Гаплогруппа D-M55 - Haplogroup D-M55

Гаплогруппа D-M55
Возможное время происхождения35,000-40,000YBP[1]

44,600 [95% ДИ 41,400 <-> 47,800] лн.[2]
Возраст коалесценции21 100 [95% ДИ 19 000 <-> 23 300] лн[2]
Возможное место происхождениявозможно Японский архипелаг
ПредокD-M174
Определение мутацийM55, M57, M64.1, M179, P37.1, P41.1, P190, 12f2b
Самые высокие частотыJmon люди;
сегодня: Айны 、Народ рюкюань

Гаплогруппа D-M55 (M64.1 / Page44.1), также известный как Гаплогруппа D1a2a это Y-хромосома гаплогруппа. Это одна из двух ветвей гаплогруппы D1a. Другой D1a1, который часто встречается в Тибет а также редко распространяется в Центральная Азия, Восточная Азия, и Материковая часть Юго-Восточной Азии.

Гаплогруппа D-M55 содержится примерно в 33%[3][4][5][6][7] современного Японский самцы. Он был обнаружен в четырнадцати из шестнадцати выборок или 87,5% выборки Айны мужчин в одном исследовании, опубликованном в 2004 г.[8] и в трех из четырех или 75% выборки мужчин айнов в другом исследовании, опубликованном в 2005 году, в котором некоторые лица из исследования 2004 года могли быть повторно протестированы.[4] В настоящее время это самая распространенная гаплогруппа Y-ДНК в Японии, если рассматривать O1-F265 и O2-M122 (TMRCA примерно 30 000 ~ 35 000 лн) как отдельные гаплогруппы. Считается, что гаплогруппа D-M55 родилась в Японии за 38-37 тысяч лет до настоящего времени.[1] Один образец D1a2a также был обнаружен среди древних образцов Кобанская культура между Россия и Грузия.[9]

Недавно было подтверждено, что японская ветвь гаплогруппы D-M55 отличается и изолирована от других D-ветвей более 53000 лет назад. Раскол в D1a, вероятно, произошел в Центральной Азии, в то время как некоторые другие предполагают мгновенный раскол во время происхождения самой гаплогруппы D, поскольку японская ветвь имеет пять уникальных мутаций, не обнаруженных ни в одной другой D-ветви.[10]

История

Маршрут миграции гаплогруппы D считается наиболее вероятным Haber et al. 2019 г.

Среди подгрупп гаплогруппы D предок D-M55 отправился на восток, чтобы достичь Японского архипелага.[11] Майкл Ф. Хаммер из Университет Аризоны сказал: "Предки народа Дземон жили в Средней Азии около 50 000 лет назад. Они продолжали мигрировать на восток и прибыли в Япония южнокорейскими и Рюкюань маршрут и северный Охотск маршрут (Сахалин и Хоккайдо ) около 30 000 лет назад, а D1a2a родился на Японском архипелаге.[12] "Мицуру Сакитани сказал, что гаплогруппа D1 пришла из Средней Азии на север Кюсю через Горный Алтай и Корейский полуостров более чем за 40 000 лет до настоящего, а гаплогруппа D-M55 (D1a2a) родилась на Японском архипелаге.[11]

Недавние исследования показывают, что D-M55 был основной линией Jmon люди с частотой около 70%.[13]

Частота

Средняя частота на японском языке составляет около 33%.[3][4][6][7] Высокие частоты встречаются в разных местах Японии, особенно на Хоккайдо, восточном Хонсю и Окинава.

Древняя ДНК

А Джомон человек раскопаны из останков Фунадомари (около 3800 - 3500 YBP) в Остров Ребун в Хоккайдо принадлежит гаплогруппе D1a2a2a (D-CTS220).[16] Это открытие подтвердило гипотезу о том, что гаплогруппа D-M55 является линией Джемона.

В исследовании, опубликованном в «Журнале археологической науки» Булыгиной и соавт. 2020 проанализированы древние Кобанские захоронения и нашли один образец гаплогруппы D1a2a (D-M55), который распространен среди Айны.[9]

Филогенетическое дерево

По дереву ISOGG (Версия: 14.151).[17]

использованная литература

  1. ^ а б Ши, Хун; Чжун, Хуа; Пэн, Йи; Дун, Юн-ли; Ци, Сюэ-бин; Чжан, Фэн; Лю, Лу-Фанг; Тан, Си-цзе; Ма, Рунлин З; Сяо, Чун-Цзе; Уэллс, Р. Спенсер; Джин, Ли; Су, Бинг (29 октября 2008 г.). «Y-хромосома - свидетельство самого раннего современного человеческого поселения в Восточной Азии и множественного происхождения тибетского и японского населения». BMC Биология. 6: 45. Дои:10.1186/1741-7007-6-45. ЧВК  2605740. PMID  18959782. открытый доступ
  2. ^ а б YFull Haplogroup YTree v7.02.01 от 15 марта 2019 г.
  3. ^ а б c Като, Тору; Мунхбат, Батмунх; Тунаи, Кеничи; и другие. (2005). «Генетические особенности монгольских этносов, выявленные с помощью анализа Y-хромосомы». Ген. 346: 63–70. Дои:10.1016 / j.gene.2004.10.023. PMID  15716011.
  4. ^ а б c d е ж г час я j k Хаммер, Майкл Ф .; Карафет, Татьяна М .; Парк, Хуэйонг; Омото, Кейчи; Харихара, Синдзи; Стоункинг, Марк; Хораи, Сатоши (2006). «Двойное происхождение японцев: общая почва для Y-хромосом охотников-собирателей и фермеров». Журнал генетики человека. 51 (1): 47–58. Дои:10.1007 / s10038-005-0322-0. PMID  16328082.
  5. ^ ЮИЧИ САТО, ТОСИКАЦУ ШИНКА, АШРАФ А. ЭВИС, АЙКО ЯМАУТИ, ТЕРУАКИ ИВАМОТО, ЮТАКА НАКАХОРИ Обзор генетической изменчивости Y-хромосомы современных японских мужчин.
  6. ^ а б c d е ж г Нонака, I .; Minaguchi, K .; Такезаки, Н. (2 февраля 2007 г.). «Бинарные гаплогруппы Y-хромосомы в популяции Японии и их связь с 16 полиморфизмами Y-STR». Анналы генетики человека. 71 (Pt 4): 480–95. Дои:10.1111 / j.1469-1809.2006.00343.x. HDL:10130/491. PMID  17274803. S2CID  1041367.
  7. ^ а б Хараяма, Юта; Камей, Саяко; Сато, Норико; Хаяси, Токутаро; Сиодзаки, Тэцуя; Ота, Масао; Асамура, Хидеки (01.01.2014). «Анализ гаплогрупп Y хромосомы в популяции Японии с использованием коротких ампликонов и его применение в судебно-медицинской экспертизе». Юридическая медицина. 16 (1): 20–25. Дои:10.1016 / j.legalmed.2013.10.005. ISSN  1344-6223. PMID  24262653.
  8. ^ а б Тадзима, Ацуши; и другие. (2004). ""(2 марта 2004 г.). «Генетическое происхождение айнов установлено на основе комбинированного анализа ДНК материнской и отцовской линий». Журнал генетики человека. 49 (4): 187–193. Дои:10.1007 / s10038-004-0131-x. PMID  14997363.
  9. ^ а б Булыгина, Евгения; Цыганкова, Светлана; Шарко, Федор; Слободова Наталья; Груздева Наталья; Расторгуев Сергей; Белинский, Андрей; Херке, Генрих; Кадиева, Анна; Демиденко, Сергей; Шведчикова, Татьяна (01.06.2020). «Митохондриальное и Y-хромосомное разнообразие доисторической кобанской культуры Северного Кавказа». Журнал археологической науки: отчеты. 31: 102357. Дои:10.1016 / j.jasrep.2020.102357. ISSN  2352-409X.
