NCI-60 - NCI-60
В NCI-60 рак клеточная линия панель - это группа из 60 человек рак клеточные линии, используемые Национальный институт рака (NCI) для скрининга соединений для выявления потенциальной противораковой активности.[1]
Цель
Процедура проверки называется Скрининг линий опухолевых клеток человека NCI-60, и это один из Услуги по открытию и развитию NCI Программа развивающей терапии (АКДС).[2][3][4]Показатели скрининга для каждой клеточной линии цитостатический и цитотоксический воздействие тестируемых веществ.[2]
Из-за разнообразия клеточных линий можно сравнивать тестируемые соединения по характеру их действия, высокая корреляция потенциально соответствует сходным механизмам действия.[2]Автоматическое сравнение с базой данных, содержащей более 88 000 чистых соединений и более 34 000 сырых экстрактов (по состоянию на 6 января 2017 г.[Обновить]) предоставляется СРАВНИВАТЬ инструмент, который показывает список веществ, ранжированных по Коэффициенты корреляции Пирсона для данного исследуемого вещества.[5]
Эта же панель используется в Молекулярная целевая программа для характеристики молекулярных мишеней. Измерения включают уровни белка, измерения РНК, статус мутации и ферментная активность уровни.[6]
Сотовые линии
Панель содержит линии ячеек, представляющие лейкемия, меланома, немелкоклеточный рак легкого, и рак мозг, яичник, грудь, двоеточие, почка, и предстательная железа.[1][2]
13 дополнительных клеточных линий оцениваются для использования в программе скрининга, среди них две линии, полученные из пока не представленных мелкоклеточный рак легкого.[1]
Все клеточные линии, кроме одной (по состоянию на 6 января 2017 г.[Обновить]) доступны другим лабораториям, включая дополнительные клеточные линии.[1]
Неправильная идентификация и неправильная классификация
Примерно на рубеже тысячелетий было обнаружено, что несколько клеточных линий были неправильно идентифицированы или неправильно классифицированы во время расследования или ранее:[7][8][9]
MDA-MB-435, первоначально классифицированная как линия клеток рака молочной железы, была идентифицирована как линия клеток меланомы.[7]При дальнейшем исследовании выяснилось, что текущий MDA-MB-435 произошел от того же человека, что и клеточная линия. M14.[7]Исследование клонов показало, что смешение с M14 произошло очень рано в истории MDA-MB-435, еще до того, как оно было включено в Программу развивающей терапии.[7]
NCI / ADR-RES, первоначально классифицированная как линия клеток рака груди, была идентифицирована как линия клеток опухоли яичника.[8]NCI / ADR-RES, по-видимому, был получен в определенный момент времени из клеточной линии OVCAR-8.[8]Первоначально линия клеток получила название MCF-7 / ADR-RES; он был переименован вместе с изменением классификации.[8]
Две линии клеток рака мозга, СНБ-19 и U251, как выяснилось, исходил от одного и того же человека.[9]Это делает возможной путаницу.
61-я клеточная линия, МДА-Н, было подтверждено, что он происходит из неправильно классифицированной линии клеток MDA-MB-435.[7]Таким образом, это также неверно классифицировано, поскольку на самом деле это линия клеток меланомы, но по состоянию на 6 января 2018 г.[Обновить] на официальном сайте он по-прежнему указан как линия клеток рака груди.[1]Эта клеточная линия недоступна с 6 января 2018 г.[Обновить].[1]
В Международный комитет по аутентификации клеточной линии поддерживает список зараженных клеточных линий.[10]Он включает в себя приведенные выше клеточные линии, хотя обычно даты и статьи отчетности значительно позже, чем первые даты, и статьи, вызывающие особую озабоченность в отношении соответствующей клеточной линии.[10][7][8][9]
Продолжение использования неправильной классификации
По состоянию на 2014 г.[Обновить] Сотни научных исследований все еще используют MDA-MB-435 в качестве модели рака груди, даже после того, как в 2007 году он был официально объявлен линией клеток меланомы, и даже в международных рецензируемых журналах с самым высоким рейтингом.[11]То же верно и для других ошибочно идентифицированных клеточных линий.[11]
Список сотовых линий NCI-60
| Клеточная линия | Классификация опухолей | (Возможно) неправильно идентифицировано | Исходная классификация | Недоступен | Время удвоения (часы) | Плотность посева | Идентификатор целлозавра и ссылка |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CCRF-CEM | Лейкемия | 26.7 | 40000 | CCRF-CEM (RRID: CVCL_0207) | |||
| HL-60 (ТБ) | Лейкемия | 28.6 | 40000 | HL-60 (TB) (RRID: CVCL_A794) | |||
| К-562 | Лейкемия | 19.6 | 5000 | К-562 (RRID: CVCL_0004) | |||
| МОЛТ-4 | Лейкемия | 27.9 | 30000 | МОЛТ-4 (RRID: CVCL_0013) | |||
| RPMI-8226 | Лейкемия | 33.5 | 20000 | RPMI-8226 (RRID: CVCL_0014) | |||
| SR | Лейкемия | 28.7 | 20000 | SR (RRID: CVCL_1711) | |||
| A549 / ATCC | Немелкоклеточное легкое | 22.9 | 7500 | A-549 (RRID: CVCL_0023) | |||
| EKVX | Немелкоклеточное легкое | 43.6 | 20000 | EKVX (RRID: CVCL_1195) | |||
| HOP-62 | Немелкоклеточное легкое | 39 | 10000 | HOP-62 (RRID: CVCL_1285) | |||
| HOP-92 | Немелкоклеточное легкое | 79.5 | 20000 | HOP-92 (RRID: CVCL_1286) | |||
| NCI-H226 | Немелкоклеточное легкое | 61 | 20000 | NCI-H226 (RRID: CVCL_1544) | |||
| NCI-H23 | Немелкоклеточное легкое | 33.4 | 20000 | NCI-H23 (RRID: CVCL_1547) | |||
| NCI-H322M | Немелкоклеточное легкое | 35.3 | 20000 | NCI-H322M (RRID: CVCL_1557) | |||
| NCI-H460 | Немелкоклеточное легкое | 17.8 | 7500 | NCI-H460 (RRID: CVCL_0459) | |||
| NCI-H522 | Немелкоклеточное легкое | 38.2 | 20000 | NCI-H522 (RRID: CVCL_1567) | |||
| COLO 205 | Двоеточие | 23.8 | 15000 | COLO 205 (RRID: CVCL_0218) | |||
| HCC-2998 | Двоеточие | 31.5 | 15000 | HCC2998 (RRID: CVCL_1266) | |||
| HCT116 | Двоеточие | 17.4 | 5000 | HCT 116 (RRID: CVCL_0291) | |||
| HCT-15 | Двоеточие | 20.6 | 10000 | HCT 15 (RRID: CVCL_0292) | |||
| HT-29 | Двоеточие | 19.5 | 5000 | HT-29 (RRID: CVCL_0320) | |||
| KM12 | Двоеточие | 23.7 | 15000 | KM12 (RRID: CVCL_1331) | |||
| SW-620 | Двоеточие | 20.4 | 10000 | SW620 (RRID: CVCL_0547) | |||
| SF-268 | ЦНС | 33.1 | 15000 | SF268 (RRID: CVCL_1689) | |||
| SF-295 | ЦНС | 29.5 | 10000 | SF295 (RRID: CVCL_1690) | |||
| SF-539 | ЦНС | 35.4 | 15000 | SF539 (RRID: CVCL_1691) | |||
| СНБ-19 | ЦНС | да | ЦНС | 34.6 | 15000 | СНБ-19 (RRID: CVCL_0535) | |
| СНБ-75 | ЦНС | 62.8 | 20000 | СНБ-75 (RRID: CVCL_1706) | |||
| U251 | ЦНС | да | ЦНС | 23.8 | 7500 | U-251MG (RRID: CVCL_0021) | |
| LOX IMVI | Меланома | 20.5 | 7500 | LOX-IMVI (RRID: CVCL_1381) | |||
| МАЛЬМ-3М | Меланома | 46.2 | 20000 | Мальме-3М (RRID: CVCL_1438) | |||
| M14 | Меланома | 26.3 | 15000 | M14 (RRID: CVCL_1395) | |||
| MDA-MB-435 | Меланома | да | Грудь | 25.8 | 15000 | MDA-MB-435 (RRID: CVCL_0417) | |
| СК-МЭЛ-2 | Меланома | 45.5 | 20000 | SK-MEL-2 (RRID: CVCL_0069) | |||
| СК-МЭЛ-28 | Меланома | 35.1 | 10000 | SK-MEL-28 (RRID: CVCL_0526) | |||
| СК-МЭЛ-5 | Меланома | 25.2 | 10000 | SK-MEL-5 (RRID: CVCL_0527) | |||
| UACC-257 | Меланома | 38.5 | 20000 | UACC-257 (RRID: CVCL_1779) | |||
| UACC-62 | Меланома | 31.3 | 10000 | UACC-62 (RRID: CVCL_1780) | |||
| ИГР-ОВ1 | Яичников | 31 | 10000 | ИГРОВ-1 (RRID: CVCL_1304) | |||
| OVCAR-3 | Яичников | 34.7 | 10000 | OVCAR-3 (RRID: CVCL_0465) | |||
| ОВКАР-4 | Яичников | 41.4 | 15000 | OVCAR-4 (RRID: CVCL_1627) | |||
| ОВКАР-5 | Яичников | 48.8 | 20000 | OVCAR-5 (RRID: CVCL_1628) | |||
| OVCAR-8 | Яичников | 26.1 | 10000 | OVCAR-8 (RRID: CVCL_1629) | |||
| NCI / ADR-RES (первоначально MCF-7 / ADR-RES) | Яичников | да | Грудь | 34 | 15000 | NCI-ADR-RES (RRID: CVCL_1452) | |
| СК-ОВ-3 | Яичников | 48.7 | 20000 | СК-ОВ-3 (RRID: CVCL_0532) | |||
| 786-О | Почечный | 22.4 | 10000 | 786-O (RRID: CVCL_1051) | |||
| A498 | Почечный | 66.8 | 25000 | A-498 (RRID: CVCL_1056) | |||
| ACHN | Почечный | 27.5 | 10000 | ACHN (RRID: CVCL_1067) | |||
| CAKI-1 | Почечный | 39 | 10000 | Caki-1 (RRID: CVCL_0234) | |||
| RXF 393 | Почечный | 62.9 | 15000 | RXF 393L (RRID: CVCL_1673) | |||
| SN12C | Почечный | 29.5 | 15000 | SN12C (RRID: CVCL_1705) | |||
| ТК-10 | Почечный | 51.3 | 15000 | ТК-10 (RRID: CVCL_1773) | |||
| UO-31 | Почечный | 41.7 | 15000 | UO-31 (RRID: CVCL_1911) | |||
| ПК-3 | Предстательная железа | 27.1 | 7500 | PC-3 (RRID: CVCL_0035) | |||
| ДУ-145 | Предстательная железа | 32.3 | 10000 | DU145 (RRID: CVCL_0105) | |||
| MCF7 | Грудь | 25.4 | 10000 | MCF-7 (RRID: CVCL_0031) | |||
| MDA-MB-231 / ATCC | Грудь | 41.9 | 20000 | MDA-MB-231 (RRID: CVCL_0062) | |||
| MDA-MB-468 | Грудь | 62 | 2000 | MDA-MB-468 (RRID: CVCL_0419) | |||
| HS 578T | Грудь | 53.8 | 20000 | HS 578T (RRID: CVCL_0332) | |||
| МДА-Н | Меланома | да | Грудь | недоступен | 22.5 | 15000 | MDA-N (RRID: CVCL_1910) |
| БТ-549 | Грудь | 53.9 | 20000 | BT-549 (RRID: CVCL_1092) | |||
| Т-47Д | Грудь | 45.5 | 20000 | Т-47Д (RRID: CVCL_0553) |
Список дополнительных линий сотовой связи
| Клеточная линия | Классификация опухолей | Разновидность | Плотность посева | Идентификатор целлозавра и ссылка |
|---|---|---|---|---|
| LXFL 529 | Немелкоклеточное легкое | человек | 10000 | LXFL 529L (RRID: CVCL_D085) |
| DMS 114 | Мелкоклеточное легкое | человек | 20000 | DMS 114 (RRID: CVCL_1174) |
| ШП-77 | Мелкоклеточное легкое | человек | 40000 | ШП-77 (RRID: CVCL_1693) |
| DLD-1 | Двоеточие | человек | 50000 | DLD-1 (RRID: CVCL_0248) |
| КМ20Л2 | Двоеточие | человек | 10000 | KM20L2 (RRID: CVCL_D889) |
| СНБ-78 | ЦНС | человек | 20000 | СНБ-78 (RRID: CVCL_B321) |
| XF 498 | ЦНС | человек | 20000 | XF 498 (RRID: CVCL_8928) |
| RPMI-7951 | Меланома | человек | 20000 | RPMI-7951 (RRID: CVCL_1666) |
| M19-MEL | Меланома | человек | 10000 | M19-MEL (RRID: CVCL_B415) |
| RXF-631 | Почечный | человек | 10000 | RXF 631L (RRID: CVCL_A780) |
| SN12K1 | Почечный | человек | 10000 | SN12K1 (RRID: CVCL_D106) |
| P388 | Лейкемия | мышь | 50000 | P388 (RRID: CVCL_7222) |
| P388 / ADR | Лейкемия | мышь | 50000 | P388 / ADR (RRID: CVCL_IZ75) |
Рекомендации
- ^ а б c d е ж грамм час «Клеточные линии на экране in vitro». Программа развивающей терапии. Национальный институт рака. 8 мая 2015. Получено 6 января 2018.
- ^ а б c d «Скрининг линий опухолевых клеток человека NCI-60». Программа развивающей терапии. Национальный институт рака. 26 августа 2015 г.. Получено 6 января 2018.
- ^ «Услуги по открытию и развитию». Программа развивающей терапии. Национальный институт рака. 26 августа 2015 г.. Получено 6 января 2018.
- ^ «Добро пожаловать в Программу развивающей терапии». Программа развивающей терапии. Национальный институт рака. Получено 6 января 2018.
- ^ «СРАВНИТЬ анализ». Программа развивающей терапии. Национальный институт рака. 11 августа 2015. Получено 6 января 2018.
- ^ «Молекулярные мишени». Программа развивающей терапии. Национальный институт рака. 12 мая 2015. Получено 7 января 2018.
- ^ а б c d е ж «MDA-MB-435 и его производное MDA-N представляют собой линии клеток меланомы, а не линии клеток рака груди». Программа развивающей терапии. Национальный институт рака. 8 мая 2015. Получено 6 января 2018.
- ^ а б c d е «Клеточная линия NCI / ADR-RES представляет собой линию опухолевых клеток яичников, а не линию груди». Программа развивающей терапии. Национальный институт рака. 8 мая 2015. Получено 6 января 2018.
- ^ а б c «Клеточные линии ЦНС SNB-19 и U251 получены от одного человека». Программа развивающей терапии. Национальный институт рака. 8 мая 2015. Получено 6 января 2018.
- ^ а б База данных перекрестно зараженных или неправильно идентифицированных клеточных линий (PDF), 8.0, Международный комитет по аутентификации клеточной линии (ICLAC), 1 декабря 2016 г., получено 6 января 2018
- ^ а б Прасад, Vidudala VTS; Гопалан, Рампрасад О.Г. (2 июня 2015 г.). «Продолжение использования MDA-MB-435, линии клеток меланомы, в качестве модели рака груди человека даже в 2014 году». NPJ рака груди. 1: 15002–. Дои:10.1038 / npjbcancer.2015.2. ЧВК 5515196. PMID 28721362.
- ^ а б Результат поиска "Целлозавр: 61 результат поиска" панель линии раковых клеток NCI60"". Целлозавр. Швейцарский институт биоинформатики. Получено 7 января 2018.Ссылка включает в себя список связанных страниц в результатах поиска.
- ^ «Целлозавр - ресурс знаний о клеточных линиях». Целлозавр. Швейцарский институт биоинформатики. Получено 17 января 2018.Ссылка включает страницы, найденные путем поиска с соответствующими именами строк ячеек, как указано в Список дополнительных линий сотовой связи.