LCCL домен - LCCL domain
| LCCL | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | LCCL | ||||||||
| Pfam | PF03815 | ||||||||
| Pfam клан | CL0513 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR004043 | ||||||||
| CATH | 1jbi | ||||||||
| SCOP2 | 1jbi / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии LCCL домен это белковый домен который был назван в честь нескольких хорошо известных белки которые были обнаружены содержащие его, а именно Фактор свертывания Limulus C, Кохлин (Coch-5b2) и Lgl1 (CRISPLD2 ). Это около 100 аминокислоты домен, чей C-терминал часть содержит очень консервативный гистидин в консервированный мотив YxxxSxxCxAAVHxGVI. Модуль LCCL считается автономно складывание домен, который использовался для строительства различных модульных белки через перетасовка экзонов. Он был найден в различных многоклеточный белки в связи с дополняют домены B-типа, Лектиновые домены С-типа, фон Виллебранда домены типа A, CUB домены, дискоидиновые лектиновые домены или CAP домены. Было высказано предположение, что домен LCCL может участвовать в липополисахарид (LPS) привязка.[1][2] LCCL представляет роман складывать.[3]
Некоторые белки, которые, как известно, содержат домен LCCL, включают фактор C Limulus, LPS-эндотоксин-чувствительный трипсин тип сериновая протеаза который служит для защиты организм от бактериальный инфекция; позвоночное животное кохлеарный белок cochlin или coch-5b2 (Cochlin, вероятно, секретный белок, мутации, затрагивающие домен LCCL coch-5b2, вызывают глухоту DFNA9 у людей); и млекопитающее поздно беременность легкое белок Lgl1, содержит две тандемные копии домена LCCL.[4]
использованная литература
- ^ Trexler M, Banyai L, Patthy L (сентябрь 2000 г.). «Модуль LCCL». Евро. J. Biochem. 267 (18): 5751–7. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2000.01641.x. PMID 10971586.
- ^ Робертсон Н.Г., Лу Л., Хеллер С., Торговец С. Н., Иви Р. Д., МакКенна М., Надол Дж. Б., Миямото Р. Т., Линтикум Ф. Х., Лубианка Нето Дж. Ф., Хадспет А. Дж., Сейдман К. Э., Мортон С. К., Сейдман Дж. Г. (ноябрь 1998 г.). «Мутации в новом гене улитки вызывают DFNA9, несиндромную глухоту человека с вестибулярной дисфункцией». Nat. Genet. 20 (3): 299–303. Дои:10.1038/3118. PMID 9806553. S2CID 16350815.
- ^ Лиепиньш, Э; Trexler, M; Кайкконен, А; Вайгельт, Дж; Bányai, L; Патти, L; Оттинг, Г. (1 октября 2001 г.). «Структура ЯМР домена LCCL и значение для нарушения слуха DFNA9». Журнал EMBO. 20 (19): 5347–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.19.5347. ЧВК 125649. PMID 11574466.
- ^ Каплан Ф., Леду П., Кассамали Ф. К., Ганьон С., Пост М., Келер Д., Деймлинг Дж., Суизи Н. Б. (июнь 1999 г.). «Новый регулируемый ген в мезенхиме легких: гомология с ингибитором трипсина, полученным из опухоли». Am. J. Physiol. 276 (6, п. 1): L1027-36. Дои:10.1152 / ajplung.1999.276.6.L1027. PMID 10362728.