Семья NiCoT - NiCoT family
В настоящее время известно, что белки принадлежат к Ni2+-Co2+ Семейство транспортеров (NiCoT) (TC № 2.A.52 ) можно найти в организмах от Грамотрицательный и Грамположительные бактерии к археи и немного эукариоты. Члены этого семейства катализируют усвоение Ni2+ и / или Co2+ в движущая сила протона -зависимый процесс.[1]
Структура
Эти белки имеют размер примерно от 300 до 400 аминоацильных остатков и содержат 6, 7 или 8 трансмембранных сегментов (TMS), которые, как считается, являются результатом внутригенный 4 Дупликация ТМС с последующей делецией одного или двух ТМС в случае 7 или 6 белков ТМС. Топологический анализ с помощью HoxN Ni2+ перевозчик Ralstonia eutropha (Alcaligenes eutrophus) предполагают, что он обладает 8 ТМС с N- и C-концами в цитоплазме. Сотрудничество2+ (Ni2+) перевозчик Родококк родохрозовый, NhlF, демонстрирует восемь предполагаемых TMS, а восемь очевидных TMS выявляются с помощью водолечение анализ множественных выравниваний последовательностей белков семейства. HX4Мотив DH в спирали 2 белка HoxN участвует в Ni2+ связывание, а спираль 1 и спираль 2, которые пространственно взаимодействуют, образуют фильтр селективности.[2] в Helicobacter pylori Гомолог NixA, несколько консервативных мотивов, как было показано, важны для Ni2+ переплет и транспорт.[1][3]
Известна по крайней мере одна кристаллическая структура, определенная Yu et al.,[4] доступны на PDB: 4М58.
Реакция
Общая реакция, катализируемая белками семейства NiCoT, следующая:[1]
- [Ni2+ и / или Co2+] (уходит) → [Ni2+ и / или Co2+] (в).
Белки
Некоторые охарактеризованные белки принадлежат к группе Ni2+-Co2+ Семейство транспортеров (NiCoT) (TC № 2.A.43). Полный список этих белков вместе с их классификационными идентификационными номерами транспортеров (TCID), доменом, царством / типом и некоторыми примерами можно найти в База данных классификации транспортеров.
Рекомендации
- ^ а б c Сайер, Милтон. "База данных классификации транспортеров: 2.A.52 Семейство транспортеров Ni2 + -Co2 + (NiCoT)". tcdb.org. Получено 4 января 2016.
- ^ Деген, О; Эйтингер, Т. (июль 2002 г.). «Субстратная специфичность пермеаз никеля / кобальта: выводы из мутантов, измененных в трансмембранных доменах I и II». J. Bacteriol. 184 (13): 3569–77. Дои:10.1128 / jb.184.13.3569-3577.2002. ЧВК 135128. PMID 12057951.
- ^ Вольфрам, L; Bauerfeind, P (март 2002 г.). «Консервативные никель-связывающие аминокислоты с низким сродством необходимы для функции никельпермеазы NixA Helicobacter pylori". J. Bacteriol. 184 (5): 1438–43. Дои:10.1128 / JB.184.5.1438-1443.2002. ЧВК 134868. PMID 11844775.
- ^ Yu, Y; Чжоу, М; Кирш, Ф; Сюй, С; Чжан, Л; Ван, Y; Цзян, З; Wang, N; Ли, Дж; Эйтингер, Т; Ян, М. (24 декабря 2013 г.). «Планарный сайт связывания субстрата определяет специфичность переносчиков никеля / кобальта типа ECF». Клеточные исследования. 24 (3): 267–277. Дои:10.1038 / cr.2013.172. ЧВК 3945884. PMID 24366337.
дальнейшее чтение
- Дэн, X; Он, Дж; Он, N (февраль 2013 г.). «Сравнительное исследование Ni (2 +) - аффинного транспорта никель / кобальтовых пермеаз (NiCoTs) и потенциала рекомбинантной Escherichia coli для биоаккумуляции Ni (2+)». Биоресурсы. Technol. 130: 69–74. Дои:10.1016 / j.biortech.2012.11.133. PMID 23306112.
- Родионов Д; Hebbeln, P; Гельфанд, М; Эйтингер, Т. (январь 2006 г.). «Сравнительный и функциональный геномный анализ прокариотических переносчиков захвата никеля и кобальта: данные о новой группе АТФ-связывающих кассетных переносчиков». J. Bacteriol. 188 (1): 317–327. Дои:10.1128 / JB.188.1.317-327.2006. ЧВК 1317602. PMID 16352848.
 | Этот мембранный белок –Связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |