IFITM3 - IFITM3
Интерферон-индуцированный трансмембранный белок 3 (IFITM3) - это белок что у людей кодируется IFITM3 ген.[5][6][7] Он играет важную роль в иммунная система защита от Свиной грипп, где повышенные уровни IFITM3 поддерживают низкий уровень вирусов, а удаление IFITM3 позволяет вирус умножить без отметки.[8] Это наблюдение получило дальнейшее развитие в недавнем исследовании Пол Келлэм лаборатория, которая показывает, что однонуклеотидный полиморфизм в человеческом гене IFITM3, который, как предполагается, увеличивает восприимчивость к гриппу, чрезмерно представлен у людей, госпитализированных с пандемия H1N1.[9] Считается, что распространенность этой мутации составляет примерно 1/400 в европейских популяциях.[9][10]
Модельные организмы
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Гомозигота жизнеспособность | Нормальный |
| Плодородие | Нормальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Беспокойство | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Горячая тарелка | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Температура тела | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Плазма иммуноглобулины | Нормальный |
| Гематология | Нормальный |
| Лимфоциты периферической крови | Нормальный |
| Микроядерный тест | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Гистопатология кожи | Нормальный |
| Сальмонелла инфекционное заболевание | Нормальный[11] |
| Citrobacter инфекционное заболевание | Нормальный[12] |
| Все тесты и анализы от[13][14] |
Модельные организмы были использованы при изучении функции IFITM3. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Ifitm3tm1Masu[15][16] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект мутагенеза с высокой пропускной способностью для создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.[17][18][19]
Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[13][20] Было проведено 24 испытания на мутант мышей, но никаких значительных отклонений не наблюдалось.[13] Однако заражение вирусом гриппа А показало, что эти мыши проявляют повышенную вирусную чувствительность.[9]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000142089 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025492 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Левин А.Р., Рид Л.Е., МакМахон М., Старк Г.Р., Керр И.М. (август 1991 г.). «Молекулярный анализ семейства генов, индуцируемых интерфероном человека». Eur J Biochem. 199 (2): 417–423. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1991.tb16139.x. PMID 1906403.
- ^ Танака СС, Ямагути Ю.Л., Цой Б., Ликерт Х., Там П.П. (декабрь 2005 г.). «Белки семейства IFITM / Mil / fragilis IFITM1 и IFITM3 играют разные роли в хоминге и отталкивании первичных зародышевых клеток мыши». Dev Cell. 9 (6): 745–756. Дои:10.1016 / j.devcel.2005.10.010. PMID 16326387.
- ^ «Ген Entrez: IFITM3 индуцированный интерфероном трансмембранный белок 3 (1-8U)».
- ^ «Обнаружена естественная защита от свиного гриппа».
- ^ а б c Everitt A.R .; и другие. (Март 2012 г.). «IFITM3 ограничивает заболеваемость и смертность от гриппа». Природа. 484 (7395): 519–23. Дои:10.1038 / природа10921. ЧВК 3648786. PMID 22446628.
- ^ «Генный дефект связан с серьезным риском гриппа».
- ^ "Сальмонелла данные о заражении Ifitm3 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Citrobacter данные о заражении Ifitm3 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
- ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
- ^ "Информатика генома мыши".
- ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
дальнейшее чтение
- Ваарала М.Х., Порвари К., Кюллонен А., Вихко П. (2000). «Дифференциально экспрессируемые гены в двух линиях клеток рака простаты LNCaP, отражающие изменения во время прогрессирования рака простаты». Лаборатория. Вкладывать деньги. 80 (8): 1259–1268. Дои:10.1038 / labinvest.3780134. PMID 10950117.
- Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–1795. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
- Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–292. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК 1083732. PMID 11256614.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–2144. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
- Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
- Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Проблема с базой данных): D415 – D418. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК 1347501. PMID 16381901.