Ссылка на домен - Википедия - Link domain
| Ссылка на домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура гиалуронансвязывающего домена человека CD44 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | СВЯЗЬ | ||||||||
| Pfam | PF00193 | ||||||||
| Pfam клан | CL0056 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000538 | ||||||||
| УМНАЯ | SM00445 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00955 | ||||||||
| SCOP2 | 1o7b / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CDD | cd01102 | ||||||||
| |||||||||
А Ссылка на домен или же Модуль связи, также известный как Xlink домен (X для внеклеточный ), это белковый домен это связано с гиалуроновая кислота.[1] Это важно для миграции клеток крови и апоптоз.[2] Связующий домен обнаружен в некоторых внеклеточных белках в позвоночные такой как гиалектаны.[3] Похоже, что он участвует в внеклеточный матрикс сборка и стабильность, клеточная адгезия, и миграция.[3][4]
Структура
В структура было показано, что состоит из двух альфа спирали и два антипараллельный бета-листы расположены вокруг большого гидрофобное ядро аналогичен лектину С-типа.[5] Этот домен содержит четыре консервированный цистеины участвует в двух дисульфидных облигации. Связующий домен также получил название HABM (гиалуроновая кислота привязка модуль)[4] и PTR (тандемный повтор протеогликана).[6]
Белки связывающих доменов
Белки которые содержат домен ссылки, включают:
- hyalectans (семейство протеогликаны ): Аггрекан, бревикан, нейрокан и Versican, которые выразил в ЦНС;
- белок хрящевой связи (LP), протеогликан, который вместе с HA и аггреканом образует многомолекулярные агрегаты;
- Белок 6, индуцируемый фактором некроза опухоли (ТСГ-6 ), которые могут участвовать во взаимодействиях клетка-клетка и клетка-матрица во время воспаление и онкогенез;
- CD44 антиген, основной рецептор клеточной поверхности для HA.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ "Свяжите подпись домена и профиль". PROSITE. Декабрь 2004 г.. Получено 30 сентября 2016.
- ^ Йонеда М, Накамура Т, Мурай М, Вада Х (2010). «Доказательства гепарин-связывающей способности асцидиевого домена Xlink и понимание эволюции домена Xlink в хордовых». Дж Мол Эвол. 71 (1): 51–9. Bibcode:2010JMolE..71 ... 51Y. Дои:10.1007 / s00239-010-9363-х. PMID 20582409. S2CID 10614265.
- ^ а б Хайнс, РО; Наба, А (21 сентября 2011 г.). «Обзор матрисомы - перечень компонентов и функций внеклеточного матрикса». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 4 (1): a004903. Дои:10.1101 / cshperspect.a004903. ЧВК 3249625. PMID 21937732.
- ^ а б Барта Э., Деак Ф., Поцелуй I (июнь 1993 г.). «Эволюция гиалуронансвязывающего модуля связующего белка». Biochem. J. 292 (3): 947–9. Дои:10.1042 / bj2920947. ЧВК 1134205. PMID 8318021.
- ^ Kohda D, Morton CJ, Parkar AA, Hatanaka H, Inagaki FM, Campbell ID, Day AJ (сентябрь 1996 г.). «Структура раствора связующего модуля: гиалуронановый связывающий домен, участвующий в стабильности внеклеточного матрикса и миграции клеток». Клетка. 86 (5): 767–75. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80151-8. PMID 8797823. S2CID 16347386.
- ^ Бриссетт NC, Perkins SJ (июнь 1996 г.). «Белковая складка тандемного повторяющегося домена гиалуронат-связывающего протеогликана связывающего белка, аггрекана и CD44 аналогична таковой в суперсемействе лектинов С-типа». FEBS Lett. 388 (2–3): 211–6. Дои:10.1016/0014-5793(96)00576-5. PMID 8690089. S2CID 24295651.