Lachancea kluyveri - Lachancea kluyveri

Lachancea kluyveri
Научная классификация редактировать
Королевство:Грибы
Разделение:Аскомикота
Учебный класс:Сахаромицеты
Заказ:Saccharomycetales
Семья:Saccharomycetaceae
Род:Lachancea
Разновидность:
L. kluyveri
Биномиальное имя
Lachancea kluyveri
(Phaff, M.W.Mill. И Шифрин) Курцман (2003)
Синонимы
  • Saccharomyces kluyveri Phaff, M.W. Mill. И Шифрин (1956)
  • Torulaspora kluyveri (Phaff, M.W.Mill. & Shifrine) Kock. (1982)
  • Saccharomyces smittii Capr. (1958)
  • Saccharomyces silvestris Дженсен (1967)

Lachancea kluyveri аскомицет дрожжи ассоциируется с плодовыми мушками, потоки слизи, почвы и продукты.

Среда обитания

Среда обитания L. kluyveri не очень хорошо известно, потому что было зарегистрировано всего около 30 изолятов. Однако считается, что он широко распространен в окружающей среде. Впервые описан как Saccharomyces kluyveri в 1956 г. плодовые мошки в Калифорния,[1] этот вид был изолирован из потоков слизи на деревьях и почвах Северной Америки и Европы,[2][3] и сыры.[4] Также сообщалось, что он был агентом распространения микоз у пациента с ВИЧ / СПИД.[5]

Биология

Lachancea kluyveri это бутоньерки относится к Saccharomyces cerevisiae, или пекарские дрожжи, модельный организм интенсивно используется в биохимии, генетике и клеточной биологии. В 2003 году переведен из рода Сахаромицеты к роду Lachancea назван в честь канадского миколога и биолога дрожжей Марка-Андре Лашанса.[6] Saccharomyces cerevisiae и L. kluyveri имеют несколько фундаментальных отличий, которые требуют геномных сравнений. Во-первых, как и большинство типов клеток, L. kluyveri прибегает к ферментация (разложение сахаров в отсутствие кислорода) только тогда, когда кислород ограничен. С. cerevisiae, с другой стороны, предпочитает проводить ферментацию даже в присутствии кислорода. Это означает, что L. kluyveri делает более эффективное использование глюкозы для производства энергии. Следовательно, L. kluyveri представляет собой контрастирующую модель одной из самых необычных черт С. cerevisiae. Второй, L. kluyveri имеет более простую организацию генома, чем С. cerevisiae: похоже, он стал видом до полной дупликации генома, произошедшей в линии Saccharomyces. В результате его геном меньше (около 9,5 млн. пар оснований ), чем у С. cerevisiae с меньшим количеством дублированных генов. Кроме того, L. kluyveri становится все более широко используемым в качестве модельного организма и для промышленных применений, таких как производство белков, поскольку его выход биомассы выше, чем у С. cerevisiae за счет более эффективного использования глюкозы.[7]

Информация о последовательности

Геномная информация
NCBI идентификатор генома69
Плоидностьдиплоид
Размер генома12,6 Мб
Количество хромосомы8 пар
Год окончания2002

В L. kluyveri Первоначально геном был секвенирован в 2002 году примерно в 3,5 раза по полному геному (WGS).[7]

Рекомендации

  1. ^ Phaff, H.J .; Miller, M. W .; Шифрин, М. (1956). "Таксономия дрожжей, выделенных из Дрозофила в районе Йосемити в Калифорнии ". Антони ван Левенгук. 22 (2): 145–61. Дои:10.1007 / BF02538322. PMID  13340701.
  2. ^ Miller, M. W .; Phaff, H.J .; Снайдер, Х. Э. (1962). «О встречаемости различных видов дрожжей в природе». Mycopathologia et Mycologia Applicata. 16: 1. Дои:10.1007 / BF02136176.
  3. ^ Каприотти, Аугусто (1958). "Saccharomyces smittii ноя Спец. Новые дрожжи, выделенные из голландских, итальянских и шведских почв ». Антони ван Левенгук. 24: 215. Дои:10.1007 / BF02548448.
  4. ^ Войтатович, М; Chrzanowska, J; Juszczyk, P; Скиба, А; Гдула, А (2001). «Идентификация и биохимическая характеристика дрожжевой микрофлоры сыра Рокпол». Международный журнал пищевой микробиологии. 69 (1–2): 135–40. Дои:10.1016 / S0168-1605 (01) 00582-7. PMID  11589552.
  5. ^ Пынка, М; Wnuk, A; Бандер, Д; Сычевска, М; Боронь, А; Прост, Б; Wrzecion, S (1998). "Распространенная инфекция Saccharomyces kluyveri у больного СПИДом ». Инфекционное заболевание. 26 (3): 184–6. Дои:10.1007 / bf02771850. PMID  9646114.
  6. ^ Курцман, CP (2003). "Филогенетическая ограниченность Сахаромицеты, Kluyveromyces и другие представители Saccharomycetaceae, а также предложение новых родов Lachancea, Nakaseomyces, Наумовия, Вандервальтозима и Зиготоруласпора". FEMS дрожжевые исследования. 4 (3): 233–45. Дои:10.1016 / S1567-1356 (03) 00175-2. PMID  14654427.
  7. ^ а б Проект секвенирования генома S.kluyveri