamily

Гидролаза_3
PDB 1rkq EBI.jpg
кристаллическая структура хед-подобной фосфатазы yida из e. кишечная палочка
Идентификаторы
СимволГидролаза_3
PfamPF08282
Pfam кланCL0137
ИнтерПроIPR013200

В надсемейство галогенациддегидрогеназы (HAD суперсемейство) является надсемейство из ферменты которые включают фосфатазы, фосфонатазы, АТФазы P-типа, бета-фосфоглюкомутазы, фосфоманномутазы, и дегалогеназы, и участвуют во множестве сотовый процессы от аминокислота биосинтез к детоксикация.[1][2]

Примеры

ХАД домен содержится в нескольких различных белках, включая:

Человеческие гены, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают:

Рекомендации

  1. ^ Кунин Э.В., Татусов Р.Л. (ноябрь 1994 г.). «Компьютерный анализ бактериальных галогенкислотдегалогеназ определяет большое суперсемейство гидролаз с различной специфичностью. Применение итеративного подхода к поиску в базе данных». Журнал молекулярной биологии. 244 (1): 125–32. Дои:10.1006 / jmbi.1994.1711. PMID  7966317.
  2. ^ Сринивасан Б (2011). Исследования структурных функций трех членов суперсемейства ферментов галоациддегалогеназы (HAD). Бангалор: JNCASR.
  3. ^ Gomès E, Jakobsen MK, Axelsen KB, Geisler M, Palmgren MG (декабрь 2000 г.). «Терпимость к холоду у Arabidopsis включает ALA1, член нового семейства предполагаемых транслоказ аминофосфолипидов». Растительная клетка. 12 (12): 2441–2454. Дои:10.2307/3871240. JSTOR  3871240. ЧВК  102229. PMID  11148289.
  4. ^ Ву Дж, Вудард Р.В. (май 2003 г.). «Escherichia coli YrbI представляет собой 3-дезокси-D-манно-октулозонат-8-фосфатфосфатазу». Журнал биологической химии. 278 (20): 18117–23. Дои:10.1074 / jbc.M301983200. PMID  12639950.
  5. ^ Empadinhas N, Marugg JD, Borges N, Santos H, da Costa MS (ноябрь 2001 г.). «Путь синтеза маннозилглицерата в гипертермофильном архее Pyrococcus horikoshii. Биохимическая и генетическая характеристика ключевых ферментов». Журнал биологической химии. 276 (47): 43580–8. Дои:10.1074 / jbc.M108054200. PMID  11562374.
  6. ^ Ким Й., Якунин А.Ф., Кузнецова Е., Сюй Х, Пенникук М., Гу Дж., Чунг Ф., Праудфут М., Эрроусмит С.Х., Йоахимиак А., Эдвардс А.М., Кристендат Д. (январь 2004 г.). «Характеристика новой фосфогликолят фосфатазы на основе структуры и функций из Thermoplasma acidophilum». Журнал биологической химии. 279 (1): 517–26. Дои:10.1074 / jbc.M306054200. ЧВК  2795321. PMID  14555659.
  7. ^ Сринивасан Б, Баларам Х (2007). «Нуклеотидазы ISN1 и белок суперсемейства HAD: анализ in silico последовательности и структуры». В биологии Silico. 7 (2): 187–93. PMID  17688444.
  8. ^ Сринивасан Б., Фоухар Ф., Шукла А., Сампанги С., Кулкарни С., Абашидзе М., Ситараман Дж., Лью С., Мао Л., Актон ТБ, Сяо Р., Эверетт Дж. К., Монтелионе ГТ, Тонг Л., Баларам Х (март 2014 г.). «Аллостерическая регуляция и активация субстрата в цитозольной нуклеотидазе II из Legionella pneumophila». Журнал FEBS. 281 (6): 1613–1628. Дои:10.1111 / фев.12727. ЧВК  3982195. PMID  24456211.
  9. ^ Шринивасан Б., Кемпайя Нагаппа Л., Шукла А., Баларам Н. (апрель 2015 г.). «Предсказание субстратной специфичности и предварительная кинетическая характеристика гипотетического белка PVX_123945 из Plasmodium vivax». Экспериментальная паразитология. 151-152: 56–63. Дои:10.1016 / j.exppara.2015.01.013. PMID  25655405.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR013200