Мотив Lacto-usp РНК - Lacto-usp RNA motif

Лакто-usp РНК
Lacto-usp-RNA.svg
Консенсусная вторичная структура лакто-usp РНК
Идентификаторы
СимволЛакто-usp РНК
РфамRF01710
Прочие данные
РНК типмРНК
Домен (ы)Молочнокислые бактерии
PDB структурыPDBe

В Лакто-usp Мотив РНК консервированный РНК структура, определенная в бактерии от биоинформатика.[1] Лакто-usp РНК находятся исключительно в молочнокислые бактерии, и исключительно в возможных 5 'нетранслируемые области из (5 ′ UTRs) опероны содержащие гипотетический ген и usp ген. В usp ген кодирует универсальный стресс-белок. Было предложено, чтобы лакто-usp может соответствовать 6S РНК соответствующих видов, потому что у четырех из пяти из этих видов отсутствует предсказанная 6S РНК, а 6S РНК обычно встречаются в 5 'UTRs usp гены. Однако, учитывая, что Lacto-usp Мотив РНК намного короче стандартной структуры 6S РНК, функция Lacto-usp РНК остается неясным.

использованная литература

  1. ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК  2864571. PMID  20230605.

внешние ссылки