  10. ^ Мондаль, Маюх и Бергстрём, Андерс и Сюэ, Яли и Калафель, Франческ и Лааюни, Хафид и Казальс, Ферран и Маджумдер, Партха и Тайлер-Смит, Крис и Бертранпетит, Жауме. (2017). Последовательности Y-хромосомы различных популяций Индии и предки андаманцев. Генетика человека. 136. 10.1007 / s00439-017-1800-0.
  11. ^ а б 崎 谷 満 『DNA ・ 考古 ・ 言語 の 学 が 示 す 新 ・ 日本 列島』 （勉 誠 出 2009） (на японском языке)
  12. ^ http://www.eva.mpg.de/genetics/pdf/Japan.pdf
  13. ^ Охаши, Джун; Токунага, Кацуши; Хитоми, Юки; Савай, Хироми; Хор, Сейк-Сун; Нака, Идзуми; Ватанабэ, Юске (17.06.2019). «Анализ всей последовательности Y-хромосомы раскрывает историю популяции Японии в период Дзёмон». Научные отчеты. 9 (1): 8556. Bibcode:2019НатСР ... 9.8556Вт. Дои:10.1038 / s41598-019-44473-z. ISSN  2045-2322. ЧВК  6572846. PMID  31209235.
  14. ^ Ким, Сун-Хи; Ким, Ки-Чхоль; Шин, Донг-Джик; Джин, Хан-Джун; Квак, Кён-Дон; Хан, Мюн-Су; Сон, Джун-Мён; Ким, Вон; Ким, Ук (2011). «Высокие частоты линий гаплогруппы O2b-SRY465 Y-хромосомы в Корее: генетическая перспектива заселения Кореи». Следственная генетика. 2011 (2): 10. Дои:10.1186/2041-2223-2-10. ЧВК  3087676. PMID  21463511.
  15. ^ Тумонггор, Мерианн К.; Карафет, Татьяна М; Дауни, Шон; и другие. (2014). «Изоляция, контакты и социальное поведение сформировали генетическое разнообразие в Западном Тиморе». Журнал генетики человека. 59 (9): 494–503. Дои:10.1038 / jhg.2014.62. ЧВК  4521296. PMID  25078354.
  16. ^ 神 澤 ほ か (2016) 「礼 文 島 船泊 縄 文人 の 核 ゲ ノ ム 解析」 70 回 日本 大会 [1] (по-японски)
  17. ^ [2]
  18. ^ Thangaraj K, Singh L, Reddy AG, Rao VR, Sehgal SC, Underhill PA, Pierson M, Frame IG, Hagelberg E (январь 2003 г.). «Генетическая близость жителей Андаманских островов, исчезающая человеческая популяция». Текущая биология. 13 (2): 86–93. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 01336-2. PMID  12546781. S2CID  12155496.
  19. ^ Y-полный
  20. ^ Y-ДНК Гаплогруппа D и ее субклады - 2014
  21. ^ Тайлер-Смит, Крис; Сюэ, Яли; Thomas, Mark G .; Ян, Хуаньминь; Арчиеро, Елена; Асан; Коннелл, Брюс А .; Джонс, Эбигейл Л .; Хабер, Марк (13.06.2019). «Редкая африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 с глубокими корнями и ее значение для распространения современного человека за пределы Африки». Генетика. 212 (4): 1421–1428. Дои:10.1534 / генетика.119.302368. ISSN  0016-6731. ЧВК  6707464. PMID  31196864.
  22. ^ Эстес, Роберта (21.06.2019). "Захватывающие новые открытия гаплогруппы D ДНК Y!". DNAeXplained - Генетическая генеалогия. Получено 2019-07-08.
Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
гHIJK
IJKЧАС
IJK
я   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     Т    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п  [χ 12]
Нет  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр